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  1. Beulé T., Agbessi M. D. T., Dussert Stéphane, Jaligot E., Guyot Romain. Genome-wide analysis of LTR-retrotransposons in oil palm. Bmc Genomics, 2015, 16, p. art. 795. ISSN 1471-2164

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    Web of Science  WOS:000362866100004
  2. Bourgis Fabienne, Guyot Romain, Gherbi Hassen, Tailliez E., Amabile Isabelle, Salse J., Lorieux Mathias, Delseny M., Ghesquiere Alain. Characterization of the major fragance gene from an aromatic japonica rice and analysis of its diversity in Asian cultivated rice. Theoretical and Applied Genetics, 2008, 117 (3), p. 353-368. ISSN 0040-5752

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    Web of Science  WOS:000257585200006
  3. Breitler J. C., Dechamp E., Campa Claudine, Rodrigues L. A. Z., Guyot Romain, Marraccini P., Etienne H. CRISPR/Cas9-mediated efficient targeted mutagenesis has the potential to accelerate the domestication of Coffea canephora. Plant Cell Tissue and Organ Culture, 2018, 134 (3), p. 383-394. ISSN 0167-6857

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    Web of Science  WOS:000441559700004
  4. Chaparro C., Gayraud T., Souza R.F. de, Domingues D.S., Akaffou S., Laforga Vanzela A.L., Kochko Alexandre de, Rigoreau M., Crouzillat D., Hamon Serge, Hamon Perla, Guyot Romain. Terminal-repeat retrotransposons with GAG domain in plant genomes : a new testimony on the complex world of transposable elements. Genome Biology and Evolution, 2015, 7 (2), p. 493-504. ISSN 1759-6653

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    Web of Science  WOS:000351607800007
  5. Chaparro C., Guyot Romain, Zuccolo A., Piegu B., Panaud O. RetrOryza: a database of the rice LTR-retrotransposons. Nucleic Acids Research, 2007, 35 (Database issue), p. D66-D70. ISSN 0305-1048

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    Web of Science  WOS:000243494600015
  6. Charr J. C., Garavito A., Guyeux C., Crouzillat D., Descombes P., Fournier C., Ly S. N., Raharimalala E. N., Rakotomalala J. J., Stoffelen P., Janssens S., Hamon Perla, Guyot Romain. Complex evolutionary history of coffees revealed by full plastid genomes and 28,800 nuclear SNP analyses, with particular emphasis on Coffea canephora (Robusta coffee). Molecular Phylogenetics and Evolution, 2020, 151, p. 106906 [13 p.]. ISSN 1055-7903

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    Web of Science  WOS:000557888700004
  7. de Castro Nunes R., Orozco-Arias S., Crouzillat D., Mueller L. A., Strickler S. R., Descombes P., Fournier C., Moine D., Kochko Alexandre de, Yuyama P. M., Vanzela A. L. L., Guyot Romain. Structure and distribution of centromeric retrotransposons at diploid and allotetraploid Coffea centromeric and pericentromeric regions. Frontiers in Plant Science, 2018, 9, p. art. 175 [14p.]. ISSN 1664-462X

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    Web of Science  WOS:000425097700001
  8. Denoeud F., Carretero-Paulet L., Dereeper Alexis, Droc G., Guyot Romain, Pietrella M., Zheng C. F., Alberti A., Anthony François, Aprea G., Aury J. M., Bento P., Bernard M., Bocs S., Campa Claudine, Cenci Alberto, Combes Marie-Christine, Crouzillat D., Da Silva C., Daddiego L., De Bellis F., Dussert Stéphane, Garsmeur O., Gayraud T., Guignon V., Jahn K., Jamilloux V., Joët Thierry, Labadie K., Lan T. Y., Leclercq J., Lepelley M., Leroy T., Li L. T., Librado P., Lopez L., Munoz A., Noel B., Pallavicini A., Perrotta G., Poncet Valérie, Pot D., Priyono, Rigoreau M., Rouard M., Rozas J., Dubreuil Tranchant Christine, Van Buren R., Zhang Q., Andrade A. C., Argout X., Bertrand B., Kochko Alexandre de, Graziosi G., Henry R. J., Jayarama, Ming R., Nagai C., Rounsley S., Sankoff D., Giuliano G., Albert V. A., Wincker P., Lashermes Philippe. The coffee genome provides insight into the convergent evolution of caffeine biosynthesis. Science, 2014, 345 (6201), p. 1181-1184. ISSN 0036-8075

