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Belahbib H., Summers Z. M., Fardeau Marie-Laure, Joseph Manon, Tamburini C., Dolla A., Ollivier Bernard, Armougom Fabrice. (2018). Towards a congruent reclassification and nomenclature of the thermophilic species of the genus Pseudothermotoga within the order Thermotogales. Systematic and Applied Microbiology, 41 (6), 555-563. ISSN 0723-2020

Fichier PDF disponiblehttp://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers18-12/010074781.pdf[ PDF Link ]

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1016/j.syapm.2018.04.007

Titre
Towards a congruent reclassification and nomenclature of the thermophilic species of the genus Pseudothermotoga within the order Thermotogales
Année de publication2018
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000452948500003
AuteursBelahbib H., Summers Z. M., Fardeau Marie-Laure, Joseph Manon, Tamburini C., Dolla A., Ollivier Bernard, Armougom Fabrice.
SourceSystematic and Applied Microbiology, 2018, 41 (6), p. 555-563. ISSN 0723-2020
RésuméThe phylum Thermotogae gathers thermophilic, hyperthermophic, mesophilic, and thermo-acidophilic anaerobic bacteria that are mostly originated from geothermally heated environments. The metabolic and phenotypic properties harbored by the Thermotogae species questions the evolutionary events driving the emergence of this early branch of the universal tree of life. Recent reshaping of the Thermotogae taxonomy has led to the description of a new genus, Pseudothermotoga, a sister group of the genus Thermotoga within the order Thermotogales. Comparative genomics of both Pseudothermotoga and Thermotoga spp., including 16S-rRNA-based phylogenetic, pan-genomic analysis as well as signature indel conservation, provided evidence that Thermotoga caldifontis and Thermotoga profunda species should be reclassified within the genus Pseudothermotoga and renamed as Pseudothermotoga caldifontis comb. nov. (type strain = AZM44c09(T)) and Pseudothermotogaprofunda comb. nov. (type strain =AZM34c06(T)), respectively. In addition, based upon whole-genome relatedness indices and DNA-DNA Hybridization results, the reclassification of Pseudothermotoga lettingae and Pseudothermotoga subterranea as latter heterotypic synonyms of Pseudothermotoga elfii is proposed. Finally, potential genetic elements resulting from the distinct evolutionary story of the Thermotoga and Pseudothermotoga clades are discussed.
Plan de classementBiotechnologies [084]
LocalisationFonds IRD [F B010074781]
Identifiant IRDfdi:010074781
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010074781

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