Publications des scientifiques de l'IRD

Kotoulas G., Agnèse Jean-François, Zouros E. (1998). Microsatellite variation in the african catfish Chrysichthys nigrodigitatus (Lacepede, 1803) (Siluroidei, Claroteidae). In : Agnèse Jean-François (ed.). Genetics and aquaculture in Africa. Paris : ORSTOM, p. 285-288. (Colloques et Séminaires). Génétique et Aquaculture en Afrique : Colloque, Abidjan (CIV), 1997/04/01-04. ISBN 2-7099-1390-9. ISSN 0767-2896.

Titre du document
Microsatellite variation in the african catfish Chrysichthys nigrodigitatus (Lacepede, 1803) (Siluroidei, Claroteidae)
Année de publication
1998
Type de document
Partie d'ouvrage
Auteurs
Kotoulas G., Agnèse Jean-François, Zouros E.
In
Agnèse Jean-François (ed.), Genetics and aquaculture in Africa
Source
Paris : ORSTOM, 1998, p. 285-288 (Colloques et Séminaires). ISBN 2-7099-1390-9 ISSN 0767-2896
Colloque
Génétique et Aquaculture en Afrique : Colloque, Abidjan (CIV), 1997/04/01-04
La variation à trois locus microsatellites a été examinée dans trois populations naturelles de Chrysichthys nigrodigitatus : le Sénégal, le barrage de Sélingué (sur le fleuve Niger au Mali), la lagune Ebrié en Côte d'Ivoire et le lac Volta, une population domestique en provenance de la Sial (Société ivoirienne d'aquaculture lagunaire) dans la lagune Ebrié a été également examinée. Le nombre d'allèles observés dans chacun des trois locus a été important (de 29 à 30) et le nombre moyen d'allèles par population a varié de 6,67 à 22,0. Les valeurs les plus faibles d'hétérozygoties ont été observées dans le barrage de Sélingué et dans la population domestique, alors que les trois autres populations naturelles ont des taux d'hétérozygotie supérieurs et comparables. Selon les locus, de 17 à 60% des allèles sont privés. Si l'on considère que les allèles microsatellites sont neutres et que les appariements se font au hasard (panmixie), on peut alors comparer les tailles des populations efficaces. Les cinq populations peuvent être rangées en trois catégories : la population du barrage de Sélingué et celle de la Sial ont les tailles efficaces les plus faibles puis vient celle du lac Volta et enfin celles du Sénégal et de la lagune Ebrié. La plupart des populations sont à l'équilibre de Hardy-Weinberg à l'exception de celle du Sénégal où on observe une tendance à l'excès d'homozygotes. Une analyse des correspondances basée sur ces trois locus permet efficacement d'assigner un individu à sa population. Ces résultats montrent que les microsatellites sont un outil de choix pour le suivi, la préservation de la diversité génétique et les programmes d'élevage aquacole de cette espèce. (Résumé d'auteur)
Plan de classement
Poissons [034BIOVER01]
Descripteurs
POISSON D'EAU DOUCE ; GENETIQUE DE POPULATION ; ALLELE ; VARIABILITE GENETIQUE ; ETUDE COMPARATIVE
Description Géographique
AFRIQUE DE L'OUEST
Localisation
Fonds IRD [F A010015271] ; Bondy ; Montpellier (Centre IRD)
Identifiant IRD
fdi:010015297
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