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    Web of Science  WOS:000341179800047
  9. Dereeper Alexis, Guyot Romain, Dubreuil Tranchant Christine, Anthony François, Argout X., de Bellis F., Combes Marie-Christine, Gavory F., Kochko Alexandre de, Kudrna D., Leroy T., Poulain J., Rondeau M., Song X., Wing R., Lashermes Philippe. BAC-end sequences analysis provides first insights into coffee (Coffea canephora P.) genome composition and evolution. Plant Molecular Biology, 2013, 83 (3), p. 177-189. ISSN 0167-4412

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    Web of Science  WOS:000324652600002
  10. dos Santos T. B., Soares J. D. M., Lima J. E., Silva J. C., Ivamoto S. T., Baba V. Y., Souza S. G. H., Lorenzetti A. P. R., Paschoal A. R., Meda A. R., Nishiyama M. Y., de Oliveira U. C., Mokochinski J. B., Guyot Romain, Junqueira-de-Azevedo I. L. M., Figueira A. V. O., Mazzafera P., Junior O. R., Vieira L. G. E., Pereira L. F. P., Domingues D. S. An integrated analysis of mRNA and sRNA transcriptional profiles in Coffea arabica L. roots: insights on nitrogen starvation responses. Functional and Integrative Genomics, 2019, 19 (1), p. 151-169. ISSN 1438-793X

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    Web of Science  WOS:000454564300011
  11. Dupeyron M., de Souza R. F., Hamon Perla, Kochko Alexandre de, Crouzillat D., Couturon Emmanuel, Domingues D. S., Guyot Romain. Distribution of Divo in Coffea genomes, a poorly described family of angiosperm LTR-Retrotransposons. Molecular Genetics and Genomics, 2017, 292 (4), p. 741-754. ISSN 1617-4615

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    Web of Science  WOS:000405521400003
  12. Garavito A., Guyot Romain, Lozano J., Gavory F., Samain S., Panaud Olivier, Tohme J., Ghesquière Alain, Lorieux Mathias. A genetic model for the female sterility barrier between Asian and African cultivated rice species. Genetics, 2010, 185 (4), p. 1425-1440. ISSN 0016-6731

    Identifiant IRD PAR00006216 Lien chez l'éditeur
    Web of Science  WOS:000281907700024
  13. Garavito A., Montagnon C., Guyot Romain, Bertrand B. Identification by the DArTseq method of the genetic origin of the Coffea canephora cultivated in Vietnam and Mexico. BMC Plant Biology, 2016, 16, p. art. 242 [12 p.]. ISSN 1471-2229

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    Web of Science  WOS:000387084800003
  14. Guyeux C., Charr J. C., Tran H. T. M., Furtado A., Henry R. J., Crouzillat D., Guyot Romain, Hamon Perla. Evaluation of chloroplast genome annotation tools and application to analysis of the evolution of coffee species. PLOS One, 2019, 14 (6), p. e0216347 [20 p.]. ISSN 1932-6203

    Identifiant IRD fdi:010076131 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000471234500010
  15. Guyot Romain, Darre T., Dupeyron M., Kochko Alexandre de, Hamon Serge, Couturon Emmanuel, Crouzillat D., Rigoreau M., Rakotomalala J. J., Raharimalala N. E., Akaffou S. D., Hamon Perla. Partial sequencing reveals the transposable element composition of Coffea genomes and provides evidence for distinct evolutionary stories. Molecular Genetics and Genomics, 2016, 291 (5), p. 1979-1990. ISSN 1617-4615

    Identifiant IRD fdi:010068137 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000382145100014
  16. Guyot Romain, De la Mare Marion, Viader Véronique, Hamon Perla, Coriton O., Bustamante Porras José, Poncet Valérie, Campa Claudine, Hamon Serge, Kochko Alexandre de. Microcollinearity in an ethylene receptor coding gene region of the Coffea canephora genome is extensively conserved with Vitis vinifera and other distant dicotyledonous sequenced genomes. Bmc Plant Biology, 2009, 9, 22 ISSN 1471-2229

