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  <dc:title>Phylogenetic relationships of coffee-tree species (Coffea L.) as inferred from ITS sequences of nuclear ribosomal DNA</dc:title>
  <dc:creator>/Lashermes, Philippe</dc:creator>
  <dc:creator>/Combes, Marie-Christine</dc:creator>
  <dc:creator>/Trouslot, Pierre</dc:creator>
  <dc:creator>Charrier, A.</dc:creator>
  <dc:subject>AMELIORATION DES PLANTES</dc:subject>
  <dc:subject>RESSOURCES GENETIQUES</dc:subject>
  <dc:subject>PHYLOGENIE</dc:subject>
  <dc:subject>VARIABILITE GENETIQUE</dc:subject>
  <dc:description>Les relations phylog&#xE9;n&#xE9;tiques d'esp&#xE8;ces de caf&#xE9;iers (Coffea L.) ont &#xE9;t&#xE9; estim&#xE9;es &#xE0; partir de la s&#xE9;quence de l'espaceur interne transcrit (ITS 2) de l'ADN ribosomique nucl&#xE9;aire. La r&#xE9;gion ITS 2 de 37 accessions repr&#xE9;sentant 26 taxons de Coffea et 3 esp&#xE8;ces de Psilanthus a &#xE9;t&#xE9; d&#xE9;termin&#xE9;e par s&#xE9;quen&#xE7;age direct de fragments amplifi&#xE9;s par PCR. Le niveau de variation est suffisamment important pour rendre l'ITS 2 utile &#xE0; la reconstruction phylog&#xE9;n&#xE9;tique. Cependant, un niveau inhabituel de variation intrasp&#xE9;cifique est observ&#xE9; conduisant &#xE0; certaines difficult&#xE9;s dans l'interpr&#xE9;tation des divergences des s&#xE9;quences d'ADNr. Les s&#xE9;quences ont &#xE9;t&#xE9; analys&#xE9;es &#xE0; la fois par des m&#xE9;thodes cladistique (parcimonie de Wagner) et ph&#xE9;n&#xE9;tique (Neighbour-joining distance). Les taxons de caf&#xE9;iers apparaissent r&#xE9;partis entre plusieurs groupes majeurs qui pr&#xE9;sentent une forte correspondance g&#xE9;ographique (i.e. Madagascar, Afrique de l'Est, Afrique Centrale et Afrique de l'Ouest). Cette organisation est bien support&#xE9;e par les donn&#xE9;es cytog&#xE9;n&#xE9;tiques. Par contre, les r&#xE9;sultats sont en contradiction avec la classification actuelle des caf&#xE9;iers en deux genres, Coffea et Psilanthus. Par ailleurs, l'additivit&#xE9; des types parentaux d'ADNr n'est pas observ&#xE9;e chez l'esp&#xE8;ce allot&#xE9;traplo&#xEF;de C. arabica. (R&#xE9;sum&#xE9; d'auteur)</dc:description>
  <dc:date>1997</dc:date>
  <dc:type>text</dc:type>
  <dc:identifier>https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010011020</dc:identifier>
  <dc:identifier>fdi:010011020</dc:identifier>
  <dc:identifier>Lashermes Philippe, Combes Marie-Christine, Trouslot Pierre, Charrier A.. Phylogenetic relationships of coffee-tree species (Coffea L.) as inferred from ITS sequences of nuclear ribosomal DNA. 1997, 94,  947-955</dc:identifier>
  <dc:language>EN</dc:language>
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