Yves Vigouroux dans la base Horizon  

 Année-Type Année Type-Année Type

2023

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Gain C., Rhone B., Cubry Philippe, Salazar I., Forbes F., Vigouroux Yves, Jay F., Francois O. (2023). A quantitative theory for genomic offset statistics. Molecular Biology and Evolution, 40 (6), p. msad140 [10 p.]. ISSN 0737-4038.
    Identifiant IRD :  fdi:010088270
     Open Access  DOI

  2. Tenaillon M. I., Burban E., Huynh Stella, Wojcik A., Thuillet Anne-Céline, Manicacci D., Gerard P. R., Alix K., Belcram H., Cornille A., Brault M., Stevens R., Lagnel J., Dogimont C., Vigouroux Yves, Glemin S. (2023). Crop domestication as a step toward reproductive isolation. American Journal of Botany, [Early access], p. [5 p.]. ISSN 0002-9122.
    Identifiant IRD :  fdi:010088078
     Demander le PDF  DOI

  3. Vi T., Vigouroux Yves, Cubry Philippe, Marraccini P., Phan H., Khong G. N., Poncet Valérie. (2023). Genome-wide admixture mapping identifies wild ancestry-of-origin segments in cultivated robusta coffee. Genome Biology and Evolution, 15 (5), p. evad065 [12 p.]. ISSN 1759-6653.
    Identifiant IRD :  fdi:010087728
     Open Access  DOI

  4. Salson M., Orjuela J., Mariac Cédric, Zekraoui Leila, Couderc Marie, Arribat S., Rodde N., Faye A., Kane N. A., Dubreuil Tranchant Christine, Vigouroux Yves, Berthouly Cécile. (2023). An improved assembly of the pearl millet reference genome using Oxford Nanopore long reads and optical mapping. G3 : Genes Genomes Genetics, [Early access], p. [7 p.]. ISSN 2160-1836.
    Identifiant IRD :  fdi:010087490
     Open Access  DOI  HAL

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. Barnaud Adeline, Berthouly Cécile, Pham Jean-Louis, Vigouroux Yves, Jankowski F. (2023). Agrobiodiversity and sustainability : a collaborative approach. In : Dangles Olivier (coord.), Fréour Claire (coord.). Sustainability science : understand, co-construct, transform : collective thinking. Marseille : IRD, 80-83.
    Identifiant IRD :  fdi:010087913
     Open Access  HAL

2022

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Escobar S., Vigouroux Yves, Karubian J., Zekraoui Leila, Balslev H., Montufar R. (2022). Limited seed dispersal shapes fine-scale spatial genetic structure in a Neotropical dioecious large-seeded palm. Biotropica, [Early access], p. [13 p.]. ISSN 0006-3606.
    Identifiant IRD :  fdi:010086495
     Demander le PDF  DOI  HAL

  2. Faye A., Barnaud Adeline, Kane N. A., Cubry Philippe, Mariac Cédric, Burgarella C., Rhone B., Faye A., Olodo K. F., Cisse A., Couderc Marie, Dequincey A., Zekraoui Leila, Moussa D., Tidjani M., Vigouroux Yves, Berthouly Cécile. (2022). Genomic footprints of selection in early-and late-flowering pearl millet landraces. Frontiers in Plant Science, 13, p. 880631 [13 p.]. ISSN 1664-462X.
    Identifiant IRD :  fdi:010086408
     Open Access  DOI  HAL

  3. De la Fuente Canto Carla, Vigouroux Yves. (2022). Evaluation of nine statistics to identify QTLs in bulk segregant analysis using next generation sequencing approaches. BMC Genomics, 23 (1), 490 [12 p.]. ISSN 1471-2164.
    Identifiant IRD :  fdi:010085381
     Open Access  DOI  HAL

  4. Canto C. D., Diouf M. N., Ndour Papa Mamadou Sitor, Debieu Marilyne, Grondin Alexandre, Passot S., Champion Antony, Barrachina C., Pratlong M., Gantet Pascal, Assigbetsé Komi, Kane N., Cubry Philippe, Diedhiou A. G., Heulin T., Achouak W., Vigouroux Yves, Cournac Laurent, Laplaze Laurent. (2022). Genetic control of rhizosheath formation in pearl millet. Scientific Reports - Nature, 12 (1), 9205 [13 p.]. ISSN 2045-2322.
    Identifiant IRD :  fdi:010085249
     Open Access  DOI  HAL

  5. Tournebize Rémi, Borner L., Manel S., Meynard C. N., Vigouroux Yves, Crouzillat D., Fournier C., Kassam M., Descombes P., Dubreuil Tranchant Christine, Parrinello H., Kiwuka C., Sumirat U., Legnate H., Kambale J. L., Sonke B., Mahinga J. C., Musoli P., Janssens S. B., Stoffelen P., Kochko Alexandre de, Poncet Valérie. (2022). Ecological and genomic vulnerability to climate change across native populations of Robusta coffee (Coffea canephora). Global Change Biology, [Early access], [19 p.]. ISSN 1354-1013.
    Identifiant IRD :  fdi:010084759
     Demander le PDF  DOI  HAL

  6. de Aquino S. O., Kiwuka C., Tournebize R., Gain C., Marraccini P., Mariac Cédric, Bethune K., Couderc Marie, Cubry Philippe, Andrade A. C., Lepelley M., Darracq O., Crouzillat D., Anten N., Musoli P., Vigouroux Yves, Kochko Alexandre de, Manel S., Francois O., Poncet Valérie. (2022). Adaptive potential of Coffea canephora from Uganda in response to climate change. Molecular Ecology, [Early access], [20 p.]. ISSN 0962-1083.
    Identifiant IRD :  fdi:010084247
     Demander le PDF  DOI  HAL

  7. Mofini M. T., Diedhiou A. G., Simonin Marie, Dondjou D. T., Pignoly Sarah, Ndiaye C., Min D. H., Vigouroux Yves, Laplaze Laurent, Kane A. (2022). Cultivated and wild pearl millet display contrasting patterns of abundance and co-occurrence in their root mycobiome. Scientific Reports - Nature, 12 (1), 207 [17 p.]. ISSN 2045-2322.
    Identifiant IRD :  fdi:010084241
     Open Access  DOI  HAL

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. Barnaud Adeline, Billot C., Abrouk M.D., Adjebeng-Danquah J., Akanvou L., Ahmed H.I., Adje C.O.A., Bakasso Y., Barry M.B., Achigan-Dako E.G., Yerima A.R.I.B., Kane Ndjido A., Krattinger S.G., Oselebe H., Saidou S., Sekloka E., Uyoh E.A., Vigouroux Yves, Gueye M.C. (2022). From shade to light : fonio, an african orphan crop, towards renewed challenges. In : Kane N.A. (ed.), Foncéka D. (ed.), Dalton T.J. (ed.). Crop adaptation and improvement for drought-prone environments. Manhattan : New Prairie Press, 383-403. ISBN 978-1-944548-47-6.
    Identifiant IRD :  fdi:010088425
     Open Access  HAL

  2. Barnaud Adeline, Berthouly Cécile, Pham Jean-Louis, Vigouroux Yves, Jankowski F. (2022). Agrobiodiversité et durabilité : jouons collaboratif !. In : Dangles Olivier (coord.), Fréour Claire (coord.). Science de la durabilité : comprendre, co-construire, transformer : réflexion collective. Marseille : IRD, 80-83.
    Identifiant IRD :  fdi:010085441
     Open Access  DOI  HAL

2021

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Varshney R. K., Roorkiwal M., Sun S., Bajaj P., Chitikineni A., Thudi M., Singh N. P., Du X., Upadhyaya H. D., Khan A. W., Wang Y., Garg V., Fan G. Y., Cowling W. A., Crossa J., Gentzbittel L., Voss-Fels K. P., Valluri V. K., Sinha P., Singh V. K., Ben C. L., Rathore A., Punna R., Singh M. K., Tar'an B., Bharadwaj C., Yasin M., Pithia M. S., Singh S., Soren K. R., Kudapa H., Jarquin D., Cubry Philippe, Hickey L. T., Dixit G. P., Thuillet Anne-Céline, Hamwieh A., Kumar S., Deokar A. A., Chaturvedi S. K., Francis A., Howard R., Chattopadhyay D., Edwards D., Lyons E., Vigouroux Yves, Hayes B., von Wettberg E., Datta S. K., Yang H. M., Nguyen H. T., Wang J., Siddique K. H. M., Mohapatra T., Bennetzen J. L., Xu X., Liu X. (2021). A chickpea genetic variation map based on the sequencing of 3,366 genomes. Nature, [Early access], [6 p.] + [19 p.]. ISSN 0028-0836.
    Identifiant IRD :  fdi:010083322
     Open Access  DOI  HAL

  2. Mariac Cédric, Renno Jean-François, Garcia-Davila C., Vigouroux Yves, Mejia E., Angulo C., Ruiz D. C., Estivals Guillain, Nolorbe C., Vasquez A. G., Nunez Rodriguez Jesus, Cochonneau Gérard, Flores M., Alvarado J., Vertiz J., Chota-Macuyama W., Sanchez H., Miranda G., Duponchelle Fabrice. (2021). Species-level ichthyoplankton dynamics for 97 fishes in two major river basins of the Amazon using quantitative metabarcoding. Molecular Ecology, [Early access], [22 p.]. ISSN 0962-1083.
    Identifiant IRD :  fdi:010081493
     Demander le PDF  DOI  HAL

  3. Rimlinger A., Avana M. L., Awono A., Chakocha A., Gakwavu A., Lemoine T., Marie L., Mboujda F., Vigouroux Yves, Johnson V., Vinceti B., Carrière Stéphanie M., Duminil Jérôme. (2021). Trees and their seed networks : the social dynamics of urban fruit trees and implications for genetic diversity. PLoS One, 16 (3), e0243017 [13 p.]. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010081129
     Open Access  DOI  HAL

2020

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Abrouk M., Ahmed H. I., Cubry Philippe, Simonikova D., Cauet S., Pailles Y., Bettgenhaeuser J., Gapa L., Scarcelli Nora, Couderc Marie, Zekraoui Leila, Kathiresan N., Cizkova J., Hribova E., Dolezel J., Arribat S., Berges H., Wieringa J. J., Gueye M., Kane N. A., Leclerc C., Causse S., Vancoppenolle S., Billot C., Wicker T., Vigouroux Yves, Barnaud Adeline, Krattinger S. G. (2020). Fonio millet genome unlocks African orphan crop diversity for agriculture in a changing climate. Nature Communications, 11 (1), p. 4488 [13 p.]. ISSN 2041-1723.
    Identifiant IRD :  fdi:010080475
     Open Access  DOI  HAL

  2. Diack O., Kanfany G., Gueye M. C., Sy O., Fofana A., Tall H., Serba D. D., Zekraoui Leila, Berthouly Cécile, Vigouroux Yves, Diouf D., Kane N. A. (2020). GWAS unveils features between early- and late-flowering pearl millets. BMC Genomics, 21 (1), 777 [11 p.]. ISSN 1471-2164.
    Identifiant IRD :  fdi:010080003
     Open Access  HAL

  3. Grondin Alexandre, Affortit P., Dubreuil Tranchant Christine, de la Fuente-Canto C., Mariac Cédric, Gantet Pascal, Vadez Vincent, Vigouroux Yves, Laplaze Laurent. (2020). Aquaporins are main contributors to root hydraulic conductivity in pearl millet [Pennisetum glaucum (L) R. Br.]. PLoS One, 15 (10), 0233481 [19 p.]. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010080007
     Open Access  HAL

  4. Rhoné Bénédicte, Defrance Dimitri, Berthouly Cécile, Mariac Cédric, Cubry Philippe, Couderc Marie, Dequincey Anaïs, Assoumanne A., Kane N. A., Sultan Benjamin, Barnaud Adeline, Vigouroux Yves. (2020). Pearl millet genomic vulnerability to climate change in West Africa highlights the need for regional collaboration. Nature Communications, 11 (1), 5274 [9 p.]. ISSN 2041-1723.
    Identifiant IRD :  fdi:010079949
     Open Access  DOI  HAL

  5. Olodo K. F., Barnaud Adeline, Kane N. A., Mariac Cédric, Faye A., Couderc Marie, Zekraoui Leila, Dequincey Anaïs, Diouf D., Vigouroux Yves, Berthouly Cécile. (2020). Abandonment of pearl millet cropping and homogenization of its diversity over a 40 year period in Senegal. PLoS One, 15 (9), p. e0239123 [18p.]. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010079765
     Open Access  DOI

  6. Le Corre V., Siol M., Vigouroux Yves, Tenaillon M. I., Delye C. (2020). Adaptive introgression from maize has facilitated the establishment of teosinte as a noxious weed in Europe. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 117 (41), p. 25618-25627. ISSN 0027-8424.
    Identifiant IRD :  fdi:010079833
     Demander le PDF  DOI  HAL

  7. Cubry Philippe, Pidon H., Ta K. N., Dubreuil Tranchant Christine, Thuillet Anne-Céline, Holzinger M., Adam Hélène, Kam H., Chrestin Harold, Ghesquière Alain, Francois O., Sabot François, Vigouroux Yves, Albar Laurence, Jouannic Stefan. (2020). Genome wide association study pinpoints key agronomic QTLs in African rice Oryza glaberrima. Rice, 13 (1), p. 66 [12 p.]. ISSN 1939-8425.
    Identifiant IRD :  fdi:010079766
     Open Access  DOI  HAL

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. Hamon Serge, Vigouroux Yves. (2020). Custodians of agricultural diversity. In : Agnèse Jean-François (dir.), Dangles Olivier (dir.), Rodary Estienne (dir.), Verdier Valérie (préf.), Sabrié Marie-Lise (ed.), Mourier Thomas (ed.), Lavagne Corinne (ed.), Thivent V. (rédac.). Biodiversity in the global south : research for a sustainable world. Marseille : IRD, 58-59. ISBN 978-2-7099-2874-8.
    Identifiant IRD :  fdi:010081870
     Open Access

  2. Hamon Serge, Vigouroux Yves. (2020). Gardiens de la diversité agronomique. In : Agnèse Jean-François (dir.), Dangles Olivier (dir.), Rodary Estienne (dir.), Verdier Valérie (préf.), Sabrié Marie-Lise (ed.), Mourier Thomas (ed.), Lavagne Corinne (ed.), Thivent V. (rédac.). Biodiversité au Sud : recherches pour un monde durable. Marseille : IRD, 58-59. ISBN 978-2-7099-2850-2.
    Identifiant IRD :  fdi:010080861
     Open Access  HAL

2019

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Fustier M. A., Martinez-Ainsworth N. E., Aguirre-Liguori J. A., Venon A., Corti H., Rousselet A., Dumas F., Dittberner H., Camarena M. G., Grimanelli Daniel, Ovaskainen O., Falque M., Moreau L., de Meaux J., Montes-Hernandez S., Eguiarte L. E., Vigouroux Yves, Manicacci D., Tenaillon M. I. (2019). Common gardens in teosintes reveal the establishment of a syndrome of adaptation to altitude. PLoS Genetics, 15 (12), p. e1008512 [34 p.]. ISSN 1553-7404.
    Identifiant IRD :  fdi:010077903
     Open Access  DOI  HAL

