Hu G. B. auteur aut IRD Feng J. T. auteur aut IRD Xiang X. auteur aut IRD Wang J. B. auteur aut IRD Salojarvi J. auteur aut IRD Liu C. M. auteur aut IRD Wu Z. X. auteur aut IRD Zhang J. S. auteur aut IRD Liang X. M. auteur aut IRD Jiang Z. D. auteur aut IRD Liu W. auteur aut IRD Ou L. X. auteur aut IRD Li J. W. auteur aut IRD Fan G. Y. auteur aut IRD Mai Y. X. auteur aut IRD Chen C. J. auteur aut IRD Zhang X. T. auteur aut IRD Zheng J. K. auteur aut IRD Zhang Y. Q. auteur aut IRD Peng H. X. auteur aut IRD Yao L. X. auteur aut IRD Wai C. M. auteur aut IRD Luo X. P. auteur aut IRD Fu J. X. auteur aut IRD Tang H. B. auteur aut IRD Lan T. Y. auteur aut IRD Lai B. A. auteur aut IRD Sun J. H. auteur aut IRD Wei Y. Z. auteur aut IRD Li H. L. auteur aut IRD Chen J. Z. auteur aut IRD Huang X. M. auteur aut IRD Yan Q. auteur aut IRD Liu X. auteur aut IRD McHale L. K. auteur aut IRD Rolling L. auteur aut IRD Guyot Romain auteur aut IRD Sankoff D. auteur aut IRD Zheng C. F. auteur aut IRD Albert V. A. auteur aut IRD Ming R. A. auteur aut IRD Chen H. B. auteur aut IRD Xia R. auteur aut IRD Li J. G. auteur aut IRD text journalArticle eng text/pdf reformatted digital access Lychee is an exotic tropical fruit with a distinct flavor. The genome of cultivar 'Feizixiao' was assembled into 15 pseudochromosomes, totaling similar to 470 Mb. High heterozygosity (2.27%) resulted in two complete haplotypic assemblies. A total of 13,517 allelic genes (42.4%) were differentially expressed in diverse tissues. Analyses of 72 resequenced lychee accessions revealed two independent domestication events. The extremely early maturing cultivars preferentially aligned to one haplotype were domesticated from a wild population in Yunnan, whereas the late-maturing cultivars that mapped mostly to the second haplo-type were domesticated independently from a wild population in Hainan. Early maturing cultivars were probably developed in Guangdong via hybridization between extremely early maturing cultivar and late-maturing cultivar individuals. Variable deletions of a 3.7 kb region encompassed by a pair of CONSTANS-like genes probably regulate fruit maturation differences among lychee cultivars. These genomic resources provide insights into the natural history of lychee domestication and will accelerate the improvement of lychee and related crops. specialized CHINE 076 54 73-83 + [18 p.] 2022 1061-4036 https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010083934 10.1038/s41588-021-00971-3 1061-4036 [F B010083934] https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010083934 https://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/2022-02/010083934.pdf IRD - Base Horizon / Pleins textes 2022-02-04 2022-02-04 fdi:010083934 fre