Publications des scientifiques de l'IRD

Petersen D.J., Zijlstra C., Wishart J., Blok V., Vrain T.C. (1997). Specific probes efficiently distinguish root-knot nematode species using signature sequences in the ribosomal intergenic spacer. Fundamental and Applied Nematology, 20 (6), p. 619-626. ISSN 1164-5571.

Titre du document
Specific probes efficiently distinguish root-knot nematode species using signature sequences in the ribosomal intergenic spacer
Année de publication
1997
Type de document
Article
Auteurs
Petersen D.J., Zijlstra C., Wishart J., Blok V., Vrain T.C.
Source
Fundamental and Applied Nematology, 1997, 20 (6), p. 619-626 ISSN 1164-5571
Ont été établies des sondes moléculaires - destinées à identifier les espèces de Meloidogyne - grâce à des différences spécifiques dans l'espaceur intergénique (IGS) de l'ADN ribosomal. Les séquences de nucléotides de l'IGS ont été obtenues en séquençant l'ADN amplifiée par PCR. L'alignement des séquences de l'IGS de M. chitwoodi et M. fallax a révélé plusieurs régions contenant des différences localisées. Des amorces PCR ont été synthétisées qui ont donné des produits d'amplification spécifiques lorsqu'utilisées avec des produits d'amorce non spécifiques, ont pu être séparés par leur taille dans un gel d'agarose, procurant ainsi un test fiable et précis ne nécessitant pas de restriction enzymatique. L'amplification de l'ADN d'un nématode juvénile ou d'un oeuf par PCR multiplex a permis d'identifier M. chitwoodi et M. fallax et de les séparer de M. hapla, M. javanica, M. arenaria et M. mayaguensis. (Résumé d'auteur)
Plan de classement
Biologie / Physiologie [076RAVPLA04]
Descripteurs
NEMATODE PHYTOPARASITE ; DIVERSITE SPECIFIQUE ; DIAGNOSTIC ; ADN ; METHODE D'ANALYSE
Localisation
Fonds IRD [F A010011815]
Identifiant IRD
fdi:010011815
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