  2. Scarcelli Nora, Cubry Philippe, Akakpo R., Thuillet Anne-Céline, Obidiegwu J., Baco M. N., Otoo E., Sonke B., Dansi A., Djedatin G., Mariac Cédric, Couderc Marie, Causse S., Alix K., Chair H., Francois O., Vigouroux Yves. (2019). Yam genomics supports West Africa as a major cradle of crop domestication. Science Advances, 5 (5), p. eaaw1947 [7 p.]. ISSN 2375-2548.
    Identifiant IRD :  fdi:010076071
     Open Access  DOI  HAL

  3. Bethune Kévin, Mariac Cédric, Couderc Marie, Scarcelli Nora, Santoni S., Ardisson M., Martin J. F., Montufar R., Klein V., Sabot François, Vigouroux Yves, Couvreur Thomas. (2019). Long-fragment targeted capture for long-read sequencing of plastomes. Applications in Plant Sciences, 7 (5), p. e1243 [13 p.]. ISSN 2168-0450.
    Identifiant IRD :  fdi:010075713
     Demander le PDF  DOI  HAL

  4. Varshney R. K., Thudi M., Roorkiwal M., He W. M., Upadhyaya H. D., Yang W., Bajaj P., Cubry Philippe, Rathore A., Jian J. B., Doddamani D., Khan A. W., Garg V., Chitikineni A., Xu D. W., Gaur P. M., Singh N. P., Chaturvedi S. K., Nadigatla Gvpr, Krishnamurthy L., Dixit G. P., Fikre A., Kimurto P. K., Sreeman S. M., Bharadwaj C., Tripathi S., Wang J., Lee S. H., Edwards D., Polavarapu K. K. B., Penmetsa R. V., Crossa J., Nguyen H. T., Siddique K. H. M., Colmer T. D., Sutton T., von Wettberg E., Vigouroux Yves, Xu X., Liu X. (2019). Resequencing of 429 chickpea accessions from 45 countries provides insights into genome diversity, domestication and agronomic traits. Nature Genetics, 51 (5), p. 857-864. ISSN 1061-4036.
    Identifiant IRD :  fdi:010075648
     Demander le PDF  DOI  HAL

  5. Olodo K. F., Gueye M. C., Calatayud C., Diop B. M., Kane N. A., Ngom A., Ntui V. O., Barreto M. M. S., Uyoh E. A., Abraham S., Vigouroux Yves, Billot C., Barnaud Adeline. (2019). EST-SSR development for Digitaria exilis and its relatives D. iburua and D. longiflora from transcriptome sequences. Plant Genetic Resources, 17 (3), p. 280-284. ISSN 1479-2621.
    Identifiant IRD :  fdi:010075611
     Demander le PDF  DOI  HAL

  6. Burgarella Concetta, Barnaud Adeline, Kane N. A., Jankowski F., Scarcelli Nora, Billot C., Vigouroux Yves, Berthouly Cécile. (2019). Adaptive introgression : an untapped evolutionary mechanism for crop adaptation. Frontiers in Plant Science, 10, p. art. 4 [17 p.]. ISSN 1664-462X.
    Identifiant IRD :  fdi:010075125
     Open Access  DOI  HAL

  7. Tournebize Rémi, Poncet Valérie, Jakobsson M., Vigouroux Yves, Manel S. (2019). McSwan : a joint site frequency spectrum method to detect and date selective sweeps across multiple population genomes. Molecular Ecology Resources, 19 (1), p. 283-295. ISSN 1755-098X.
    Identifiant IRD :  fdi:010075149
     Demander le PDF  DOI  HAL

  8. Magwe-Tindo J., Wieringa J. J., Sonke B., Zapfack L., Vigouroux Yves, Couvreur Thomas, Scarcelli Nora. (2019). Complete plastome sequences of 14 African yam species (Dioscorea spp.). Mitochondrial DNA Part B : Resources, 4 (1), p. 74-76. ISSN 2380-2359.
    Identifiant IRD :  fdi:010074876
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Autres publications, littérature grise


  1. Biegala Isabelle, Dangles Olivier, Hubert Nicolas, Ledru Marie-Pierre, Le Loc'h François, Maeght Jean-Luc, Oberdorff Thierry, Pouilly Marc, Vigouroux Yves, Barot Sébastien. (2019). Pourquoi lier la résolution de la crise de la biodiversité à celle de la crise climatique ?. Marseille : IRD, 19 p. multigr. (Communauté de Savoirs Biodiversité).
    Identifiant IRD :  fdi:010087041
     Open Access  HAL

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. Cubry Philippe, Vigouroux Yves. (2019). Population genomics of crop domestication : current state and perspectives. In : Rajora O.P. (ed.). Population genomics : concepts, approaches and applications. Cham : Springer, 685-707. (Population Genomics). ISBN 978-3-030-04587-6.
    Identifiant IRD :  fdi:010088356
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Directions d'ouvrages ou de revues


  1. Sabrié Marie-Lise (dir.), Mourier Thomas (dir.), Lavagne Corinne (dir.), Thivent V., Guérin Isabelle (contrib.), Roubaud François (contrib.), Guilmoto Christophe (contrib.), Razafindrakoto Mireille (contrib.), Pilon Marc (contrib.), Léglise Isabelle (contrib.), Le Meur Pierre-Yves (contrib.), Ouattara Fatoumata (contrib), Seignobos Christian (contrib.), Chauveau Jean-Pierre (contrib.), Léonard Eric (contrib.), Guillaud Dominique (contrib.), Froment Alain (contrib.), Robin Nelly (contrib.), Agier Michel (contrib.), Bava Sophie (contrib.), Desgrées du Loû Annabel (contrib.), Gubert Flore (contrib.), Delaporte Eric (contrib.), Jourdain Gonzague (contrib.), Dumont Alexandre (contrib.), Trèche Serge (contrib.), Berger Jacques (contrib.), Traissac Pierre (contrib.), Delaunay Valérie (contrib.), Robert Vincent (contrib.), Darriet Frédéric (contrib.), Sokhna Cheikh (contrib.), Cot Michel (contrib.), Peeters Martine (contrib.), Leroy Eric (contrib.), Desclaux Alice (contrib.), Hougard Jean-Marc (contrib.), Paugy Didier (contrib.), Boussinesq Michel (contrib.), Solano Philippe (contrib.), Missé Dorothée (contrib.), Gouagna Louis-Clément (contrib.), Lemesre Jean-Loup (contrib.), Banuls Anne-Laure (contrib.), Menkes Christophe (contrib.), Mangeas Morgan (contrib.), Sultan Benjamin (contrib.), Condom Thomas (contrib.), Gosset Marielle (contrib.), Janicot Serge (contrib.), Nocquet Jean-Mathieu (contrib.), Le Pennec Jean-Luc (contrib.), Hardy Sébastien (contrib.), Charvis Philippe (contrib.), Hello Yann (contrib.), Bonnet Emmanuel (contrib.), Strady Emilie (contrib.), Point David (contrib.), Ollivier Bernard (contrib.), Biegala Isabelle (contrib.), Feller Christian (contrib.), Valentin Christian (contrib.), Giraud Eric (contrib.), Blanchart Eric (contrib.), Montoroi Jean-Pierre (contrib.), Cecchi Philippe (contrib.), Albergel Jean (contrib.), Vouillamoz Jean-Michel (contrib.), Simonneaux Vincent (contrib.), Boulet Gilles (contrib.), Ruf Thierry (contrib.), Michon Geneviève (contrib.), Boutrais Jean-Baptiste (contrib.), Emperaire Laure (contrib.), Duponnois Robin (contrib.), Boulanger Jean-Philippe (contrib.), Hébrard Eugénie (contrib.), Verdier Valérie (contrib.), Szurek Boris (contrib.), Le Rü Bruno (contrib.), Calatayud Paul-André (contrib.), Dangles Olivier (contrib.), Aberlenc Frédérique (contrib.), Roussos Sevastianos (contrib.), Dobigny Gauthier (contrib.), Legendre Marc (contrib.), Gaertner Daniel (contrib.), Chavance Pierre (contrib.), Bach Pascal (contrib.), Bertrand Arnaud (contrib.), Vialard Jérôme (contrib.), Merle Jacques (contrib.), Voituriez Bruno (contrib.), Bourles Bernard (contrib.), Penven Pierrick (contrib.), Lebel Thierry (contrib.), Mahé Gil (contrib.), Descroix Luc (contrib.), Chevallier Pierre (contrib.), Calmant Stéphane (contrib.), Turcq Bruno (contrib.), Favreau Adrien (contrib.), Rajot Jean-Louis (contrib.), Pélissier Raphaël (contrib.), Cury Philippe (contrib.), Rodolfo-Metalpa Riccardo (contrib.), Tricornot Hervé de (contrib.), Simard Frédéric (contrib.), Etard Jean-François (contrib.), Taverne Bernard (contrib.), Fournet Florence (contrib.), Drogoul Alexis (contrib), Souris Marc (contrib.), Simier Monique (contrib.), Bonnin Marie (contrib.), Ghesquière Alain (contrib.), Hamon Serge (contrib.), Vigouroux Yves (contrib.), Gonzalez Sophie (contrib.), Molino Jean-François (contrib.), Bourdy Geneviève (contrib.), Moretti Christian (contrib.), Ottino Garanger Pierre (contrib.), Valdez Francisco (contrib.), Antheaume Benoît (contrib.), Gratiot Nicolas (contrib.). (2019). Science et développement durable : 75 ans de recherche au Sud. Marseille : IRD, 224 p. ISBN 978-2-7099-2737-6.
    Identifiant IRD :  fdi:010075823
     Open Access

