Escoffier S., Le Mer J., Roger Pierre-Armand. (1997). Enumeration of methanotrophic bacteria in ricefield soils by plating and MPN techniques : a critical approach. European Journal of Soil Biology, 33 (1), p. 41-51. ISSN 1164-5563.
Titre du document
Enumeration of methanotrophic bacteria in ricefield soils by plating and MPN techniques : a critical approach
Année de publication
1997
Type de document
Article
Auteurs
Escoffier S., Le Mer J., Roger Pierre-Armand
Source
European Journal of Soil Biology, 1997,
33 (1), p. 41-51 ISSN 1164-5563
La possibilité de compter les bactéries qui oxydent le méthane par les méthodes du MPN et par étalement sur boîtes a été testée sur 18 sols de rizières. Le milieu NMS de Whittenbury, classiquement utilisé pour la culture des méthanotrophes, permet également la croissance de nombreuses bactéries non méthanotrophes, d'actinomycètes et de champignons filamenteux. Malgré la bonne reproductibilité des comptages bactériens sur les boîtes incubées avec et sans méthane, leur différence ne permet généralement pas d'estimer les populations de méthanotrophes car (1) leur pourcentage par rapport aux populations totales poussant sur milieu NMS est trop faible et (2) les contaminations mycéliennes sur les boîtes sont trop importantes. L'utilisation de cristal violet ou d'antibiotiques, en réduisant ou ralentissant la croissance des contaminants, facilite le repérage et l'isolement des méthanotrophes mais ne permet pas leur numération. La méthode de coloration de Graham est efficace pour le repérage des colonies méthanotrophes et n'affecte pas leur viabilité. La méthode du MPN utilisant la consommation de méthane pour identifier les tubes positifs, après 6 ou 8 semaines d'incubation, fournit une estimation stable et reproductible des bactéries méthanotrophes cultivables. Les populations de bactéries méthanotrophes cultivables sont comprises entre 10 exp 2 et 10 exp 4 dans les sols secs et entre 10 exp 7 et 10 exp 9 dans les sols préincubés sous méthane. Ces résultats montrent le fort pouvoir inducteur du méthane sur ces populations et donne une information indirecte sur leur fort potentiel pour oxyder le méthane produit par les rizières. (Résumé d'auteur)
Plan de classement
Bactéries [074MICFLO01]
Descripteurs
BIOLOGIE DU SOL ; NUMERATION ; BACTERIE ; METHANE ; PRODUCTION ; RIZIERE ; CONTAMINATION ; MYCELIUM ; ANTIBIOTIQUE ; CROISSANCE ; BACTERIE METHANOTROPHE
