Zijlstra C., Donkers-Venne D.T.H.M., Fargette Mireille. (2000). Identification of Meloidogyne incognita, M. javanica and M. arenaria using sequence characterised amplified region (SCAR) based PCR assays. Nematology, 2 (8), p. 847-853. ISSN 1388-5545.
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Identification of Meloidogyne incognita, M. javanica and M. arenaria using sequence characterised amplified region (SCAR) based PCR assays
Nematology, 2000,
2 (8), p. 847-853 ISSN 1388-5545
Trois marqueurs of d'ADN polymorphique amplifié au hasard (RAPD) OPA-12(sub420), OPB-O6(sub 1200) et OPA-OI(sub 700), respectivement spécifiques des espèces de nématodes Meloidogyne arenaria, M. incognita et M. javanica, ont été identifiés. Après le séquençage de ces produits RAPD-PCR, les amorces les plus longues de 18 à 23 nucléotides ont été choisies pour compléter les séquences terminales d'ADN des fragments d'ADN. Cela a conduit à trois paires d'amorces spécifiques de l'espèce, utilisées pour amplifier les régions des séquences caractéristiques (SCAR). Les lots d'amorces SCAR mis au point ont été utilisés avec succès lors d'essais directs, rapides et surs pour identifier M. incognita, M. javanica et M. arenia. Les marqueurs peuvent être amplifiés à partir de l'ADN des masses d'oeufs, des juvéniles de deuxième stade ou des femelles. Cette technique d'identification spécifique est donc indépendante des différents états de développement du nématode. De plus la technique SCAR-PCR a été appliquée avec succès à l'ADN extrait du matériel végétal infesté. Cette méthode présente des potentialités d'amélioration permettant d'envisager des tests pratiques d'identification de routine, facilitant ainsi le contrôle de ces parasites économiquement importants. (Résumé d'auteur)