Ouvrages


  1. De Aquino S.O., Tournebize R., Marraccini P., Mariac Cédric, Couderc Marie, Bethune Kevin, Cubry Philippe, Andrade A.C., Darracq O., Lepelley M., Crouzillat D., Kiwuka C., Anten N., Manel S., François O., Vigouroux Yves, Kochko Alexandre de, Poncet Valérie. (2019). Genotipagem por enriquecimento e captura direcionada de genes candidatos em Coffea canephora. 6 p. [en ligne]. (Anais do Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil ; 10). Simposio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 10., Vitória (BRA), 2019/10/8-10. ISSN 1984-9249.
    Identifiant IRD :  fdi:010078353
     Open Access  DOI  HAL

  2. De Aquino S.O., Tournebize R., Marraccini P., Mariac Cédric, Couderc Marie, Bethune Kevin, Cubry Philippe, Andrade A.C., Darracq O., Lepelley M., Crouzillat D., Kiwuka C., Anten N., Manel S., François O., Vigouroux Yves, Kochko Alexandre de, Poncet Valérie. (2019). Potencial adaptativo de Coffea canephora para projeções das alterações climáticas. 6 p. [en ligne]. (Anais do Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil ; 10). Simposio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 10., Vitória (BRA), 2019/10/08-10. ISSN 1984-9249.
    Identifiant IRD :  fdi:010078354
     Open Access  DOI  HAL

2018

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Diop B. M., Gueye M. C., Agbangba C. E., Cisse N., Deu M., Diack O., Fofana A., Kane N. A., Ndir K. N., Ndoye I., Ngom A., Leclerc C. Y. A., Piquet M., Vigouroux Yves, Zekraoui Leila, Billot C., Barnaud Adeline. (2018). Fonio (Digitaria exilis (Kippist) Stapf) : a socially embedded cereal for food and nutrition security in Senegal. Ethnobiology Letters, 9 (2), p. 150-165. ISSN 2159-8126.
    Identifiant IRD :  fdi:010075617
     Open Access  DOI  HAL

  2. Debieu Marilyne, Sine B., Passot S., Grondin Alexandre, Akata E., Gangashetty P., Vadez Vincent, Gantet Pascal, Fonceka D., Cournac Laurent, Hash C. T., Kane N. A., Vigouroux Yves, Laplaze Laurent. (2018). Response to early drought stress and identification of QTLs controlling biomass production under drought in pearl millet. PLoS One, 13 (10), p. e0201635 [19 p.]. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010074368
     Open Access  DOI  HAL

  3. Magwe-Tindo J., Wieringa J. J., Sonke B., Zapfack L., Vigouroux Yves, Couvreur Thomas, Scarcelli Nora. (2018). Guinea yam (Dioscorea spp., Dioscoreaceae) wild relatives identified using whole plastome phylogenetic analyses. Taxon, 67 (5), p. 905-915. ISSN 0040-0262.
    Identifiant IRD :  fdi:010074332
     Demander le PDF  DOI  HAL

  4. Mariac Cédric, Vigouroux Yves, Duponchelle Fabrice, Garcia-Davila C., Nunez Rodriguez Jesus, Desmarais E., Renno Jean-François. (2018). Metabarcoding by capture using a single COI probe (MCSP) to identify and quantify fish species in ichthyoplankton swarms. Plos One, 13 (9), p. e0202976 [15 p.]. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010074064
     Open Access  DOI  HAL

  5. Burgarella Concetta, Cubry Philippe, Kane N. A., Varshney R. K., Mariac Cédric, Liu X., Shi C. C., Thudi M., Couderc Marie, Xu X., Chitikineni A., Scarcelli Nora, Barnaud Adeline, Rhoné Bénédicte, Dupuy C., Francois O., Berthouly Cécile, Vigouroux Yves. (2018). A western Sahara centre of domestication inferred from pearl millet genomes. Nature Ecology and Evolution, 2 (9), 1377-1380. ISSN 2397-334X.
    Identifiant IRD :  fdi:010073956
     Demander le PDF  DOI  HAL

  6. Cubry Philippe, Dubreuil Tranchant Christine, Thuillet Anne-Céline, Monat C., Ndjiondjop M. N., Labadie K., Cruaud C., Engelen S., Scarcelli Nora, Rhoné Bénédicte, Burgarella Concetta, Dupuy C., Larmande Pierre, Wincker P., Francois O., Sabot François, Vigouroux Yves. (2018). The rise and fall of African rice cultivation revealed by analysis of 246 new genomes. Current Biology, 28 (14), 2274-2282 +6p. ISSN 0960-9822.
    Identifiant IRD :  fdi:010073684
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  7. Assoumane A., Blay C., Sanda A. K. A., Mariac Cédric, Pham Jean-Louis, Bezançon Gilles, Vigouroux Yves. (2018). Wild crop relative populations hot-spots of diversity are hot-spots of introgression in the case of pearl millet. Genetic Resources and Crop Evolution, 65 (4), p. 1187-1194. ISSN 0925-9864.
    Identifiant IRD :  fdi:010072473
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2017

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Vigouroux Yves, Darmency H. (2017). Assessing fitness parameters of hybrids between weed beets and transgenic sugar beets. Plant Breeding, 136 (6), p. 969-976. ISSN 0179-9541.
    Identifiant IRD :  fdi:010071916
     Demander le PDF  DOI  HAL

  2. Akakpo R., Scarcelli Nora, Chair H., Dansi A., Djedatin G., Thuillet Anne-Céline, Rhoné Bénédicte, Francois O., Alix K., Vigouroux Yves. (2017). Molecular basis of African yam domestication : analyses of selection point to root development, starch biosynthesis, and photosynthesis related genes. BMC Genomics, 18, p. art. 782 [9 p.]. ISSN 1471-2164.
    Identifiant IRD :  fdi:010071282
     Open Access  DOI  HAL

