Been T.H., Meijer E.M.J., Beniers A.E., Knol J.W. (1996). Using image analysis for counting larvae of potato cyst nematodes (Globodera spp.). Fundamental and Applied Nematology, 19 (3), p. 297-304. ISSN 1164-5571.
Titre du document
Using image analysis for counting larvae of potato cyst nematodes (Globodera spp.)
Année de publication
1996
Type de document
Article
Auteurs
Been T.H., Meijer E.M.J., Beniers A.E., Knol J.W.
Source
Fundamental and Applied Nematology, 1996,
19 (3), p. 297-304 ISSN 1164-5571
Le système GOP302 d'analyse d'images (Contact Vision, Suède) a été utilisé pour automatiser le comptage de nombres élevés de larves de Globodera rostochiensis et G. pallida en suspension. Ces suspensions provenaient de tests d'éclosion menés pour estimer le pourcentage de mortalité lors d'expériences aux champs et en laboratoire sur des nématodes exposés aux nématicides. Le résultat, appelé ANECS (Automatic Nematode Counting System), consiste en un logiciel programmé pour compter successivement jusqu'à 64 compartiments contenant ces suspensions, et ce sans l'aide d'aucun opérateur. Un porte-objet adapté a été mis au point. Les images provenant de huit porte-objet (512 suspensions de larves) peuvent être stockées et leur analyse différée en fonction des heures de travail. Le temps nécessaire au comptage d'un compartiment est d'une minute, correspondant ainsi à une réduction de 80% du temps d'un comptage "manuel", tandis que le temps de préparation de l'échantillon reste inchangé. L'erreur percentile est la plus élevée dans le cas de densités faibles de larves (< 20 par suspension); elle est causée par la pollution provenant de petites fibres transportées par l'atmosphère durant la préparation des suspensions de larves. Ce problème peut être diminué en adoptant la procédure dite des "laboratoires propres". Au moins 95% des larves provenant des tests d'éclosion sont reconnues et comptées. Ce programme peut être, et a été, adapté au comptage d'autres espèces de nématodes ou même à des problèmes plus compliqués comme le comptage des oeufs et des larves dans la même suspension. (Résumé d'auteur)
