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Zijlstra C. (1997). A fast PCR assay to identify Meloidogyne hapla, M. chitwoodi, and M. fallax, and to sensitively differentiate them from each other and from M. incognita in mixtures. Fundamental and Applied Nematology, 20 (5), 505-511. ISSN 1164-5571

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Titre
A fast PCR assay to identify Meloidogyne hapla, M. chitwoodi, and M. fallax, and to sensitively differentiate them from each other and from M. incognita in mixtures
Année de publication1997
Type de documentArticle
AuteursZijlstra C.
SourceFundamental and Applied Nematology, 1997, 20 (5), p. 505-511. ISSN 1164-5571
RésuméDes fragments préalablement amplifiés de rDNA-ITS de Meloidogyne chitwoodi, M. fallax, M. hapla et M. incognita ont été clonés et séquencés. L'alignement des séquences montre une variabilité faible dans les parties codantes et quelque variabilité dans la région ITS1. La plus importante variabilité est observée dans la région ITS2. Les séquences ont été utilisées pour établir les amorces "sens" H-18S, I-ITS et CF-ITS, lesquelles en combinaison avec l'amorce "anti-sens" HCFI28S ont été utilisées pour l'amplification spécifique de M. hapla, M. incognita, M. chitwoodi et M. fallax, respectivement. Il en résulte un polymorphisme de taille des fragments distinguant les quatre espèces. Lorsque les quatre amorces sont utilisées pour une unique réaction PCR, des juvéniles isolés ou des isolats de M. chitwoodi, M. fallax, M. hapla et M. incognita peuvent être identifiés en une seule étape. Cette méthode de PCR multiplexe permet la détection des espèces présentes dans un mélange, à des taux aussi faibles que 2 à 5%. (Résumé d'auteur)
Plan de classementBiologie / Physiologie [076RAVPLA04]
DescripteursNEMATODE PHYTOPARASITE ; BIOLOGIE MOLECULAIRE ; DIAGNOSTIC ; PCR.REACTION DE POLYMERISATION EN CHAINE
LocalisationFonds IRD [F A010012351] ; Bondy ; Montpellier (Centre IRD)
Identifiant IRDfdi:010012351
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010012351

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