  3. Varshney R. K., Shi Chengcheng, Thudi M., Mariac Cédric, Wallace J., Qi P., Zhang H., Zhao Y. S., Wang X. Y., Rathore A., Srivastava R. K., Chitikineni A., Fan G. Y., Bajaj P., Punnuri S., Gupta S. K., Wang H., Jiang Y., Couderc Marie, Katta Mavsk, Paudel D. R., Mungra K. D., Chen W. B., Harris-Shultz K. R., Garg V., Desai N., Doddamani D., Kane N. A., Conner J. A., Ghatak A., Chaturvedi P., Subramaniam S., Yadav O. P., Berthouly Cécile, Hamidou F., Wang J. P., Liang X. M., Clotault Jeremy, Upadhyaya H. D., Cubry Philippe, Rhoné Bénédicte, Gueye M. C., Sunkar R., Dupuy C., Sparvoli F., Cheng S. F., Mahala R. S., Singh B., Yadav R. S., Lyons E., Datta S. K., Hash C. T., Devos K. M., Buckler E., Bennetzen J. L., Paterson A. H., Ozias-Akins P., Grando S., Wang J., Mohapatra T., Weckwerth W., Reif J. C., Liu X., Vigouroux Yves, Xu X. (2017). Pearl millet genome sequence provides a resource to improve agronomic traits in arid environments. Nature Biotechnology, 35 (10), 969-976 + 7 p. ISSN 1087-0156.
    Identifiant IRD :  fdi:010071241
     Demander le PDF  DOI  HAL

  4. Cubry Philippe, Vigouroux Yves, Francois O. (2017). The empirical distribution of singletons for geographic samples of DNA sequences. Frontiers in Genetics, 8, p. art. 139 [10 p.]. ISSN 1664-8021.
    Identifiant IRD :  fdi:010071038
     Open Access  DOI

  5. Barnaud Adeline, Vigouroux Yves, Diallo M. T., Saidou S. I., Piquet M., Barry M. B., Bakasso Y., Zekraoui Leila, Rivallan R., Kane N. A., Billot C. (2017). High selfing rate inferred for white fonio [Digitaria exilis (Kippist.) Stapf] reproductive system opens up opportunities for breeding programs. Genetic Resources and Crop Evolution, 64 (7), p. 1485-1490. ISSN 0925-9864.
    Identifiant IRD :  fdi:010071021
     Demander le PDF  DOI  HAL

  6. Tournebize R., Manel S., Vigouroux Yves, Munoz F., Kochko Alexandre de, Poncet Valérie. (2017). Two disjunct Pleistocene populations and anisotropic postglacial expansion shaped the current genetic structure of the relict plant Amborella trichopoda. PLOS One, 12 (8), p. e0183412 [18 p.]. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010070945
     Open Access  DOI  HAL

  7. Ousseini I. S., Bakasso Y., Kane N. A., Couderc Marie, Zekraoui Leila, Mariac Cédric, Manicacci D., Rhoné Bénédicte, Barnaud Adeline, Berthouly Salazar Cécile, Assoumane A., Moussa D., Moussa Tony, Vigouroux Yves. (2017). Myosin XI is associated with fitness and adaptation to aridity in wild pearl millet. Heredity, 119 (2), p. 88-94. ISSN 0018-067X.
    Identifiant IRD :  fdi:010070315
     Demander le PDF  DOI  HAL

  8. Ndour P. M. S., Gueye M., Barakat M., Ortet P., Bertrand-Huleux M., Pablo Anne-Laure, Dezette D., Chapuis Lardy Lydie, Assigbetsé Komi, Kane N. A., Vigouroux Yves, Achouak W., Ndoye I., Heulin T., Cournac Laurent. (2017). Pearl millet genetic traits shape rhizobacterial diversity and modulate rhizosphere aggregation. Frontiers in Plant Science, 8, art. 1288 [14 p.]. ISSN 1664-462X.
    Identifiant IRD :  fdi:010070825
     Open Access  DOI  HAL

  9. Gros-Balthazard M., Galimberti M., Kousathanas A., Newton C., Ivorra S., Paradis L., Vigouroux Yves, Carter R., Tengberg M., Battesti V., Santoni S., Falquet L., Pintaud Jean-Christophe, Terral J. F., Wegmann D. (2017). The discovery of wild date palms in Oman reveals a complex domestication history involving Centers in the Middle East and Africa. Current Biology, 27 (14), p. 2211-2218.e8 [17 p.]. ISSN 0960-9822.
    Identifiant IRD :  fdi:010070385
     Demander le PDF  DOI  HAL

  10. Scarcelli Nora, Chair H., Causse S., Vesta R., Couvreur Thomas, Vigouroux Yves. (2017). Crop wild relative conservation : wild yams are not that wild. Biological Conservation, 210 (A), p. 325-333. ISSN 0006-3207.
    Identifiant IRD :  fdi:010070356
     Demander le PDF  DOI  HAL

  11. Moreira P. A., Mariac Cédric, Zekraoui Leila, Couderc Marie, Rodrigues D. P., Clement C. R., Vigouroux Yves. (2017). Human management and hybridization shape treegourd fruits in the Brazilian Amazon Basin. Evolutionary Applications, 10 (6), p. 577-589. ISSN 1752-4571.
    Identifiant IRD :  fdi:010070217
     Demander le PDF  DOI  HAL

  12. Clement Y., Sarah G., Holtz Y., Homa F., Pointet S., Contreras S., Nabholz B., Sabot François, Saune L., Ardisson M., Bacilieri R., Besnard G., Berger A., Cardi C., De Bellis F., Fouet O., Jourda C., Khadari B., Lanaud C., Leroy T., Pot D., Sauvage C., Scarcelli Nora, Tregear James, Vigouroux Yves, Yahiaoui N., Ruiz M., Santoni S., Labouisse J. P., Pham Jean-Louis, David J., Glemin S. (2017). Evolutionary forces affecting synonymous variations in plant genomes. Plos Genetics, 13 (5), p. e1006799 [28 p.]. ISSN 1553-7404.
    Identifiant IRD :  fdi:010070210
     Open Access  DOI  HAL

  13. Sarah G., Homa F., Pointet S., Contreras S., Sabot François, Nabholz B., Santoni S., Saune L., Ardisson M., Chantret N., Sauvage C., Tregear James, Jourda C., Pot D., Vigouroux Yves, Chair H., Scarcelli Nora, Billot C., Yahiaoui N., Bacilieri R., Khadari B., Boccara M., Barnaud Adeline, Peros J. P., Labouisse J. P., Pham Jean-Louis, David J., Glemin S., Ruiz M. (2017). A large set of 26 new reference transcriptomes dedicated to comparative population genomics in crops and wild relatives. Molecular Ecology Resources, 17 (3), p. 565-580. ISSN 1755-098X.
    Identifiant IRD :  fdi:010070059
     Demander le PDF  DOI  HAL

  14. Glato K., Aidam A., Kane N. A., Bassirou D., Couderc Marie, Zekraoui Leila, Scarcelli Nora, Barnaud Adeline, Vigouroux Yves. (2017). Structure of sweet potato (Ipomoea batatas) diversity in West Africa covaries with a climatic gradient. Plos One, 12 (5), e0177697 [17 p.]. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010070104
     Open Access  DOI  HAL

  15. Fustier M. A., Brandenburg J. T., Boitard S., Lapeyronnie J., Eguiarte L. E., Vigouroux Yves, Manicacci D., Tenaillon M. I. (2017). Signatures of local adaptation in lowland and highland teosintes from whole-genome sequencing of pooled samples. Molecular Ecology, 26 (10), p. 2738-2756. ISSN 0962-1083.
    Identifiant IRD :  fdi:010070058
     Demander le PDF  DOI  HAL

  16. Diack O., Kane N. A., Berthouly Cécile, Gueye M. C., Diop B. M., Fofana A., Sy O., Tall H., Zekraoui Leila, Piquet M., Couderc Marie, Vigouroux Yves, Diouf D., Barnaud Adeline. (2017). New genetic insights into pearl millet diversity as revealed by characterization of early- and late-flowering landraces from Senegal. Frontiers in Plant Science, 8, p. art. 818 [9 p. ]. ISSN 1664-462X.
    Identifiant IRD :  fdi:010070053
     Open Access  DOI  HAL

