Genotipagem por enriquecimento e captura direcionada de genes candidatos em Coffea canephora De Aquino, S.O. Tournebize, R. Marraccini, P. /Mariac, Cédric /Couderc, Marie /Bethune, Kevin /Cubry, Philippe Andrade, A.C. Darracq, O. Lepelley, M. Crouzillat, D. Kiwuka, C. Anten, N. Manel, S. François, O. /Vigouroux, Yves /Kochko, Alexandre de /Poncet, Valérie A captura direcionada de sequências acoplada ao sequenciamento de alto rendimento tornou-se um método poderoso para o estudo da variação de sequências genômicas. Usando o genoma disponível de C. canephora (tamanho estimado de 710 Mb/haplóide) como referência, projetamos sondas para 323 genes candidatos selecionados (CGs) visando capturar seus homeólogos em 293 acessos de C. canephorada Uganda, 12 clones do Brasil e um subconjunto de 19 indivíduos cobrindo todos os grupos de diversidade de C. canephora. Para um total de 324 indivíduos de C. canephora, projetamos, com sucesso, cerca de 19.000 sondas e identificamos mais de 16.000 polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) de qualidade, localizados dentro ou próximo a 318 genes anotados, gerando dados genotípicos para populações que estão localizadas em regiões que abrangem diferentes condições climáticas. Nós investigamos questões como desenho das sondas, cobertura do sequenciamento, eficiência da hibridização e captura,e estratégias de análise dos dados por bioinformática. 2019 text https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010078353 fdi:010078353 De Aquino S.O., Tournebize R., Marraccini P., Mariac Cédric, Couderc Marie, Bethune Kevin, Cubry Philippe, Andrade A.C., Darracq O., Lepelley M., Crouzillat D., Kiwuka C., Anten N., Manel S., François O., Vigouroux Yves, Kochko Alexandre de, Poncet Valérie. Genotipagem por enriquecimento e captura direcionada de genes candidatos em Coffea canephora. ; 10). 2019, en ligne [6 ] Simposio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 10., Vitória (BRA), 2019/10/8-10 PO OUGANDA BRESIL