2024

Articles référencés dans le Web of Science

1. Chevenet François, Fargette Denis, Bastide P., Vitre T., Guindon S. (2024). EvoLaps 2 : advanced phylogeographic visualization. Virus Evolution, 10 (1), p. vead078 [10 p.].
   Identifiant IRD :  fdi:010088888
    Open Access  DOI

2021

Articles référencés dans le Web of Science

1. Chevenet François, Fargette Denis, Guindon S., Banuls Anne-Laure. (2021). EvoLaps : a web interface to visualize continuous phylogeographic reconstructions. BMC Bioinformatics, 22 (1), p. 463 [12 p.]. ISSN 1471-2105.
   Identifiant IRD :  fdi:010083165
    Open Access  DOI  HAL

2019

Articles référencés dans le Web of Science

1. Castel G., Chevenet François, Razzauti M., Murri S., Marianneau P., Cosson J. F., Tordo N., Plyusnin A. (2019). Phylogeography of Puumala orthohantavirus in Europe. Viruses, 11 (8), art. 679 [16 p.].
   Identifiant IRD :  fdi:010076639
    Open Access  DOI  HAL


2. Chevenet François, Castel G., Jousselin E., Gascuel O. (2019). PastView : a user-friendly interface to explore ancestral scenarios. BMC Evolutionary Biology, 19 (1), art. 163 [8 p.]. ISSN 1471-2148.
   Identifiant IRD :  fdi:010076565
    Open Access  DOI  HAL

2018

Articles référencés dans le Web of Science

1. Duchemin W., Gence G., Chifolleau A. M. A., Arvestad L., Bansal M. S., Berry V., Boussau B., Chevenet François, Comte N., Davin A. A., Dessimoz C., Dylus D., Hasic D., Mallo D., Planel R., Posada D., Scornavacca C., Szollosi G., Zhang L. X., Tannier E., Daubin V. (2018). RecPhyloXML : a format for reconciled gene trees. Bioinformatics, 34 (21), p. 3646-3652. ISSN 1367-4803.
   Identifiant IRD :  fdi:010074453
    Open Access  DOI  HAL


2. Berry V., Chevenet François, Doyon J. P., Jousselin E. (2018). A geography-aware reconciliation method to investigate diversification patterns in host/parasite interactions. Molecular Ecology Resources, 18 (5), p. 1173-1184. ISSN 1755-098X.
   Identifiant IRD :  fdi:010073767
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2016

Articles référencés dans le Web of Science

1. Chevenet François, Doyon J. P., Scornavacca C., Jacox E., Jousselin E., Berry V. (2016). SylvX : a viewer for phylogenetic tree reconciliations. Bioinformatics, 32 (4), p. 608-613. ISSN 1367-4803.
   Identifiant IRD :  PAR00014435
    DOI

2014

Articles référencés dans le Web of Science

1. Fiorini N., Lefort V., Chevenet François, Berry V., Chifolleau A. M. A. (2014). CompPhy : a web-based collaborative platform for comparing phylogenies. Bmc Evolutionary Biology, 14, p. art. 253 [9 p.]. ISSN 1471-2148.
   Identifiant IRD :  fdi:010063158
    Open Access  DOI

2013

Articles référencés dans le Web of Science

1. Jousselin E., Cruaud A., Genson G., Chevenet François, Foottit R. G., Coeur d'Acier A. (2013). Is ecological speciation a major trend in aphids ? Insights from a molecular phylogeny of the conifer-feeding genus Cinara. Frontiers in Zoology, 10, ISSN 1742-9994.
   Identifiant IRD :  fdi:010061190
    Demander le PDF  DOI  HAL


2. El Baidouri F., Diancourt L., Berry V., Chevenet François, Pratlong F., Marty P., Ravel C. (2013). Genetic structure and evolution of the Leishmania genus in Africa and Eurasia : what does MLSA tell us. Plos Neglected Tropical Diseases, 7 (6), p. e2255. ISSN 1935-2735.
   Identifiant IRD :  fdi:010060488
    Open Access  DOI


3. Chevenet François, Jung Matthieu, Peeters Martine, De Oliveira T., Gascuel O. (2013). Searching for virus phylotypes. Bioinformatics Advance Acces, 10 p. ISSN 1367-4803.
   Identifiant IRD :  fdi:010058061
    Demander le PDF  DOI  HAL

2010

Articles référencés dans le Web of Science

1. Chevenet François, Croce O., Hébrard M., Christen R., Berry V. (2010). ScripTree : scripting phylogenetic graphics. Bioinformatics, 26 (8), p. 1125-1126. ISSN 1367-4803.
   Identifiant IRD :  PAR00005747
    DOI

2008

Articles

1. Croce O., Chevenet François, Christen R. (2008). OligoHeatMap (OHM) : an online tool to estimate and display hybridizations of oligonucleotides onto DNA sequences. Nucleic Acids Research, 36 (Suppl S), p. W154-W156. ISSN 0305-1048.
   Identifiant IRD :  fdi:010042722
    Demander le PDF  DOI  HAL


2. Dereeper A., Guignon V., Blanc G., Audic S., Buffet S., Chévenet François, Dufayard J.F., Guindon S., Lefort V., Lescot M., Claverie J.M., Gascuel O. (2008). Phylogeny.fr: robust phylogenetic analysis for the non-specialist. Nucleic Acids Research, 36 (Web Server issue), W465-W469.
   Identifiant IRD :  PAR00002859
    DOI  HAL

Articles référencés dans le Web of Science

1. Dereeper A., Guignon V., Blanc G., Audic S., Buffet S., Chevenet François, Dufayard J. F., Guindon S., Lefort V., Lescot M., Claverie J. M., Gascuel O. (2008). Phylogeny.fr : robust phylogenetic analysis for the non-specialist. Nucleic Acids Research, 36 (Suppl S), p. W465-W469. ISSN 0305-1048.
   Identifiant IRD :  fdi:010042723
    Demander le PDF  DOI

2007

Articles référencés dans le Web of Science

1. Godreuil Sylvain, Torrea G., Terru D., Chevenet François, Diagbouga S., Supply P., Van de Perre P., Carrière C., Banuls Anne-Laure. (2007). First molecular epidemiology study of Mycobacterium tuberculosis in Burkina Faso. Journal of Clinical Microbiology, 45 (3), p. 921-927. ISSN 0095-1137.
   Identifiant IRD :  fdi:010057515
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2006

Articles référencés dans le Web of Science

1. Chevenet François, Brun C., Banuls Anne-Laure, Jacq B., Christen R. (2006). TreeDyn : towards dynamic graphics and annotations for analyses of trees. BMC Bioinformatics, 7, ISSN 1471-2105.
   Identifiant IRD :  fdi:010074606
    Open Access


2. Baudot A., Martin D., Mouren P., Chevenet François, Guenoche A., Jacq B., Brun C. (2006). PRODISTIN Web Site : a tool for the functional classification of proteins from interaction networks. Bioinformatics, 22 (2), p. 248-250.
   Identifiant IRD :  fdi:010052000
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3. Biron David, Brun C., Lefèvre Thierry, Lebarbenchon Camille, Loxdale H.D., Chévenet François, Brizard Jean-Paul, Thomas F. (2006). The pitfalls of proteomics experiments without the correct use of bioinformatics tools. Proteomics, 6 (20), p. 5577-5596. ISSN 1615-9853.
   Identifiant IRD :  fdi:010037710
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2005

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1. Simon O., Chevenet François, Williams T., Caballero P., Lopez Ferber M. (2005). Physical and partial genetic map of Spodoptera frugiperda nucleopolyhedrovirus (SfMNPV) genome. Virus Genes, 30 (3), p. 403-417. ISSN 0920-8569.
   Identifiant IRD :  fdi:010042963
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