  17. Moussouni S., Pintaud Jean-Christophe, Vigouroux Yves, Bouguedoura N. (2017). Diversity of Algerian oases date palm (Phoenix dactylifera L., Arecaceae) : heterozygote excess and cryptic structure suggest farmer management had a major impact on diversity. Plos One, 12 (4), p. e0175232 [14 p.]. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010069992
     Open Access  DOI  HAL

  18. Rhoné Bénédicte, Mariac Cédric, Couderc Marie, Berthouly Cécile, Ousseini I. S., Vigouroux Yves. (2017). No excess of cis-regulatory variation associated with intraspecific selection in wild pearl millet (Cenchrus americanus). Genome Biology and Evolution, 9 (2), p. 388-397. ISSN 1759-6653.
    Identifiant IRD :  fdi:010069377
     Open Access  DOI  HAL

  19. Maggia M. E., Vigouroux Yves, Renno Jean-François, Duponchelle Fabrice, Desmarais E., Nunez Rodriguez Jesus, Garcia-Davila C., Carvajal-Vallejos F. M., Paradis Emmanuel, Martin J. F., Mariac Cédric. (2017). DNA metabarcoding of Amazonian ichthyoplankton swarms. Plos One, 12 (1), p. e0170009 [14 p.]. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010068917
     Open Access  DOI  HAL

2016

Articles


  1. David J., Glemin S., Sarah G., Nabholtz B., Sabot François, Holtz Y., Homa F., Pointet S., Contreras S., Sauné L., Ardisson M., Bacilieri R., Khadari B., Lanaud C., Pot D., Sauvage C., Scarcelli Nora, Tregear James, Vigouroux Yves, Yahiaoui N., Ruiz M., Santoni S., Labouisse J.P., Pham Jean-Louis. (2016). La diversité génétique des plantes cultivées à l'heure de l'information génétique à haut débit : génomique comparative de la domestication. In : Apports des marqueurs moléculaires et de la génomique à l'utilisation des ressources génétiques pour l'amélioration des plantes. Le Sélectionneur Français, 67, 3-13. ISSN 0374-1621.
    Identifiant IRD :  fdi:010080163
     Open Access  DOI  HAL

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Mariac Cédric, Ousseini I. S., Alio A. K., Jugde H., Pham Jean-Louis, Bezançon Gilles, Ronfort J., Descroix Luc, Vigouroux Yves. (2016). Spatial and temporal variation in selection of genes associated with pearl millet varietal quantitative traits in situ. Frontiers in Genetics, 7, p. art. 130 [9 p.]. ISSN 1664-8021.
    Identifiant IRD :  fdi:010070191
     Open Access  DOI  HAL

  2. Ta K. N., Sabot François, Adam Hélène, Vigouroux Yves, De Mita Stéphane, Ghesquière Alain, Do N. V., Gantet Pascal, Jouannic Stefan. (2016). MiR2118-triggered phased siRNAs are differentially expressed during the panicle development of wild and domesticated African rice species. Rice, 9, art. 10 [14 p.]. ISSN 1939-8425.
    Identifiant IRD :  fdi:010068865
     Open Access  DOI  HAL

  3. Moreira P. A., Mariac Cédric, Scarcelli Nora, Couderc Marie, Rodrigues D. P., Clément C. R., Vigouroux Yves. (2016). Chloroplast sequence of treegourd (Crescentia cujete, Bignoniaceae) to study phylogeography and domestication. Applications in Plant Sciences, 4 (10), 1600048 [4 p.]. ISSN 2168-0450.
    Identifiant IRD :  fdi:010068304
     Demander le PDF  DOI  HAL

  4. Faye A., Pintaud Jean-Christophe, Baker W. J., Vigouroux Yves, Sonke B., Couvreur Thomas. (2016). Phylogenetics and diversification history of African rattans (Calamoideae, Ancistrophyllinae). In : Balslev H. (ed.), Bernal R. (ed.), Fay M.F. (ed.). Palms : emblems of tropical forests. Botanical Journal of the Linnean Society, 182 (2 (no spécial)), p. 256-271. ISSN 0024-4074.
    Identifiant IRD :  fdi:010068246
     Demander le PDF  DOI

  5. Faye A., Deblauwe Vincent, Mariac Cédric, Richard D., Sonké B., Vigouroux Yves, Couvreur Thomas. (2016). Phylogeography of the genus Podococcus (Palmae/Arecaceae) in Central African rain forests : climate stability predicts unique genetic diversity. Molecular Phylogenetics and Evolution, 105, p. 126-138. ISSN 1055-7903.
    Identifiant IRD :  fdi:010068232
     Demander le PDF  DOI

  6. Berthouly Cécile, Thuillet Anne-Céline, Rhone Bénédicte, Mariac Cédric, Ousseini I. S., Couderc Marie, Tenaillon M. I., Vigouroux Yves. (2016). Genome scan reveals selection acting on genes linked to stress response in wild pearl millet. Molecular Ecology, 25 (21), p. 5500-5512. ISSN 0962-1083.
    Identifiant IRD :  fdi:010068313
     Demander le PDF  DOI

  7. Passot S., Gnacko F., Moukouanga Daniel, Lucas Mikaël, Guyomarc'h S., Ortega B. M., Atkinson J. A., Belko M. N., Bennett M. J., Gantet Pascal, Wells D. M., Guedon Y., Vigouroux Yves, Verdeil J. L., Muller B., Laplaze Laurent. (2016). Characterization of pearl millet root architecture and anatomy reveals three types of lateral roots. Frontiers in Plant Science, 7, p. art. 829 [11p. ]. ISSN 1664-462X.
    Identifiant IRD :  fdi:010066972
     Open Access  DOI  HAL

  8. Berthouly Cécile, Mariac Cédric, Couderc Marie, Pouzadoux J., Floc'h J. B., Vigouroux Yves. (2016). Genotyping-by-Sequencing SNP identification for crops without a reference genome : using transcriptome based mapping as an alternative strategy. Frontiers in Plant Science, 7, 777 [11 p.]. ISSN 1664-462X.
    Identifiant IRD :  fdi:010067000
     Open Access  DOI  HAL

  9. Scarcelli Nora, Mariac Cédric, Couvreur Thomas, Faye A., Richard D., Sabot François, Berthouly Cécile, Vigouroux Yves. (2016). Intra-individual polymorphism in chloroplasts from NGS data : where does it come from and how to handle it ?. Molecular Ecology Resources, 16 (2), 434-445. ISSN 1755-098X.
    Identifiant IRD :  fdi:010066166
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2015

Articles


  1. Vigouroux Yves. (2015). Adaptation du mil à la sécheresse. In : Ardoin-Bardin Sandra (ed.), Arnaud N. (ed.), Boutin S. (ed.), Chotte Jean-Luc (ed.), Jarne P. (ed.), Kosuth P. (ed.), Lebaron P. (ed.), Servat Eric (ed.). Changement climatique : impacts et adaptations. Les Dossiers d'Agropolis International, 20, p. 79. ISSN 1628-4240.
    Identifiant IRD :  fdi:010063582
     Open Access  DOI

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Moumouni K. H., Kountche B. A., Jean M., Hash C. T., Vigouroux Yves, Haussmann B. I. G., Belzile F. (2015). Construction of a genetic map for pearl millet, Pennisetum glaucum (L.) R. Br., using a genotyping-by-sequencing (GBS) approach. Molecular Breeding, 35 (1), p. art. 5 [10 p.]. ISSN 1380-3743.
    Identifiant IRD :  fdi:010063913
     Demander le PDF  DOI

