De Aquino S.O. auteur aut IRD Tournebize R. auteur aut IRD Marraccini P. auteur aut IRD Mariac Cédric auteur aut IRD Couderc Marie auteur aut IRD Bethune Kevin auteur aut IRD Cubry Philippe auteur aut IRD Andrade A.C. auteur aut IRD Darracq O. auteur aut IRD Lepelley M. auteur aut IRD Crouzillat D. auteur aut IRD Kiwuka C. auteur aut IRD Anten N. auteur aut IRD Manel S. auteur aut IRD François O. auteur aut IRD Vigouroux Yves auteur aut IRD Kochko Alexandre de auteur aut IRD Poncet Valérie auteur aut IRD Simposio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 10., Vitória (BRA), 2019/10/8-10 text book por text/pdf reformatted digital access A captura direcionada de sequências acoplada ao sequenciamento de alto rendimento tornou-se um método poderoso para o estudo da variação de sequências genômicas. Usando o genoma disponível de C. canephora (tamanho estimado de 710 Mb/haplóide) como referência, projetamos sondas para 323 genes candidatos selecionados (CGs) visando capturar seus homeólogos em 293 acessos de C. canephorada Uganda, 12 clones do Brasil e um subconjunto de 19 indivíduos cobrindo todos os grupos de diversidade de C. canephora. Para um total de 324 indivíduos de C. canephora, projetamos, com sucesso, cerca de 19.000 sondas e identificamos mais de 16.000 polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) de qualidade, localizados dentro ou próximo a 318 genes anotados, gerando dados genotípicos para populações que estão localizadas em regiões que abrangem diferentes condições climáticas. Nós investigamos questões como desenho das sondas, cobertura do sequenciamento, eficiência da hibridização e captura,e estratégias de análise dos dados por bioinformática. specialized OUGANDA BRESIL 076 2019 10 en ligne [6 ] en ligne [6 ] en ligne [6 ] https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010078353 [F B010078353] https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010078353 https://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers20-11/010078353.pdf IRD - Base Horizon / Pleins textes 2020-09-11 2025-03-20 fdi:010078353 fre