2023

Articles référencés dans le Web of Science

1. Peduzzi C., Sagia Angeliki, Burokiene D., Nagy I. K., Fischer-Le Saux M., Portier P., Dereeper Alexis, Cunnac Sébastien, Roman-Reyna V., Jacobs J. M., Bragard C., Koebnik Ralf. (2023). Complete genome sequencing of three clade-1 Xanthomonads reveals genetic determinants for a lateral flagellin and the biosynthesis of coronatine-like molecules in Xanthomonas. Phytopathology, 113 (7), p. 1185-1191. ISSN 0031-949X.
   Identifiant IRD :  fdi:010089621
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2. Arra Y., Auguy Florence, Stiebner M., Chéron Sophie, Wudick M. M., Miras M., Schepler-Luu V., Köhler S., Cunnac Sébastien, Frommer W. B., Albar Laurence. (2023). Rice Yellow Mottle Virus resistance by genome editing of the Oryza sativa L. ssp. japonica nucleoporin gene OsCPR5.1 but not OsCPR5.2. Plant Biotechnology Journal, Early access, p. [13 p.]. ISSN 1467-7644.
   Identifiant IRD :  fdi:010088843
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3. Schepler-Luu V., Sciallano C., Stiebner M., Ji C. H., Boulard Gabriel, Diallo A., Auguy Florence, Char S. N., Arra Y., Schenstnyi K., Buchholzer M., Loo E. P. I., Bilaro A. L., Lihepanyama D., Mkuya M., Murori R., Oliva R., Cunnac Sébastien, Yang B., Szurek Boris, Frommer W. B. (2023). Genome editing of an African elite rice variety confers resistance against endemic and emerging Xanthomonas oryzae pv. oryzae strains. eLife, 12, p. e84864 [26 p.]. ISSN 2050-084X.
   Identifiant IRD :  fdi:010090228
    Open Access  DOI


4. Sciallano C., Auguy Florence, Boulard Gabriel, Szurek Boris, Cunnac Sébastien. (2023). The complete genome resource of Xanthomonas oryzae pv. oryzae CIX2779 includes the first sequence of a plasmid for an African representative of this rice pathogen. Molecular Plant-Microbe Interactions, 36 (1), p. 73-77. ISSN 0894-0282.
   Identifiant IRD :  fdi:010088105
    Open Access  DOI

2022

Articles

1. Orjuela J., Comte Aurore, Ravel S., Charriat F., Vi T., Sabot François, Cunnac Sébastien. (2022). CulebrONT : a streamlined long reads multi-assembler pipeline for prokaryotic and eukaryotic genomes. Peer Community Journal, 2, e46 [9 p.]. ISSN 2804-3871.
   Identifiant IRD :  fdi:010089128
    Open Access  DOI  HAL

Articles référencés dans le Web of Science

1. Doucoure H., Auguy Florence, Blanvillain-Baufume S., Fabre S., Gabriel M., Thomas E., Dambreville F., Sciallano C., Szurek Boris, Koita O., Verdier Valérie, Cunnac Sébastien. (2022). The rice ILI2 locus is a bidirectional target of the African Xanthomonas oryzae pv. oryzae major transcription activator-like effector TalC but does not contribute to disease susceptibility. International Journal of Molecular Sciences, 23 (10), 5559 [20 p.].
   Identifiant IRD :  fdi:010085204
    Open Access  DOI  HAL


2. Goettelmann F., Roman-Reyna V., Cunnac Sébastien, Jacobs J. M., Bragard C., Studer B., Koebnik Ralf, Koelliker R. (2022). Complete genome assemblies of all Xanthomonas translucens pathotype strains reveal three genetically distinct clades. Frontiers in Microbiology, 12, 817815 [13 p.].
   Identifiant IRD :  fdi:010084608
    Open Access  DOI  HAL