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. Bernoux Martial, Vigouroux Yves, Duponnois Robin, Emperaire Laure, Lalou Richard, Michon Geneviève. (2015). Le développement agricole à l'aune du changement climatique. In : Reinert M., Janicot Serge (ed.), Aubertin Catherine (ed.), Bernoux Martial (ed.), Dounias Edmond (ed.), Guégan Jean-François (ed.), Lebel Thierry (ed.), Mazurek Hubert (ed.), Sultan Benjamin (ed.), Sokona Y. (pref.), Moatti Jean-Paul (pref.). Changement climatique : quels défis pour le Sud ?. Marseille : IRD, p. 205-217. ISBN 978-2-7099-2168-8.
    Identifiant IRD :  fdi:010069589
     Open Access

  2. Bernoux Martial, Vigouroux Yves, Duponnois Robin, Emperaire Laure, Lalou Richard, Michon Geneviève. (2015). Agricultural development measured against climate change. In : Reinert M., Janicot Serge (ed.), Aubertin Catherine (ed.), Bernoux Martial (ed.), Dounias Edmond (ed.), Guégan Jean-François (ed.), Lebel Thierry (ed.), Mazurek Hubert (ed.), Sultan Benjamin (ed.), Sokona Y. (pref.), Moatti Jean-Paul (pref.). Climate change : what challenges for the South ?. Marseille : IRD, p. 205-217. ISBN 978-2-7099-2172-5.
    Identifiant IRD :  fdi:010069679
     Open Access

Directions d'ouvrages ou de revues


  1. Masse Dominique (coord.), Chotte Jean-Luc (coord.), Scopel E., Barnaud Adeline, Barthès Bernard, Berthouly Cécile, Chapuis Lardy Lydie, Seghieri Josiane, Serpantié Georges, Vigouroux Yves, et al. (2015). L'ingénierie écologique pour une agriculture durable dans les zones arides et semi-arides d'Afrique de l'Ouest. Montpellier : CSFD/Agropolis International, 64 p. (Les Dossiers Thématiques du CSFD ; 11). ISSN 1772-6964.
    Identifiant IRD :  fdi:010066477
     Open Access  DOI

2014

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Bakasso Y., Zaman-Allah M., Mariac Cédric, Billot C., Vigouroux Yves, Zongo J. D., Saadou M. (2014). Genetic diversity and population structure in a collection of roselle (Hibiscus sabdariffa L.) from Niger. Plant Genetic Resources-Characterization and Utilization, 12 (2), p. 207-214. ISSN 1479-2621.
    Identifiant IRD :  PAR00012455
     DOI

  2. Mariac Cédric, Scarcelli Nora, Pouzadou J., Barnaud Adeline, Billot C., Faye A., Kougbeadjo A., Maillol V., Martin G., Sabot François, Santoni S., Vigouroux Yves, Couvreur Thomas. (2014). Cost-effective enrichment hybridization capture of chloroplast genomes at deep multiplexing levels for population genetics and phylogeography studies. Molecular Ecology Resources, 14 (6), p. 1103-1113. ISSN 1755-098X.
    Identifiant IRD :  fdi:010062644
     Demander le PDF  DOI

  3. Orjuela J., Sabot François, Chéron Sophie, Vigouroux Yves, Adam Hélène, Chrestin Harold, Sanni K., Lorieux Mathias, Ghesquière Alain. (2014). An extensive analysis of the African rice genetic diversity through a global genotyping. Theoretical and Applied Genetics, 127 (10), p. 2211-2223. ISSN 0040-5752.
    Identifiant IRD :  fdi:010062581
     Demander le PDF  DOI

  4. Saidou A. A., Thuillet Anne-Céline, Couderc Marie, Mariac Cédric, Vigouroux Yves. (2014). Association studies including genotype by environment interactions : prospects and limits. Bmc Genetics, 15, p. art. 3. ISSN 1471-2156.
    Identifiant IRD :  fdi:010061961
     Open Access  DOI

  5. Saidou A. A., Clotault J., Couderc Marie, Mariac Cédric, Devos K. M., Thuillet Anne-Céline, Amoukou I. A., Vigouroux Yves. (2014). Association mapping, patterns of linkage disequilibrium and selection in the vicinity of the phytochrome C gene in pearl millet. Theoretical and Applied Genetics, 127 (1), p. 19-32. ISSN 0040-5752.
    Identifiant IRD :  fdi:010061735
     Demander le PDF  DOI

2013

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Kountche B. A., Hash C. T., Dodo H., Laoualy O., Sanogo M. D., Timbeli A., Vigouroux Yves, This D., Nijkamp R., Haussmann B. I. G. (2013). Development of a pearl millet Striga-resistant genepool : response to five cycles of recurrent selection under Striga-infested field conditions in West Africa. Field Crops Research, 154, p. 82-90. ISSN 0378-4290.
    Identifiant IRD :  fdi:010061411
     Demander le PDF  DOI

  2. Scarcelli Nora, Couderc Marie, Baco M. N., Egah J., Vigouroux Yves. (2013). Clonal diversity and estimation of relative clone age : application to agrobiodiversity of yam (Dioscorea rotundata). BMC Plant Biology, 13, p. 178. ISSN 1471-2229.
    Identifiant IRD :  fdi:010061431
     Open Access  DOI

  3. De Mita S., Thuillet Anne-Céline, Gay L., Ahmadi N., Manel S., Ronfort J., Vigouroux Yves. (2013). Detecting selection along environmental gradients : analysis of eight methods and their effectiveness for outbreeding and selfing populations. Molecular Ecology, 22 (5), p. 1383-1399. ISSN 0962-1083.
    Identifiant IRD :  fdi:010060714
     Demander le PDF  DOI

2012

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Clotault J., Thuillet Anne-Céline, Buiron Marylene, De Mita Stéphane, Couderc Marie, Haussmann B. I. G., Mariac Cédric, Vigouroux Yves. (2012). Evolutionary history of pearl millet (Pennisetum glaucum [L.] R. Br.) and selection on flowering genes since its domestication. Molecular Biology and Evolution, 29 (4), p. 1199-1212. ISSN 0737-4038.
    Identifiant IRD :  fdi:010055805
     Demander le PDF  DOI

  2. Barnaud Adeline, Vignes H., Risterucci A. M., Noyer J. L., Pham Jean-Louis, Blay Carole, Buiron Marylène, Vigouroux Yves, Billot C. (2012). Development of nuclear microsatellite markers for the fonio, digitaria exilis (poaceae), an understudied west african cereal. American Journal of Botany, 99 (3), p. E105-E107. ISSN 0002-9122.
    Identifiant IRD :  fdi:010055748
     Demander le PDF  DOI

2011

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Scarcelli Nora, Tostain Serge, Vigouroux Yves, Luong V., Baco M. N., Agbangla C., Dainou O., Pham Jean-Louis. (2011). Genetic structure of farmer-managed varieties in clonally-propagated crops. Genetica, 139 (8), p. 1055-1064. ISSN 0016-6707.
    Identifiant IRD :  fdi:010053870
     Demander le PDF  DOI

  2. Vigouroux Yves, Barnaud Adeline, Scarcelli Nora, Thuillet Anne-Céline. (2011). Biodiversity, evolution and adaptation of cultivated crops. Comptes Rendus Biologies, 334 (5-6), p. 450-457. ISSN 1631-0691.
    Identifiant IRD :  fdi:010053648
     Demander le PDF  DOI

  3. Scarcelli Nora, Barnaud Adeline, Eiserhardt W., Treier U. A., Seveno Marie, Anfray d' Amélie, Vigouroux Yves, Pintaud Jean-Christophe. (2011). A set of 100 chloroplast DNA primer pairs to study population genetics and phylogeny in monocotyledons. Plos One, 6 (5), p. e19954. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010053574
     Open Access  DOI

