@phdthesis{fdi:010008036,
  title = {{E}tude des caract{\'e}ristiques mol{\'e}culaires et virologiques de l'infection {\`a} {VIH}-1 survenue outre-mer},
  author = {{L}asky, {M}ariama},
  editor = {},
  language = {{FRE}},
  abstract = {{L}a caract{\'e}risation g{\'e}n{\'e}tique r{\'e}cente de nombreux isolats {VIH} provenant de diff{\'e}rentes zones g{\'e}ographiques a permis de subdiviser ces virus en deux groupes : le groupe {M} (pour "{M}ajor") contenant 9 sous-types g{\'e}n{\'e}tiquement diff{\'e}rents ({A} {\`a} {I}), et le groupe {O} (pour "{O}utlier") contenant les souches les plus divergentes. {L}es r{\'e}sultats actuels indiquent que la distribution des diff{\'e}rents g{\'e}notypes est h{\'e}t{\'e}rog{\`e}ne et que la pr{\'e}valence relative de chacun des sous-types diff{\`e}re selon les pays. {L}a variabilit{\'e} est pr{\'e}sente au niveau des propri{\'e}t{\'e}s biologiques "in vitro". {L}a caract{\'e}risation mol{\'e}culaire de virus isol{\'e}s de patients militaires infect{\'e}s par le {VIH}-1 lors de leur s{\'e}jour en {O}utre-mer a permis de mettre en {\'e}vidence la pr{\'e}sence de plusieurs sous-types {A}, {B}, {C}, {D}, {E} et {F}. {L}'analyse phylog{\'e}n{\'e}tique montre une grande h{\'e}t{\'e}rog{\'e}n{\'e}it{\'e} des souches, et fait appara{\^i}tre deux sous-groupes au sein des groupes {A} et {C}. {D}iff{\'e}rents motifs de la boucle {V}3 sont pr{\'e}sents {\`a} l'int{\'e}rieur d'un m{\^e}me sous-type. {L}'analyse des ph{\'e}notypes biologiques en fonction du nombre de lymphocytes {CD}4+ et de la dur{\'e}e d'infection montre que l'apparition des souches {SI} est corr{\'e}l{\'e}e de fa{\c{c}}on significative {\`a} un faible taux de lymphocytes {CD}4+ et {\`a} une longue dur{\'e}e d'infection dans la majorit{\'e} des cas et pour l'ensemble des sous-types {\'e}tudi{\'e}s. {C}ependant, on observe des exceptions sugg{\'e}rant que l'apparition des souches {SI} est associ{\'e}e aux propri{\'e}t{\'e}s virales d'une part et {\`a} l'{\'e}tat immunologique du patient d'autre part. {L}a pr{\'e}diction du ph{\'e}notype {\`a} partir des acides amin{\'e}s en position 11 et 25 de la boucle {V}3 est fiable dans la majorit{\'e} des cas. {C}ependant, des discordances sont observ{\'e}es dans le cas des souches {SI}. {C}es r{\'e}sultats nous permettent d'envisager l'{\'e}tude de l'histoire naturelle de l'infection {\`a} {VIH}-1 pour chaque sous-type et d'analyser l'impact des diff{\'e}rents sous-types sur le pronostic de la maladie. ({R}{\'e}sum{\'e} d'auteur)},
  keywords = {{BIOLOGIE} {MOLECULAIRE} ; {SIDA} ; {INFECTION} ; {DUREE} ; {SOUCHE} ; {GENOTYPE} ; {PHYLOGENIE} ; {POLYMORPHISME} {GENETIQUE} ; {VARIABILITE} {GENETIQUE} ; {IMMUNOLOGIE} ; {EPIDEMIOLOGIE} ; {PHENOTYPE} ; {PROPRIETE} {BIOLOGIQUE} ; {RETROVIRUS} ; {VIRUS} {HIV}-1 ; {LYMPHOCYTE} {CD}4+ ; {PERIODE} 1986 1995 ; {DJIBOUTI} ; {TCHAD} ; {COTE} {D}'{IVOIRE} ; {GABON} ; {CAMBODGE} ; {CAMEROUN} ; {CENTRAFRIQUE} ; {GUYANE} {FRANCAISE}},
  address = {{M}ontpellier},
  publisher = {{U}niversit{\'e} {M}ontpellier 2},
  pages = {160  multigr.},
  year = {1996},
  URL = {https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010008036},
}