2021

Articles référencés dans le Web of Science

1. Reshetnyak G., Jacobs J. M., Auguy Florence, Sciallano C., Claude L., Medina C., Perez-Quintero A. L., Comte Aurore, Thomas E., Bogdanove A., Koebnik Ralf, Szurek Boris, Dievart A., Brugidou Christophe, Lacombe Séverine, Cunnac Sébastien. (2021). An atypical class of non-coding small RNAs is produced in rice leaves upon bacterial infection. Scientific Reports - Nature, 11 (1), 24141 [20 p.]. ISSN 2045-2322.
   Identifiant IRD :  fdi:010083857
    Open Access  DOI  HAL


2. Duy P. N., Lan D. T., Thu H. P., Thu H. P. T., Thanh H. N., Pham N. P., Auguy Florence, Thu H. B. T., Manh T. B., Cunnac Sébastien, Pham X. H. (2021). Improved bacterial leaf blight disease resistance in the major elite Vietnamese rice cultivar TBR225 via editing of the OsSWEET14 promoter. PLoS One, 16 (9), p. e0255470 [16 p.]. ISSN 1932-6203.
   Identifiant IRD :  fdi:010083878
    Open Access  DOI  HAL

2020

Articles référencés dans le Web of Science

1. Tall H., Tekete C., Noba K., Koita O., Cunnac Sébastien, Hutin Mathilde, Szurek Boris, Verdier Valérie. (2020). Confirmation report of bacterial blight caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae on rice in Senegal. Plant Disease, 104 (3), p. 968-968. ISSN 0191-2917.
   Identifiant IRD :  fdi:010079688
    Open Access  DOI


2. Tekete C., Cunnac Sébastien, Doucouré H., Dembele M., Keita I., Sarra S., Dagno K., Koita O., Verdier Valérie. (2020). Characterization of new races of Xanthomonas oryzae pv. oryzae in Mali informs resistance gene deployment. Phytopathology, 110 (2), p. 267-277. ISSN 0031-949X.
   Identifiant IRD :  fdi:010077878
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2019

Articles référencés dans le Web of Science

1. Oliva R., Ji C. H., Atienza-Grande G., Huguet-Tapia J. C., Perez-Quintero A., Li T., Eom J. S., Li C. H., Nguyen H., Liu B., Auguy Florence, Sciallano C., Luu V., Dossa G. S., Cunnac Sébastien, Schmidt S. M., Slamet-Loedin I. H., Cruz C. V., Szurek Boris, Frommer W. B., White F. F., Yang B. (2019). Broad-spectrum resistance to bacterial blight in rice using genome editing. Nature Biotechnology, 37 (11), p. 1344-1350 + 1 p. ISSN 1087-0156.
   Identifiant IRD :  fdi:010077322
    Open Access  DOI


2. Gluck-Thaler E., Cerutti A., Quintero A. L. P., Pesce C., Jauneau A., Vancheva T., Lang J. M., Allen C., Verdier-Michel V. V., Gagnevin L., Szurek Boris, Cunnac Sébastien, Bragard C., Leach J. E., Noel L. D., Slot J., Koebnik Ralf, Jacobs J. M. (2019). Ebb and flow of vascular pathogenesis through repeated gain and loss of a molecular switch. Molecular Plant-Microbe Interactions, 32 (Suppl. 10), p. 22. Congress of International Society for Molecular Plant Microbe Interactions (IS-MPMI), 18., Glasgow (GBR), 2019/07/14-18. ISSN 0894-0282.
   Identifiant IRD :  PAR00019872
    DOI  HAL

2018

Articles référencés dans le Web of Science

1. Tran T. T., Doucoure H., Hutin M., Nino L. M. J., Szurek Boris, Cunnac Sébastien, Koebnik Ralf. (2018). Efficient enrichment cloning of TAL effector genes from Xanthomonas. Methodsx, 5, p. 1027-1032. ISSN 2215-0161.
   Identifiant IRD :  fdi:010074855
    Open Access  DOI  HAL


2. Tran T. T., Perez-Quintero A. L., Wonni I., Carpenter S. C. D., Yu Y. H., Wang L., Leach J. E., Verdier Valérie, Cunnac Sébastien, Bogdanove A. J., Koebnik Ralf, Hutin M., Szurek Boris. (2018). Functional analysis of African Xanthomonas oryzae pv. oryzae TALomes reveals a new susceptibility gene in bacterial leaf blight of rice. PLoS Pathogens, 14 (6), e1007092 [25 p.]. ISSN 1553-7366.
   Identifiant IRD :  fdi:010073703
    Open Access  DOI  HAL


3. Doucoure H., Perez-Ouintero A. L., Reshetnyak G., Tekete C., Auguy Florence, Thomas E., Koebnik Ralf, Szurek Boris, Koita O., Verdier Valérie, Cunnac Sébastien. (2018). Functional and genome sequence-driven characterization of TAL effector gene repertoires reveals novel variants with altered specificities in closely related Malian Xanthomonas oryzae pv. oryzae strains. Frontiers in Microbiology, 9, 1657 [17 p.]. ISSN 1664-302X.
   Identifiant IRD :  fdi:010073730
    Open Access  DOI  HAL


4. Perez-Quintero A. L., Lamy Léo, Zarate C. A., Cunnac Sébastien, Doyle E., Bogdanove A., Szurek Boris, Dereeper Alexis. (2018). DaTALbase : a database for genomic and transcriptomic data related to TAL effectors. Molecular Plant-Microbe Interactions, 31 (4), p. 471-480. ISSN 0894-0282.
   Identifiant IRD :  fdi:010072484
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2017

Articles référencés dans le Web of Science

1. Tall H., Noba K., Szurek Boris, Cunnac Sébastien, Tekete C., Verdier Valérie. (2017). Report and characterization of bacterial diseases caused by Xanthomonas oryzae in Senegal. Phytopathology, 107 (12), p. 101-101. Annual Meeting the American Phytopathological Society (APS), San Antonio (USA), 2017/08/05-09. ISSN 0031-949X.
   Identifiant IRD :  fdi:010072353
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2. Jacobs J. M., Vancheva T., Cerutti A., Lang J. M., Pesce C., Noel L., Allen C., Leach J. E., Szurek Boris, Cunnac Sébastien, Bragard C. G., Koebnik Ralf. (2017). Evolutionary and biological basis of Xanthomonas systemic pathogenesis of plants. Phytopathology, 107 (12), p. 86-86. ISSN 0031-949X.
   Identifiant IRD :  fdi:010072351
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3. Tollenaere Charlotte, Lacombe Séverine, Wonni I., Barro M., Ndougonna C., Gnacko F., Sérémé D., Jacobs J.M., Hébrard Eugénie, Cunnac Sébastien, Brugidou Christophe. (2017). Virus-bacteria rice co-infection in Africa : field estimation, reciprocal effects, molecular mechanisms, and evolutionary implications. Frontiers in Plant Sciences, 8, 645 [13 p. en ligne]. ISSN 1664-462X.
   Identifiant IRD :  fdi:010069662
    Open Access  DOI  HAL


4. Blanvillain-Baufumé Servane, Reschke M., Sole M., Auguy Florence, Doucoure H., Szurek Boris, Meynard D., Portefaix M., Cunnac Sébastien, Guiderdoni E., Boch J., Koebnik Ralf. (2017). Targeted promoter editing for rice resistance to Xanthomonas oryzae pv. oryzae reveals differential activities for SWEET14-inducing TAL effectors. Plant Biotechnology Journal, 15 (3), p. 306-317. ISSN 1467-7644.
   Identifiant IRD :  fdi:010069446
    Open Access  DOI  HAL

