Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

 

Publications des scientifiques de l'IRD

Selby P., Abbeloos R., Backlund J. E., Salido M. B., Bauchet G., Benites-Alfaro O. E., Birkett C., Calaminos V. C., Carceller P., Cornut G., Costa B. V., Edwards J. D., Finkers R., Gao S. Y., Ghaffar M., Glaser P., Guignon V., Hok P., Kilian A., Koenig P., Lagare J. E. B., Lange M., Laporte M. A., Larmande Pierre, LeBauer D. S., Lyon D. A., Marshall D. S., Matthews D., Milne I., Mistry N., Morales N., Mueller L. A., Neveu P., Papoutsoglou E., Pearce B., Perez-Masias I., Pommier C., Ramirez-Gonzalez R. H., Rathore A., Raquel A. M., Raubach S., Rife T., Robbins K., Rouard M., Sarma C., Scholz U., Sempere G., Shaw P. D., Simon R., Soldevilla N., Stephen G., Sun Q., Tovar C., Uszynski G., Verouden M., BrAPI consortium. (2019). BrAPI-an application programming interface for plant breeding applications. Bioinformatics, 35 (20), 4147-4155. ISSN 1367-4803

Fichier PDF disponiblehttp://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers19-12/010077403.pdf[ PDF Link ]

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1093/bioinformatics/btz190

Titre
BrAPI-an application programming interface for plant breeding applications
Année de publication2019
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000499323200033
AuteursSelby P., Abbeloos R., Backlund J. E., Salido M. B., Bauchet G., Benites-Alfaro O. E., Birkett C., Calaminos V. C., Carceller P., Cornut G., Costa B. V., Edwards J. D., Finkers R., Gao S. Y., Ghaffar M., Glaser P., Guignon V., Hok P., Kilian A., Koenig P., Lagare J. E. B., Lange M., Laporte M. A., Larmande Pierre, LeBauer D. S., Lyon D. A., Marshall D. S., Matthews D., Milne I., Mistry N., Morales N., Mueller L. A., Neveu P., Papoutsoglou E., Pearce B., Perez-Masias I., Pommier C., Ramirez-Gonzalez R. H., Rathore A., Raquel A. M., Raubach S., Rife T., Robbins K., Rouard M., Sarma C., Scholz U., Sempere G., Shaw P. D., Simon R., Soldevilla N., Stephen G., Sun Q., Tovar C., Uszynski G., Verouden M., BrAPI consortium.
SourceBioinformatics, 2019, 35 (20), p. 4147-4155. ISSN 1367-4803
RésuméMotivation: Modern genomic breeding methods rely heavily on very large amounts of phenotyping and genotyping data, presenting new challenges in effective data management and integration. Recently, the size and complexity of datasets have increased significantly, with the result that data are often stored on multiple systems. As analyses of interest increasingly require aggregation of datasets from diverse sources, data exchange between disparate systems becomes a challenge. Results: To facilitate interoperability among breeding applications, we present the public plant Breeding Application Programming Interface (BrAPI). BrAPI is a standardized web service API specification. The development of BrAPI is a collaborative, community-based initiative involving a growing global community of over a hundred participants representing several dozen institutions and companies. Development of such a standard is recognized as critical to a number of important large breeding system initiatives as a foundational technology. The focus of the first version of the API is on providing services for connecting systems and retrieving basic breeding data including germplasm, study, observation, and marker data. A number of BrAPI-enabled applications, termed BrAPPs, have been written, that take advantage of the emerging support of BrAPI by many databases.
Plan de classementSciences du monde végétal [076] ; Informatique [122] ; Sciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020]
LocalisationFonds IRD [F B010077403]
Identifiant IRDfdi:010077403
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010077403

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


* PDF Link :

    à télécharger pour citer/partager ce document sur les réseaux sociaux académiques


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Cayenne

Nouméa

Papeete

Abidjan

Dakar

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito