Raymond O. auteur aut IRD Gouzy J. auteur aut IRD Just J. auteur aut IRD Badouin H. auteur aut IRD Verdenaud M. auteur aut IRD Lemainque A. auteur aut IRD Vergne P. auteur aut IRD Moja S. auteur aut IRD Choisne N. auteur aut IRD Pont C. auteur aut IRD Carrere S. auteur aut IRD Caissard J. C. auteur aut IRD Couloux A. auteur aut IRD Cottret L. auteur aut IRD Aury J. M. auteur aut IRD Szecsi J. auteur aut IRD Latrasse D. auteur aut IRD Madoui M. A. auteur aut IRD Francois L. auteur aut IRD Fu X. P. auteur aut IRD Yang S. H. auteur aut IRD Dubois A. auteur aut IRD Piola F. auteur aut IRD Larrieu A. auteur aut IRD Perez M. auteur aut IRD Labadie K. auteur aut IRD Perrier L. auteur aut IRD Govetto B. auteur aut IRD Labrousse Yoan auteur aut IRD Villand P. auteur aut IRD Bardoux C. auteur aut IRD Boltz V. auteur aut IRD Lopez-Roques C. auteur aut IRD Heitzler P. auteur aut IRD Vernoux T. auteur aut IRD Vandenbussche M. auteur aut IRD Quesneville H. auteur aut IRD Boualem A. auteur aut IRD Bendahmane A. auteur aut IRD Liu C. auteur aut IRD Le Bris M. auteur aut IRD Salse J. auteur aut IRD Baudino S. auteur aut IRD Benhamed M. auteur aut IRD Wincker P. auteur aut IRD Bendahmane M. auteur aut IRD text journalArticle eng text/pdf reformatted digital access Roses have high cultural and economic importance as ornamental plants and in the perfume industry. We report the rose whole-genome sequencing and assembly and resequencing of major genotypes that contributed to rose domestication. We generated a homozygous genotype from a heterozygous diploid modern rose progenitor, Rosa chinensis 'Old Blush'. Using single-molecule real-time sequencing and a metaassembly approach, we obtained one of the most comprehensive plant genomes to date. Diversity analyses highlighted the mosaic origin of 'La France', one of the first hybrids combining the growth vigor of European species and the recurrent blooming of Chinese species. Genomic segments of Chinese ancestry identified new candidate genes for recurrent blooming. Reconstructing regulatory and secondary metabolism pathways allowed us to propose a model of interconnected regulation of scent and flower color. This genome provides a foundation for understanding the mechanisms governing rose traits and should accelerate improvement in roses, Rosaceae and ornamentals. specialized 076 020 50 6 772-777 +7 2018 1061-4036 https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073063 10.1038/s41588-018-0110-3 1061-4036 [F B010073063] https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073063 https://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers18-06/010073063.pdf IRD - Base Horizon / Pleins textes 2018-07-03 2023-07-11 fdi:010073063 fre