  4. Vigouroux Yves, Mariac Cédric, De Mita Stéphane, Pham Jean-Louis, Gerard B., Kapran I., Sagnard F., Deu M., Chantereau J., Ali A., Ndjeunga J., Luong V., Thuillet Anne-Céline, Saidou A. A., Bezançon Gilles. (2011). Selection for earlier flowering crop associated with climatic variations in the Sahel. Plos One, 6 (5), p. e19563. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010053525
     Open Access  DOI

  5. Adam Hélène, Marguerettaz M., Qadri R., Adroher B., Richaud F., Collin Myriam, Thuillet Anne-Céline, Vigouroux Yves, Laufs P., Tregear James, Jouannic Stefan. (2011). Divergent expression patterns of miR164 and CUP-SHAPED COTYLEDON genes in palms and other monocots : implication for the evolution of meristem function in angiosperms. Molecular Biology and Evolution, 28 (4), p. 1439-1454. ISSN 0737-4038.
    Identifiant IRD :  fdi:010053464
     Demander le PDF  DOI  HAL

  6. Mariac Cédric, Jehin L., Saidou Abdoul-Aziz, Thuillet Anne-Céline, Couderc M., Sire P., Jugde H., Adam Hélène, Bezançon Gilles, Pham Jean-Louis, Vigouroux Yves. (2011). Genetic basis of pearl millet adaptation along an environmental gradient investigated by a combination of genome scan and association mapping. Molecular Ecology, 20 (1), p. 80-91. ISSN 0962-1083.
    Identifiant IRD :  fdi:010053000
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2010

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Deu M., Sagnard F., Chantereau J., Calatayud C., Vigouroux Yves, Pham Jean-Louis, Mariac Cédric, Kapran I., Mamadou A., Gerard B., Ndjeunga J., Bezancon Gilles. (2010). Spatio-temporal dynamics of genetic diversity in Sorghum bicolor in Niger. Theoretical and Applied Genetics, 120 (7), p. 1301-1313. ISSN 0040-5752.
    Identifiant IRD :  fdi:010049475
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2009

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Saidou Abdoul-Aziz, Mariac Cédric, Luong Viviane, Pham Jean-Louis, Bezançon Gilles, Vigouroux Yves. (2009). Association studies identify natural variation at PHYC linked to flowering time and morphological variation in pearl millet. Genetics, 182 (3), p. 899-910. ISSN 0016-6731.
    Identifiant IRD :  fdi:010048422
     Demander le PDF  DOI

  2. Bezançon Gilles, Pham Jean-Louis, Deu M., Vigouroux Yves, Sagnard F., Mariac Cédric, Kapran I., Mamadou A., Gérard B., Ndjeunga J., Chantereau J. (2009). Changes in the diversity and geographic distribution of cultivated millet (Pennisetum glaucum (L.) R. Br.) and sorghum (Sorghum bicolor (L.) Moench) varieties in Niger between 1976 and 2003. Genetic Resources and Crop Evolution, 56 (2), p. 223-236. ISSN 0925-9864.
    Identifiant IRD :  fdi:010044318
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2008

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Vigouroux Yves, Glaubitz J. C., Matsuoka Y., Goodman M. M., Jesus S. G., Doebley J. (2008). Population structure and genetic diversity of new world maize races assessed by dna microsatellites. American Journal of Botany, 95 (10), p. 1240-1253. ISSN 0002-9122.
    Identifiant IRD :  fdi:010081643
     Open Access  DOI

  2. Oumar Ibrahima, Mariac Cédric, Pham Jean-Louis, Vigouroux Yves. (2008). Phylogeny and origin of pearl millet (Pennisetum glaucum L. R. Br) as revealed by microsatellite loci. Theoretical & Applied Genetics, 117 (4), p. 489-497. ISSN 0040-5752.
    Identifiant IRD :  fdi:010042734
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  3. Allinne C., Mariac Cédric, Vigouroux Yves, Bezançon Gilles, Couturon Emmanuel, Moussa Djibo, Tidjani Moussa, Pham Jean-Louis, Robert T. (2008). Role of seed flow on the pattern and dynamics of pearl millet (Pennisetum glaucum [L.] R. Br.) genetic diversity assessed by AFLP markers : a study in south-western Niger. Genetica, 133 (2), p. 167-178. ISSN 0016-6707.
    Identifiant IRD :  fdi:010042619
     Demander le PDF  DOI

  4. Deu M., Sagnard F., Chantereau J., Calatayud C., Hérault D., Mariac Cédric, Pham Jean-Louis, Vigouroux Yves, Kapran I., Traoré P. S., Mamadou A., Gérard B., Ndjeunga J., Bezancon Gilles. (2008). Niger-wide assessment of in situ sorghum genetic diversity with microsatellite markers. Theoretical and Applied Genetics, 116 (7), p. 903-913. ISSN 0040-5752.
    Identifiant IRD :  fdi:010042585
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Colloques, congrès, séminaires


  1. Saïdou Abdoul-Aziz, Mariac Cédric, Luong Viviane, Pham Jean-Louis, Bezançon Gilles, Vigouroux Yves. (2008). Détection de gènes associés à la variation du cycle de floraison chez une céréale majeure des zones semi-arides. In : Actes du colloque : biotechnologies végétales et gestion durable des résistances face à des stress biotiques et abiotiques. Montréal : AUF, p. 115. Journées Scientifiques du Réseau Biotechnologies Végétales et Amélioration des Plantes de l'AUF ; Colloque BIOTECH.Biotechnologies Végétales et Gestion Durable des Résistances Face à des Stress Biotiques et Abiotiques, 11., Rennes (FRA), 2008/06/30 2008/07/03.
    Identifiant IRD :  fdi:010043930

2006

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Scarcelli Nora, Tostain Serge, Vigouroux Yves, Agbangla C., Dainou O., Pham Jean-Louis. (2006). Farmers' use of wild relative and sexual reproduction in a vegetatively propagated crop. The case of yam in Benin. Molecular Ecology, 15 (9), p. 2421-2431. ISSN 0962-1083.
    Identifiant IRD :  fdi:010035705
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  2. Mariac Cédric, Luong Viviane, Kapran I., Mamadou A., Sagnard F., Deu M., Chantereau J., Gérard B., Ndjeunga J., Bezancon Gilles, Pham Jean-Louis, Vigouroux Yves. (2006). Diversity of wild and cultivated pearl millet accessions (Pennisetum glaucum [L.] R. Br.) in Niger assessed by microsatellite markers. Theoretical and Applied Genetics, 114 (1), p. 49-58. ISSN 0040-5752.
    Identifiant IRD :  fdi:010037707
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  3. Couvreur Thomas L. P., Billotte N., Risterucci A. M., Lara C., Vigouroux Yves, Ludena B., Pham Jean-Louis, Pintaud Jean-Christophe. (2006). Close genetic proximity between cultivated and wild Bactris gasipaes Kunth revealed by microsatellite markers in Western Ecuador. Genetic Resources and Crop Evolution, 53 (7), p. 1361-1373. ISSN 0925-9864.
    Identifiant IRD :  fdi:010037723
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2005

Colloques, congrès, séminaires


  1. Bezançon Gilles, Luong V., Vigouroux Yves, Mariac Cédric, Benoît L., Pham Jean-Louis, Luxereau Anne, Allinne C., Guengant Jean-Pierre, Kapran I., Mamadou M.A., Sagnard F., Deu M., Chantereau J., Ndjeuga J., Bissala H.Y., Gérard B., Amoukou I. (2005). Evolution de la diversité des mils et sorghos cultivés au Niger entre 1976 et 2003 : influence des facteurs naturels et anthropiques. In : Barbault R. (ed.), Le Duc J.P. (ed.). Actes de la conférence internationale : biodiversité science et gouvernance = Proceedings of the international conference : biodiversity science and gouvernance. Paris : MNHN, 1 p. Conférence Internationale : Biodiversité Science et Gouvernance, Paris (FRA), 2005/01/24-28.
    Identifiant IRD :  fdi:010038839
     Open Access
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