    Identifiant IRD fdi:010044336 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000264251200001
  17. Guyot Romain, Garavito Andrea, Gavory F., Samain S., Tohme J., Ghesquière Alain, Lorieux Mathias. Patterns of sequence divergence and evolution of the S-1 orthologous regions between Asian and African cultivated rice species. Plos One, 2011, 6 (3), p. e17726. ISSN 1932-6203

    Identifiant IRD fdi:010053390 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000288219100030
  18. Guyot Romain, Hamon Perla, Couturon Emmanuel, Raharimalala N., Rakotomalala J. J., Lakkanna S., Sabatier S., Affouard A., Bonnet P. WCSdb : a database of wild Coffea species [Data paper]. Database, 2020, p. baaa069 [6 p.]. ISSN 1758-0463

    Identifiant IRD fdi:010080466 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000597220900001
  19. Guyot Romain, Lefebvre-Pautigny F., Dubreuil Tranchant Christine, Rigoreau M., Hamon Perla, Leroy T., Hamon Serge, Poncet Valérie, Crouzillat D., Kochko Alexandre de. Ancestral synteny shared between distantly-related plant species from the asterid (Coffea canephora and Solanum Sp.) and rosid (Vitis vinifera) clades. Bmc Genomics, 2012, 13, p. 103. ISSN 1471-2164

    Identifiant IRD fdi:010055958 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000305181600001
  20. Hamon Perla, Duroy Pierre-Olivier, Dubreuil Tranchant Christine, Mafra D'Almeida Costa Paulo, Duret Caroline, Razafinarivo Norosoa, Couturon Emmanuel, Hamon Serge, Kochko Alexandre de, Poncet Valérie, Guyot Romain. Two novel Ty1-copia retrotransposons isolated from coffee trees can effectively reveal evolutionary relationships in the Coffea genus (Rubiaceae). Molecular Genetics and Genomics, 2011, 285 (6), p. 447-460. ISSN 1617-4615

    Identifiant IRD fdi:010053575 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000291040300002
  21. Hufnagel B., Marques A., Soriano A., Marques L., Divol F., Doumas P., Sallet E., Mancinotti D., Carrere S., Marande W., Arribat S., Keller J., Huneau C., Blein T., Aime D., Laguerre M., Taylor J., Schubert V., Nelson M., Geu-Flores F., Crespi M., Gallardo K., Delaux P. M., Salse J., Berges H., Guyot Romain, Gouzy J., Peret B. High-quality genome sequence of white lupin provides insight into soil exploration and seed quality. Nature Communications, 2020, 11 (1), p. art. 492 [12 p.]. ISSN 2041-1723

    Identifiant IRD fdi:010079158 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000543967000015
  22. Kochko Alexandre de, Akaffou S., Andrade A.C., Campa Claudine, Crouzillat D., Guyot Romain, Hamon Perla, Ming Ray, Mueller L.A., Poncet Valérie, Tranchant Dubreuil Christine, Hamon Serge. Advances in Coffea genomics. In : Kader J.C. (ed.), Delseny M. (ed.) Advances in botanical research. Advances in Botanical Research, 2010, 53, p. 23-63. ISBN 978-0-12-380872-1

    Identifiant IRD fdi:010049775 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000277633000002
  23. Konan J. A., Guyot Romain, Koffi K. K., Vroh-Bi I., Zoro A. I. B. Molecular confirmation of varietal status in bottle gourd (Lagenaria siceraria) using genotyping-by-sequencing. Genome, 2020, 63 (11), p. 535-545. ISSN 0831-2796

    Identifiant IRD fdi:010079962 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000586846000003
  24. Landey R. B., Cenci Alberto, Guyot Romain, Bertrand B., Georget F., Dechamp E., Herrera J. C., Aribi Jamel, Lashermes Philippe, Etienne H. Assessment of genetic and epigenetic changes during cell culture ageing and relations with somaclonal variation in Coffea arabica. Plant Cell Tissue and Organ Culture, 2015, 122 (3), p. 517-531. ISSN 0167-6857

    Identifiant IRD fdi:010064917 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000359415000001
  25. Lemos S. M. C., Foncatti L. F. C., Guyot Romain, Paschoal A. R., Domingues D. S. Genome-wide screening and characterization of non-coding RNAs in Coffea canephora. Non-Coding RNA, 2020, 6 (3), p. 39 [15p.].

