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Haitham E., Gimenez G., Sokhna Cheikh, Bilcha K. D., Ali J., Barker S. C., Cutler S. J., Raoult Didier, Drancourt M. (2012). Multispacer sequence typing relapsing fever Borreliae in Africa. Plos Neglected Tropical Diseases, 6 (6), e1652. ISSN 1935-2735

Fichier PDF disponiblehttp://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers17-09/010057018.pdf[ PDF Link ]

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1371/journal.pntd.0001652

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Titre
Multispacer sequence typing relapsing fever Borreliae in Africa
Année de publication2012
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000305945300008
AuteursHaitham E., Gimenez G., Sokhna Cheikh, Bilcha K. D., Ali J., Barker S. C., Cutler S. J., Raoult Didier, Drancourt M.
SourcePlos Neglected Tropical Diseases, 2012, 6 (6), p. e1652. p. e1652 ISSN 1935-2735
RésuméBackground: In Africa, relapsing fevers are neglected arthropod-borne infections caused by closely related Borrelia species. They cause mild to deadly undifferentiated fever particularly severe in pregnant women. Lack of a tool to genotype these Borrelia organisms limits knowledge regarding their reservoirs and their epidemiology. Methodology/Principal Findings: Genome sequence analysis of Borrelia crocidurae, Borrelia duttonii and Borrelia recurrentis yielded 5 intergenic spacers scattered between 10 chromosomal genes that were incorporated into a multispacer sequence typing (MST) approach. Sequencing these spacers directly from human blood specimens previously found to be infected by B. recurrentis (30 specimens), B. duttonii (17 specimens) and B. crocidurae (13 specimens) resolved these 60 strains and the 3 type strains into 13 species-specific spacer types in the presence of negative controls. B. crocidurae comprised of 8 spacer types, B. duttonii of 3 spacer types and B. recurrentis of 2 spacer types. Conclusions/Significance: Phylogenetic analyses of MST data suggested that B. duttonii, B. crocidurae and B. recurrentis are variants of a unique ancestral Borrelia species. MST proved to be a suitable approach for identifying and genotyping relapsing fever borreliae in Africa. It could be applied to both vectors and clinical specimens.
Plan de classementEntomologie médicale / Parasitologie / Virologie [052]
LocalisationFonds IRD [F B010057018]
Identifiant IRDfdi:010057018
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010057018

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