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Janssens S. B., Couvreur Thomas, Mertens A., Dauby Gilles, Dagallier Lpmj, Vanden Abeele S., Vandelook F., Mascarello M., Beeckman H., Sosef M., Droissart Vincent, van der Bank M., Maurin O., Hawthorne W., Marshall C., Réjou-Méchain Maxime, Beina D., Baya F., Merckx V., Verstraete B., Hardy O. (2020). A large-scale species level dated angiosperm phylogeny for evolutionary and ecological analyses. Biodiversity Data Journal, 8, art. E39677 [23 p.] ISSN 1314-2836

Fichier PDF disponiblehttp://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers20-02/010077840.pdf[ PDF Link ]

Lien direct chez l'éditeur doi:10.3897/BDJ.8.e39677

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Titre
A large-scale species level dated angiosperm phylogeny for evolutionary and ecological analyses
Année de publication2020
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000509558100001
AuteursJanssens S. B., Couvreur Thomas, Mertens A., Dauby Gilles, Dagallier Lpmj, Vanden Abeele S., Vandelook F., Mascarello M., Beeckman H., Sosef M., Droissart Vincent, van der Bank M., Maurin O., Hawthorne W., Marshall C., Réjou-Méchain Maxime, Beina D., Baya F., Merckx V., Verstraete B., Hardy O.
SourceBiodiversity Data Journal, 2020, 8, art. E39677 [23 p.] ISSN 1314-2836
RésuméPhylogenies are a central and indispensable tool for evolutionary and ecological research. Even though most angiosperm families are well investigated from a phylogenetic point of view, there are far less possibilities to carry out large-scale meta-analyses at order level or higher. Here, we reconstructed a large-scale dated phylogeny including nearly 1/8th of all angiosperm species, based on two plastid barcoding genes, matK (incl. trnK) and rbcL. Novel sequences were generated for several species, while the rest of the data were mined from GenBank. The resulting tree was dated using 56 angiosperm fossils as calibration points. The resulting megaphylogeny is one of the largest dated phylogenetic tree of angiosperms yet, consisting of 36,101 sampled species, representing 8,399 genera, 426 families and all orders. This novel framework will be useful for investigating different broad scale research questions in ecological and evolutionary biology.
Plan de classementSciences du monde végétal [076]
LocalisationFonds IRD [F B010077840]
Identifiant IRDfdi:010077840
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010077840

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