Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

 

Publications des scientifiques de l'IRD

Comte A., Christen Pierre, Davidson Sylvain, Pophillat M., Lorquin Jean, Auria Richard, Simon G., Casalot Laurence. (2013). Biochemical, transcriptional and translational evidences of the phenol-meta-degradation pathway by the hyperthermophilic Sulfolobus solfataricus 98/2. Plos One, 8 (12), e82397. ISSN 1932-6203

Fichier PDF disponiblehttp://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers17-10/010061450.pdf[ PDF Link ]

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1371/journal.pone.0082397

En Libre Accès sur HAL http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00999455

Titre
Biochemical, transcriptional and translational evidences of the phenol-meta-degradation pathway by the hyperthermophilic Sulfolobus solfataricus 98/2
Année de publication2013
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000328730300091
AuteursComte A., Christen Pierre, Davidson Sylvain, Pophillat M., Lorquin Jean, Auria Richard, Simon G., Casalot Laurence.
SourcePlos One, 2013, 8 (12), p. e82397. p. e82397 ISSN 1932-6203
RésuméPhenol is a widespread pollutant and a model molecule to study the biodegradation of monoaromatic compounds. After a first oxidation step leading to catechol in mesophilic and thermophilic microorganisms, two main routes have been identified depending on the cleavage of the aromatic ring: ortho involving a catechol 1,2 dioxygenase (C12D) and meta involving a catechol 2,3 dioxygenase (C23D). Our work aimed at elucidating the phenol-degradation pathway in the hyperthermophilic archaea Sulfolobus solfataricus 98/2. For this purpose, the strain was cultivated in a fermentor under different substrate and oxygenation conditions. Indeed, reducing dissolved-oxygen concentration allowed slowing down phenol catabolism (specific growth and phenol-consumption rates dropped 55% and 39%, respectively) and thus, evidencing intermediate accumulations in the broth. HPLC/Diode Array Detector and LC-MS analyses on culture samples at low dissolved-oxygen concentration (DOC = 0.06 mg.L-1) suggested, apart for catechol, the presence of 2-hydroxymuconic acid, 4-oxalocrotonate and 4-hydroxy-2-oxovalerate, three intermediates of the meta route. RT-PCR analysis on oxygenase-coding genes of S. solfataricus 98/2 showed that the gene coding for the C23D was expressed only on phenol. In 2D-DIGE/MALDI-TOF analysis, the C23D was found and identified only on phenol. This set of results allowed us concluding that S. solfataricus 98/2 degrade phenol through the meta route.
Plan de classementBiotechnologies [084] ; Sciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020]
LocalisationFonds IRD [F B010061450]
Identifiant IRDfdi:010061450
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010061450

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


* PDF Link :

    à télécharger pour citer/partager ce document sur les réseaux sociaux académiques


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Cayenne

Nouméa

Papeete

Abidjan

Dakar

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito