Whipple L.E., Lunt D.H., Hyman B.C. (1998). Mitochondrial DNA length variation in Meloidogyne incognita isolates of established genetic relationships : utility for nematode population studies. Fundamental and Applied Nematology, 21 (3), p. 265-271. ISSN 1164-5571.
Titre du document
Mitochondrial DNA length variation in Meloidogyne incognita isolates of established genetic relationships : utility for nematode population studies
Année de publication
1998
Type de document
Article
Auteurs
Whipple L.E., Lunt D.H., Hyman B.C.
Source
Fundamental and Applied Nematology, 1998,
21 (3), p. 265-271 ISSN 1164-5571
Six isolats de Meloidogyne incognita, dont les relations génétiques ont été précédemment établies, sont utilisés pour tester l'utilité d'une "répétition de tandems en nombre variable" (VNTR) d'une valeur de 63 paires de bases mitochondriales comme marqueurs en vue d'étude de populations. La réaction en chaîne de polymérase (PCR) est utilisée pour amplifier ce locus et mesurer le nombre de copies et la fréquence des allèles des VNTR à 63 paires de bases. Les individus du nématode sont typiquement hétéroplasmiques et conservent des molécules d'ADN mitochondrial (mtDNA) contenant jusqu'à treize classes de VNTR ayant des tailles distinctes. Chaque allèle est composé d'une à 21 copies répétées. La statistique hiérarchique révèle que la diversité entre isolats est faible (7%), tandis que 60% de la diversité génétique totale mesurée pour ces six isolats provient de la diversité entre individus. Des tests de rapports aléatoires montrent que les indices de diversité sont indépendants de la parenté génétique et de la race, limitant ainsi l'utilité de ce locus pour la différenciation des populations. M. incognita étant un organisme à parthénogenèse obligée, une contribution paternelle à l'hétéroplasmie est exclue ; la diversité entre individus concernant ce locus du mtDNA est donc en premier la conséquence de mutations conduisant à des nombres différents de copies répétées. (Résumé d'auteur)
Plan de classement
Biologie / Physiologie [076RAVPLA04]
Descripteurs
NEMATODE PHYTOPARASITE ; GENETIQUE DE POPULATION ; BIOLOGIE MOLECULAIRE ; ADN ; TECHNIQUE PCR ; ALLELE
