Selby P. auteur aut IRD Abbeloos R. auteur aut IRD Backlund J. E. auteur aut IRD Salido M. B. auteur aut IRD Bauchet G. auteur aut IRD Benites-Alfaro O. E. auteur aut IRD Birkett C. auteur aut IRD Calaminos V. C. auteur aut IRD Carceller P. auteur aut IRD Cornut G. auteur aut IRD Costa B. V. auteur aut IRD Edwards J. D. auteur aut IRD Finkers R. auteur aut IRD Gao S. Y. auteur aut IRD Ghaffar M. auteur aut IRD Glaser P. auteur aut IRD Guignon V. auteur aut IRD Hok P. auteur aut IRD Kilian A. auteur aut IRD Koenig P. auteur aut IRD Lagare J. E. B. auteur aut IRD Lange M. auteur aut IRD Laporte M. A. auteur aut IRD Larmande Pierre auteur aut IRD LeBauer D. S. auteur aut IRD Lyon D. A. auteur aut IRD Marshall D. S. auteur aut IRD Matthews D. auteur aut IRD Milne I. auteur aut IRD Mistry N. auteur aut IRD Morales N. auteur aut IRD Mueller L. A. auteur aut IRD Neveu P. auteur aut IRD Papoutsoglou E. auteur aut IRD Pearce B. auteur aut IRD Perez-Masias I. auteur aut IRD Pommier C. auteur aut IRD Ramirez-Gonzalez R. H. auteur aut IRD Rathore A. auteur aut IRD Raquel A. M. auteur aut IRD Raubach S. auteur aut IRD Rife T. auteur aut IRD Robbins K. auteur aut IRD Rouard M. auteur aut IRD Sarma C. auteur aut IRD Scholz U. auteur aut IRD Sempere G. auteur aut IRD Shaw P. D. auteur aut IRD Simon R. auteur aut IRD Soldevilla N. auteur aut IRD Stephen G. auteur aut IRD Sun Q. auteur aut IRD Tovar C. auteur aut IRD Uszynski G. auteur aut IRD Verouden M. auteur aut IRD BrAPI consortium auteur aut IRD text journalArticle eng text/pdf reformatted digital access Motivation: Modern genomic breeding methods rely heavily on very large amounts of phenotyping and genotyping data, presenting new challenges in effective data management and integration. Recently, the size and complexity of datasets have increased significantly, with the result that data are often stored on multiple systems. As analyses of interest increasingly require aggregation of datasets from diverse sources, data exchange between disparate systems becomes a challenge. Results: To facilitate interoperability among breeding applications, we present the public plant Breeding Application Programming Interface (BrAPI). BrAPI is a standardized web service API specification. The development of BrAPI is a collaborative, community-based initiative involving a growing global community of over a hundred participants representing several dozen institutions and companies. Development of such a standard is recognized as critical to a number of important large breeding system initiatives as a foundational technology. The focus of the first version of the API is on providing services for connecting systems and retrieving basic breeding data including germplasm, study, observation, and marker data. A number of BrAPI-enabled applications, termed BrAPPs, have been written, that take advantage of the emerging support of BrAPI by many databases. specialized 076 122 020 35 20 4147-4155 2019 1367-4803 https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010077403 10.1093/bioinformatics/btz190 1367-4803 [F B010077403] https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010077403 https://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers19-12/010077403.pdf IRD - Base Horizon / Pleins textes 2020-01-07 2025-02-24 fdi:010077403 fre