    Identifiant IRD fdi:010079866 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000578912600001
  26. Ly S. N., Garavito A., De Block P., Asselman P., Guyeux C., Charr J. C., Janssens S., Mouly A., Hamon Perla, Guyot Romain. Chloroplast genomes of Rubiaceae : comparative genomics and molecular phylogeny in subfamily Ixoroideae. PLoS One, 2020, 15 (4), p. art. e0232295 [21 p.]. ISSN 1932-6203

    Identifiant IRD fdi:010078132 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000536673200071
  27. Ming R., VanBuren R., Wai C. M., Tang H. B., Schatz M. C., Bowers J. E., Lyons E., Wang M. L., Chen J., Biggers E., Zhang J. S., Huang L. X., Zhang L. M., Miao W. J., Zhang J., Ye Z. Y., Miao C. Y., Lin Z. C., Wang H., Zhou H. Y., Yim W. C., Priest H. D., Zheng C. F., Woodhouse M., Edger P. P., Guyot Romain, Guo H. B., Guo H., Zheng G. Y., Singh R., Sharma A., Min X. J., Zheng Y., Lee H., Gurtowski J., Sedlazeck F. J., Harkess A., McKain M. R., Liao Z. Y., Fang J. P., Liu J., Zhang X. D., Zhang Q., Hu W. C., Qin Y., Wang K., Chen L. Y., Shirley N., Lin Y. R., Liu L. Y., Hernandez A. G., Wright C. L., Bulone V., Tuskan G. A., Heath K., Zee F., Moore P. H., Sunkar R., Leebens-Mack J. H., Mockler T., Bennetzen J. L., Freeling M., Sankoff D., Paterson A. H., Zhu X. G., Yang X. H., Smith J. A. C., Cushman J. C., Paull R. E., Yu Q. Y. The pineapple genome and the evolution of CAM photosynthesis. Nature Genetics, 2015, 47 (12), p. 1435-1442 + 3 p. d'annexes : online methods. ISSN 1061-4036

    Identifiant IRD fdi:010065534 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000365813200015
  28. Ming R., Wai C. M., Guyot Romain. Pineapple genome : a reference for monocots and CAM photosynthesis. Trends in Genetics, 2016, 32 (11), p. 690-696. ISSN 0168-9525

    Identifiant IRD fdi:010068676 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000386739200003
  29. Orozco-Arias S., Isaza G., Guyot Romain, Tabares-Soto R. A systematic review of the application of machine learning in the detection and classification of transposable elements. PeerJ, 2019, 7, p. e8311 [29 p.]. ISSN 2167-8359

    Identifiant IRD fdi:010077475 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000503384400008
  30. Orozco-Arias S., Isaza G., Guyot Romain. Retrotransposons in plant genomes : structure, identification, and classification through bioinformatics and machine learning. International Journal of Molecular Sciences, 2019, 20 (15), p. art. 3837 [31 p.]. ISSN 1661-6596

    Identifiant IRD fdi:010076634 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000482383000230
  31. Orozco-Arias S., Jaimes P. A., Candamil M. S., Jimenez-Varon C. F., Tabares-Soto R., Isaza G., Guyot Romain. InpactorDB : a classified lineage-level plant LTR retrotransposon reference library for free-alignment methods based on machine learning. Genes, 2021, 12 (2), p. 190 [17 p.].

    Identifiant IRD fdi:010081058 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000622560500001
  32. Orozco-Arias S., Pina J. S., Tabares-Soto R., Castillo-Ossa L. F., Guyot Romain, Isaza G. Measuring performance metrics of machine learning algorithms for detecting and classifying transposable elements. Processes, 2020, 8 (6), p. art. 638 [18p.].

    Identifiant IRD fdi:010079425 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000551243700001
  33. Orozco-Arias S., Tobon-Orozco N., Pina J. S., Jimenez-Varon C. F., Tabares-Soto R., Guyot Romain. TIP_finder : an HPC software to detect transposable element insertion polymorphisms in large genomic datasets. Biology, 2020, 9 (9), p. 281 [17 p.].

    Identifiant IRD fdi:010079857 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000580012300001
  34. Piegu B., Guyot Romain, Picault N., Roulin A., Saniyal A., Kim H., Collura K., Brar D.S., Jackson S., Wing R.A., Panaud O. Doubling genome size without polyploidization : dynamics of retrotransposition-driven genomic expansions in Oryza australiensis, a wild relative of rice. Genome Research, 2006, 16 (10), p. 1262-1269. ISSN 1088-9051

    Identifiant IRD fdi:010037666 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000240959800010
  35. Qin G. H., Xu C. Y., Ming R., Tang H. B., Guyot Romain, Kramer E. M., Hu Y. D., Yi X. K., Qi Y. J., Xu X. Y., Gao Z. H., Pan H. F., Jian J. B., Tian Y. P., Yue Z., Xu Y. L. The pomegranate (Punica granatum L.) genome and the genomics of punicalagin biosynthesis. Plant Journal, 2017, 91 (6), p. 1108-1128. ISSN 0960-7412

    Identifiant IRD fdi:010070961 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000408816000012
  36. Razafinarivo Norosoa, Guyot Romain, Davis A.P., Couturon Emmanuel, Hamon Serge, Crouzillat D., Rigoreau M., Dubreuil Tranchant Christine, Poncet Valérie, Kochko Alexandre de, Rakotomalala J. J., Hamon Perla. Genetic structure and diversity of coffee (Coffea) across Africa and the Indian Ocean islands revealed using microsatellites [plus supplementary data]. Annals of Botany, 2013, 111 (2), p. 229-248 [+ supplementary data : 5 p.]. ISSN 0305-7364

    Identifiant IRD fdi:010058979 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000314057400007
  37. Razafinarivo Norosoa, Rakotomalala J.J., Brown S.C., Bourge M., Hamon Serge, Kochko Alexandre de, Poncet Valérie, Dubreuil Tranchant Christine, Couturon Emmanuel, Guyot Romain, Hamon Perla. Geographical gradients in the genome size variation of wild coffee trees (Coffea) native to Africa and Indian Ocean islands. Tree Genetics and Genomes, 2012, 8 (6), p. 1345-1358. ISSN 1614-2942

    Identifiant IRD fdi:010058168 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000311315900015
  38. Rimlinger A., Raharimalala N., Letort V., Rakotomalala J. J., Crouzillat D., Guyot Romain, Hamon Perla, Sabatier S. Phenotypic diversity assessment within a major ex situ collection of wild endemic coffees in Madagascar. Annals of Botany, 2020, 126 (5), p. 849-863. ISSN 0305-7364

    Identifiant IRD fdi:010080405 En libre accès sur HAL Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000591875200006
  39. Rocha D. M., Marques A., Andrade Cgtj, Guyot Romain, Chaluvadi S. R., Pedrosa-Harand A., Houben A., Bennetzen J. L., Vanzela A. L. L. Developmental programmed cell death during asymmetric microsporogenesis in holocentric species of Rhynchospora (Cyperaceae). Journal of Experimental Botany, 2016, 67 (18), p. 5391-5401. ISSN 0022-0957

    Identifiant IRD fdi:010068282 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000386067000011
  40. Roncal J., Guyot Romain, Hamon Perla, Crouzillat D., Rigoreau M., Konan O. N., Rakotomalala J. J., Nowak M. D., Davis A. P., Kochko Alexandre de. Active transposable elements recover species boundaries and geographic structure in Madagascan coffee species. Molecular Genetics and Genomics, 2016, 291 (1), p. 155-168. ISSN 1617-4615

    Identifiant IRD fdi:010066167 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000369008300012
  41. Sant'Ana G. C., Pereira L. F. P., Pot D., Ivamoto S. T., Domingues D. S., Ferreira R. V., Pagiatto N. F., da Silva B. S. R., Nogueira L. M., Kitzberger C. S. G., Scholz M. B. S., de Oliveira F. F., Sera G. H., Padilha L., Labouisse J. P., Guyot Romain, Charmetant P., Leroy T. Genome-wide association study reveals candidate genes influencing lipids and diterpenes contents in Coffea arabica L. Scientific Reports - Nature, 2018, 8, p. art. 465 [ 12 p.]. ISSN 2045-2322

    Identifiant IRD fdi:010072002 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
    Web of Science  WOS:000419941000006
  42. Santos F. C., Guyot Romain, do Valle C. B., Chiari L., Techio V. H., Heslop-Harrison P., Vanzela A. L. L. Chromosomal distribution and evolution of abundant retrotransposons in plants : gypsy elements in diploid and polyploid Brachiaria forage grasses. Chromosome Research, 2015, 23 (3), p. 571-582. ISSN 0967-3849

    Identifiant IRD fdi:010065489 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
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  43. Silva Dias Elaine, Hatt Clémence, Hamon Perla, Hamon Serge, Rigoreau M., Crouzillat D., Carareto C.M.A., Kochko Alexandre de, Guyot Romain. Large distribution and high sequence identity of a Copia‑type retrotransposon in angiosperm families. Plant Molecular Biology, 2015, 89 (1-2), p. 83-97. ISSN 0167-4412

    Identifiant IRD fdi:010064998 Lien chez l'éditeur En libre accès sur HAL Accès réservé (Intranet IRD)
    Web of Science  WOS:000361530700006
  44. Soto-Suarez Mauricio, Bernal D., Gonzalez Carolina, Szurek Boris, Guyot Romain, Tohme J., Verdier Valérie. In planta gene expression analysis of Xanthomonas oryzae pathovar oryzae, African strain MAI1. Bmc Microbiology, 2010, 10, p. 170. ISSN 1471-2180

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    Web of Science  WOS:000279929700001
  45. VanBuren R., Zeng F. C., Chen C. X., Zhang J. S., Wai C. M., Han J., Aryal R., Gschwend A. R., Wang J. P., Na J. K., Huang L. X., Zhang L. M., Miao W. J., Gou J. Q., Arro J., Guyot Romain, Moore R. C., Wang M. L., Zee F., Charlesworth D., Moore P. H., Yu Q. Y., Ming R. Origin and domestication of papaya Y-h chromosome. Genome Research, 2015, 25 (4), p. 524-533. ISSN 1088-9051

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    Web of Science  WOS:000352139200007
  46. Wu S. Y., Guyot Romain, Bocs S., Droc G., Oktavia F., Hu S. N., Tang C. R., Montoro P., Leclercq J. Structural and functional annotation of transposable elements revealed a potential regulation of genes involved in rubber biosynthesis by TE-derived siRNA interference in Hevea brasiliensis. International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (12), 4220 [21 p.]

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    Web of Science  WOS:000549448100001
  47. Yu Q.Y., Guyot Romain, Kochko Alexandre de, Byers A., Navajas-Perez R., Langston B.J., Dubreuil Tranchant Christine, Paterson A.H., Poncet Valérie, Nagai C., Ming R. Micro-collinearity and genome evolution in the vicinity of an ethylene receptor gene of cultivated diploid and allotetraploid coffee species (Coffea). Plant Journal, 2011, 67 (2), p. 305-317. ISSN 0960-7412

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    Web of Science  WOS:000292700900010

Articles

  1. Dubreuil Tranchant Christine, Guyot Romain, Guellim Amira, Duret Caroline, Mare Marion de la, Razafinarivo Norosoa, Poncet Valérie, Hamon Serge, Hamon Perla, Kochko Alexandre de. Site-specific insertion polymorphism of the MITE Alex-1 in the genus Coffea suggests interspecific gene flow. International Journal of Evolutionnary Biology, 2011, 2011 (ID 358412), 9 p.

    Identifiant IRD fdi:010052679 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF
  2. Hamon Perla, Grover C.E., Davis A.P., Rakotomalala J.J., Raharimalala N.E., Albert V.A., Sreenath H.L., Mitchell S.E., Couturon Emmanuel, Hamon Serge, Kochko Alexandre de, Crouzillat D., Rigoreau M., Sumirat U., Akaffou S., Guyot Romain. Genotyping-by-sequencing provides the first well-resolved phylogeny for coffee (Coffea) and insights into the evolution of caffeine content in its species : GBS coffee phylogeny and the evolution of caffeine content. Molecular Phylogenetics and Evolution, 2017, 109, p. 351-361. ISSN 1055-7903

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Ouvrages

  1. Couturon Emmanuel, Raharimalala N.E., Rakotomalala J.J., Hamon Serge, Kochko Alexandre de, Guyot Romain, Hamon Perla. Caféiers sauvages : un trésor en péril au coeur des forêts tropicales ! = Wild coffee-trees : a threatened treasure in the heart of tropical forests !. Montpellier : Association Biodiversité, Ecovalorisation et Caféiers, 2016, 117 p. ISBN 978-2-7466-9109-4

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Chapitres ou parties d'ouvrages

  1. Hamon Perla, Hamon Serge, Razafinarivo Norosoa J., Guyot Romain, Siljak-Yakovlev S., Couturon Emmanuel, Crouzillat D., Rigoreau M., Akaffou S., Rakotomalala J.J., Kochko Alexandre de. Coffea genome organization and evolution. In : Preedy V. (ed.) Coffee in health and disease prevention. San Diego : Academic Press, 2015, p. 29-37. ISBN 978-0-12-409517-5

    Identifiant IRD fdi:010063204 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
  2. Hamon Perla, Rakotomalala J.J., Akaffou S., Razafinarivo Norosoa J., Couturon Emmanuel, Guyot Romain, Crouzillat D., Hamon Serge, Kochko Alexandre de. Caffeine-free species in the genus Coffea. In : Preedy V. (ed.) Coffee in health and disease prevention. San Diego : Academic Press, 2015, p. 39-44. ISBN 978-0-12-409517-5

    Identifiant IRD fdi:010063205 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)
  3. Kochko Alexandre de, Hamon Serge, Guyot Romain, Couturon Emmanuel, Poncet Valérie, Dubreuil Tranchant Christine, Crouzillat D., Rigoreau M., Hamon Perla. Omics applications : Coffee. In : Chowdappa P. (ed.), Karun A. (ed.), Rajesh M.K. (ed.), Ramesh S.V. (ed.) Biotechnology of plantation crops. New Delhi : Daya Publishing House, 2017, p. 589-606. ISBN 9789386071729

    Identifiant IRD fdi:010069162 Accès réservé (Intranet IRD)
  4. Lorieux Mathias, Garavito Andrea, Bouniol Julie, Gutierrez A., Ndjiondjop M.N., Guyot Romain, Pompilio Martinez C., Tohme J., Ghesquière Alain. Unlocking the Oryza glaberrima treasure for rice breeding in Africa. In : Wopereis M.C.S. (ed.), Johnson D.E. (ed.), Ahmadi N. (ed.), Tollens E. (ed.), Jalloh A. (ed.) Realizing Africa's rice promise. Wallingford : CABI, 2013, p. 130-143. Realizing Africa's Rice Promise, 3., Yaoundé (CMR), 2013/10.

    Identifiant IRD fdi:010061552 Accès réservé (Intranet IRD)
  5. Mueller L., Strickler S., Domingues D., Pereira L., Andrade A., Marraccini P., Ming R., Wai J., Albert V., Giuliano G., Fiore A., Pietrella M., Aprea G., Descombes P., Moine D., Guyot Romain, Poncet Valérie, Hamon Perla, Hamon Serge, Dubreuil Tranchant Christine, Couturon Emmanuel, Kochko Alexandre de, Lepelley M., Bellanger L., Merot-L'Anthoene V., Vandecasteele C., Rigoreau M., Crouzillat D., Paschoal Rossi A., Sankoff D., Zheng C., Kuhn G., Korlach J., Chin J. Towards a better understanding of the Coffea arabica genome structure. In : Proceedings of the 25th international conference on coffee science. ASIC, 2015, p 42-45. International Conference on Coffe Science, 25., Armenia (COL), 2015/09/08-13. ISBN 978-2-900212-24-0

    Identifiant IRD fdi:010065067 Accès réservé (Intranet IRD)
  6. Razafinarivo Norosoa Josiane, Brown S., Bourge M., Davis A.P., Hamon Serge, Couturon Emmanuel, Kochko Alexandre de, Dubreuil Tranchant Christine, Guyot Romain, Poncet Valérie, Crouzillat D., Rigoreau M., Rakatomalala J.J., Hamon Perla. Coffea L. genome size and genetic diversity using nuclear microsatellite markers across Africa and the Indian Ocean Islands. In : Proceedings of the 24th international conference on coffee science. San José : ASIC, 2013, p. 569-575. International Conference on Coffee Science, 24., San José (CRI), 2012/11/11-16. ISBN 978-2-900212-23-3

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Colloques, congrès, séminaires

  1. Guyot Romain, Lefevre-Pautigny F., Tranchant Christine, Rigoreau M., Poncet Valérie, Hamon Perla, Leroy T., Hamon Serge, Crouzillat D., Kochko Alexandre de. Ancestral synteny is shared between distantly related plant species from the asterid and rosid clades. In : International conference on coffe science. Paris : ASIC, 2012, p. 527-532. International Conference on Coffe Science, 24., San José (Costa Rica), 2012/11/12-16.

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