2016

Articles référencés dans le Web of Science

1. Cunnac Sébastien, Gantet P., Ghesquière Alain, Guiderdoni E., Doan Trung Luu. (2016). Le riz, une plante modèle à croquer !. In : Les top-modèles végétaux : ce que les plantes nous apprennent du vivant. Biofutur, (380), p. 30-34. ISSN 0294-3506.
   Identifiant IRD :  fdi:010067382
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2015

Articles

1. Pesce C., Bolot S., Cunnac Sébastien, Portier P., Fischer-Le Saux M., Jacques M.J., Gagenvin L., Arlat M., Noël L.D., Carrère S., Bragard C., Koebnik Ralf. (2015). High-quality draft genome sequence of the Xanthomonas translucens pv. cerealis pathotype strain CFBP 2541. Genome Announcements, 3 (1), art. no e01574-14 [2 p.]. ISSN 2169-8287.
   Identifiant IRD :  fdi:010072985
    Open Access  DOI  HAL

Articles référencés dans le Web of Science

1. Tran T. T., Nga N. V., Ngan P. T., Hong N. T., Szurek Boris, Koebnik Ralf, Ham L. H., Cuong H. V., Cunnac Sébastien. (2015). Confirmation of bacterial leaf streak of rice caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzicola in Vietnam. Plant Disease, 99 (12), p. 1853. ISSN 0191-2917.
   Identifiant IRD :  PAR00014080
    DOI  HAL


2. Perez-Quintero Alvaro, Lamy L., Gordon J. L., Escalon A., Cunnac Sébastien, Szurek Boris, Gagnevin L. (2015). QueTAL : a suite of tools to classify and compare TAL effectors functionally and phylogenetically. Frontiers in Plant Science, 6, p. art. 545 [16 p.]. ISSN 1664-462X.
   Identifiant IRD :  fdi:010064926
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2013

Articles référencés dans le Web of Science

1. Baufume Servane, Meynard D., Reschke M., Sole M., Cunnac Sébastien, Szurek Boris, Guiderdoni E., Boch J., Koebnik Ralf. (2013). New rice resistance genes via targeted genome editing. Phytopathology, 103 (6 suppl. 2), p. 13-13. ISSN 0031-949X.
   Identifiant IRD :  fdi:010060613
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2. Boch J., Boureau T., Brin C., Cunnac Sébastien, David P., Feng J. X., Hajri A., Hutin M., Koebnik Ralf, Mo W. L., Pesce C., Poussier S., Streubel J., Szurek Boris, Tang J. L., Tang W., Tran T. T., Verdier Valérie, Wu F., Zhao S. (2013). Contribution of type III/TAL effectors to pathogenicity. Phytopathology, 103 (6 suppl. 2), p. 170-170. ISSN 0031-949X.
   Identifiant IRD :  fdi:010060618
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3. Gagnevin L., Roux B., Bolot S., Carrere S., Charbit E., Cunnac Sébastien, Jacques M. A., Noel L. D., Arlat M., Koebnik Ralf. (2013). Genome and transcriptome analysis to reveal adaptation to new environments and hosts. Phytopathology, 103 (6 suppl. 2), p. 170-171. ISSN 0031-949X.
   Identifiant IRD :  fdi:010060619
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4. Perez-Quintero A. L., Rodriguez L. M., Dereeper Alexis, Lopez C., Koebnik Ralf, Szurek Boris, Cunnac Sébastien. (2013). An improved method for TAL effectors DNA-binding sites prediction reveals functional convergence in TAL repertoires of Xanthomonas oryzae strains. Plos One, 8 (7), p. e68464. ISSN 1932-6203.
   Identifiant IRD :  fdi:010060556
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2012

Articles référencés dans le Web of Science

1. Lindeberg M., Cunnac Sébastien, Collmer A. (2012). Pseudomonas syringae type III effector repertoires : last words in endless arguments. Trends in Microbiology, 20 (4), p. 199-208. ISSN 0966-842X.
   Identifiant IRD :  fdi:010055844
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