Lashermes Philippe, Combes Marie-Christine, Trouslot Pierre, Charrier A. (1997). Phylogenetic relationships of coffee-tree species (Coffea L.) as inferred from ITS sequences of nuclear ribosomal DNA. Theoretical and Applied Genetics, 94, p. 947-955.
Titre du document
Phylogenetic relationships of coffee-tree species (Coffea L.) as inferred from ITS sequences of nuclear ribosomal DNA
Année de publication
1997
Type de document
Article
Auteurs
Lashermes Philippe, Combes Marie-Christine, Trouslot Pierre, Charrier A.
Source
Theoretical and Applied Genetics, 1997,
94, p. 947-955
Les relations phylogénétiques d'espèces de caféiers (Coffea L.) ont été estimées à partir de la séquence de l'espaceur interne transcrit (ITS 2) de l'ADN ribosomique nucléaire. La région ITS 2 de 37 accessions représentant 26 taxons de Coffea et 3 espèces de Psilanthus a été déterminée par séquençage direct de fragments amplifiés par PCR. Le niveau de variation est suffisamment important pour rendre l'ITS 2 utile à la reconstruction phylogénétique. Cependant, un niveau inhabituel de variation intraspécifique est observé conduisant à certaines difficultés dans l'interprétation des divergences des séquences d'ADNr. Les séquences ont été analysées à la fois par des méthodes cladistique (parcimonie de Wagner) et phénétique (Neighbour-joining distance). Les taxons de caféiers apparaissent répartis entre plusieurs groupes majeurs qui présentent une forte correspondance géographique (i.e. Madagascar, Afrique de l'Est, Afrique Centrale et Afrique de l'Ouest). Cette organisation est bien supportée par les données cytogénétiques. Par contre, les résultats sont en contradiction avec la classification actuelle des caféiers en deux genres, Coffea et Psilanthus. Par ailleurs, l'additivité des types parentaux d'ADNr n'est pas observée chez l'espèce allotétraploïde C. arabica. (Résumé d'auteur)
