Marc Choisy dans la base Horizon  

2023

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Djidjou-Demasse Ramsès, Sofonea M. T., Choisy Marc, Alizon S. (2023). Within-host evolutionary dynamics of antimicrobial quantitative resistance. Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 18, p. 24 [ p.]. ISSN 0973-5348.
    Identifiant IRD :  fdi:010090281

  2. Brindle H. E., Bastos L. S., Christley R., Contamin Lucie, Dang L. H., Anh D. D., French N., Griffiths M., Nadjm B., van Doorn H. R., Thai P. Q., Duong T. N., Choisy Marc. (2023). The spatio-temporal distribution of acute encephalitis syndrome and its association with climate and landcover in Vietnam. BMC Infectious Diseases, 23 (1), p. 403 [15 p.].
    Identifiant IRD :  fdi:010088235

  3. Ha H. T. A., Nguyen P. T. L., Hung T. T. M., Tuan L. A., Thuy B. T., Lien T. H. M., Thai P. D., Thanh N. H., Bich V. T. N., Anh T. H., Hanh N. T. H., Minh N. T., Thanh D. P., Mai S. N. T., The H. C., Trung N. V., Thu N. H., Duong T. N., Anh D. D., Ngoc P. T., Banuls Anne-Laure, Choisy Marc, van Doorn H. R., Suzuki M., Hoang T. H. (2023). Prevalence and associated factors of optrA-positive-Enterococcus faecalis in different reservoirs around farms in Vietnam. Antibiotics, 12 (6), 954 [19 p.]. ISSN 2079-6382.
    Identifiant IRD :  fdi:010088195

2022

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Danesh G., Saulnier E., Gascuel O., Choisy Marc, Alizon S. (2022). TiPS : rapidly simulating trajectories and phylogenies from compartmental models. Methods in Ecology and Evolution, [Early access], p. [9 p.]. ISSN 2041-210X.
    Identifiant IRD :  fdi:010086721

  2. Nguyen P. T. L., Ngo T. H. H., Tran T. M. H., Vu T. N. B., Le V. T., Tran H. A., Pham D. T., Nguyen H., Tran D. L., Nguyen T. P. L., Nguyen T. T. T., Tran N. D., Dang D. A., Banuls Anne-Laure, Choisy Marc, van Doorn H. R., Suzuki M., Tran H. H. (2022). Genomic epidemiological analysis of mcr-1-harboring Escherichia coli collected from livestock settings in Vietnam. Frontiers in Veterinary Science, 9, p. 1034610 [12 p.].
    Identifiant IRD :  fdi:010086463

  3. Nguyen P. T. L., Tran H. T. M., Tran H. A., Pham T. D., Luong T. M., Nguyen T. H., Nguyen L. T. P., Nguyen T. T. T., Hoang H. T. A., Nguyen C., Tran D. N., Dang A. D., Suzuki M., Le T. V., Banuls Anne-Laure, Choisy Marc, Van Doorn R. H., Tran H. H. (2022). Carriage of plasmid-mediated colistin resistance-1-positive Escherichia coli in humans, animals, and environment on farms in Vietnam. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 107 (1), p. 65-71. ISSN 0002-9637.
    Identifiant IRD :  fdi:010086301

  4. Richard Quentin, Choisy Marc, Lefèvre Thierry, Djidjou-Demasse Ramsès. (2022). Human-vector malaria transmission model structured by age, time since infection and waning immunity. Nonlinear Analysis-Real World Applications, 63, 103393 [34 p.]. ISSN 1468-1218.
    Identifiant IRD :  fdi:010083174

2021

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Cuong N. V., Ly N. P. C., Van N. T. B., Phu D. H., Kiet B. T., Hien V. B., Padungtod P., Thwaites G., Choisy Marc, Carrique-Mas J. (2021). Feasibility study of a field survey to measure antimicrobial usage in humans and animals in the Mekong Delta region of Vietnam. JAC - Antimicrobial Resistance, 3 (3), p. dlab107 [11 p.].
    Identifiant IRD :  fdi:010084252

  2. Selinger Christian, Choisy Marc, Alizon S. (2021). Predicting COVID-19 incidence in French hospitals using human contact network analytics. International Journal of Infectious Diseases, 111, p. 100-107. ISSN 1201-9712.
    Identifiant IRD :  fdi:010083292

  3. Cuong N. V., Kiet B. T., Hien V. B., Truong B. D., Phu D. H., Thwaites G., Choisy Marc, Carrique-Mas J. (2021). Antimicrobial use through consumption of medicated feeds in chicken flocks in the Mekong Delta of Vietnam : a three-year study before a ban on antimicrobial growth promoters. PLoS One, 16 (4), p. e0250082 [11 p.]. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010081523

  4. Richard Quentin, Alizon S., Choisy Marc, Sofonea M. T., Djidjou-Demasse Ramsès. (2021). Age-structured non-pharmaceutical interventions for optimal control of COVID-19 epidemic. PLoS Computational Biology, 17 (3), e1008776 [25 p.]. ISSN 1553-734X.
    Identifiant IRD :  fdi:010081125

2020

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Telle O., Choisy Marc, Somlor S., Benkimoun S., Pommelet V., Grandadam M. (2020). Dengue geography in Vientiane Capital, 2012-2019 : combining multiple datasets to understand virus spread in an endemic city. International Journal of Infectious Diseases, 101 (1), p. 234-234. ISSN 1201-9712.
    Identifiant IRD :  fdi:010080900

  2. Calvez E., Pommelet V., Somlor S., Pompon Julien, Viengphouthong S., Bounmany P., Chindavong T. A., Xaybounsou T., Prasayasith P., Keosenhom S., Brey P. T., Telle O., Choisy Marc, Marcombe S., Grandadam M. (2020). Trends of the dengue serotype-4 circulation with epidemiological, phylogenetic, and entomological insights in Lao PDR between 2015 and 2019. Pathogens, 9 (9), 728 [17 p.].
    Identifiant IRD :  fdi:010079888

  3. Clapham H., Hay J., Routledge I., Takahashi S., Choisy Marc, Cummings D., Grenfell B., Metcalf C.J.E., Mina M., Rodriguez-Barraquer I., Salje H., Tam C.C. (2020). Seroepidemiologic study designs for determining SARS-COV-2 transmission and immunity. Emerging Infectious Diseases, 26 (9), 1978-1986. ISSN 1080-6059.
    Identifiant IRD :  fdi:010078775

  4. Dang Duc Anh, Choisy Marc, Clapham H.E., Hoang Quoc Cuong, Vu Tien Viet Dung, Tran Nhu Duong, Nguyen Le Khanh Hang, Hoang Thi Thu Ha, Nguyen Tran Hien, Tran Thi Nguyen Hoa, Tran Thi Mai Hung, Vu Thi Lan Huong, Dang Thi Thanh Huyen, Nguyen Cong Khanh, Lewycka S.O., Linley E., Le Thi Quynh Mai, Nadjm B., Ngu Duy Nghia, Pebody R., Hoang Vu Mai Phuong, Luong Minh Tan, Le Van Tan, Pham Quang Thai, Le Viet Thanh, Nguyen Thi Le Thanh, Nguyen Thi Thu Thuy, Nguyen Thi Thuong, Le Thi Thanh, Nguyen Thi Thanh Thao, Nguyen Anh Tuan, Phan Thi Ngoc Uyen, Van Doorn H.R. (2020). Plans for nationwide serosurveillance network in Vietnam. Emerging Infectious Diseases, 26 (1), e1-e6. ISSN 1080-6059.
    Identifiant IRD :  fdi:010078776

  5. Van N. T. B., Yen N. T. P., Nhung N. T., Cuong N. V., Kiet B. T., Hoang N. V., Hien V. B., Chansiripornchai N., Choisy Marc, Ribas A., Campbell J., Thwaites G., Carrique-Mas J. (2020). Characterization of viral, bacterial, and parasitic causes of disease in small-scale chicken flocks in the Mekong Delta of Vietnam. Poultry Science, 99 (2), p. 783-790.
    Identifiant IRD :  fdi:010079006

  6. Carrique-Mas J. J., Choisy Marc, Cuong N. V., Thwaites G., Baker S. (2020). An estimation of total antimicrobial usage in humans and animals in Vietnam. Antimicrobial Resistance and Infection Control, 9 (1), 16 [6 p.]. ISSN 2047-2994.
    Identifiant IRD :  fdi:010077912

  7. Bonell A., Contamin Lucie, Thai P. Q., Thuy H. T. T., van Doorn H. R., White R., Nadjm B., Choisy Marc. (2020). Does sunlight drive seasonality of TB in Vietnam ? A retrospective environmental ecological study of tuberculosis seasonality in Vietnam from 2010 to 2015. BMC Infectious Diseases, 20 (1), p. art. 184 [11 p.].
    Identifiant IRD :  fdi:010078025

2019

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Vu Tien Viet Dung, Do Thi Thuy Nga, Rydell U., Nilsson L.E., Olson L., Larsson M., Hanberger H., Choisy Marc, Dao Tuyet Trinh, van Doorn H.R., Nguyen Van Kinh, Nguyen Vu Trung, Wertheim H.F.L., VINARES Consortium. (2019). Antimicrobial susceptibility testing and antibiotic consumption results from 16 hospitals in Viet Nam : the VINARES project 2012-2013. Journal of Global Antimicrobial Resistance, 18, p. 269-278. ISSN 2213-7165.
    Identifiant IRD :  fdi:010076739

  2. Nguyen Van Cuong, Doan Hoang Phu, Nguyen Thi Bich Van, Bao Dinh Truong, Bach Tuan Kiet, Bo Ve Hien, Ho Thi Viet Thu, Choisy Marc, Padungtod P., Thwaites G., Carrique-Mas J. (2019). High-resolution monitoring of antimicrobial consumption in Vietnamese small-scale chicken farms highlights discrepancies between study metrics. Frontiers in Veterinary Science, 6, p. art. 174 [13p.]. ISSN 2297-1769.
    Identifiant IRD :  fdi:010076153

  3. Choisy Marc, Cuong N. V., Bao T. D., Kiet B. T., Hien B. V., Thu H. V., Chansiripornchai N., Setyawan E., Thwaites G., Rushton J., Carrique-Mas J. (2019). Assessing antimicrobial misuse in small-scale chicken farms in Vietnam from an observational study. BMC Veterinary Research, 15, 206 [10 p.]. ISSN 1746-6148.
    Identifiant IRD :  fdi:010076149

  4. Choisy Marc, Tung T. S., Diep N. T. N., Hien N. T., Le M. Q., Thai P. Q., Duong T. N., Anh D. D., Horby P. W., Boni M. F., Bryant J., Lewycka S. O., Nadjm B., van Doorn H. R., Wertheim H. F. L. (2019). Sero-prevalence surveillance to predict vaccine-preventable disease outbreaks : a lesson from the 2014 measles epidemic in Northern Vietnam. Open Forum Infectious Diseases, 6 (3), p. art. ofz030 [7 p.]. ISSN 2328-8957.
    Identifiant IRD :  fdi:010075642

  5. Trung N. V., Hoi L., Dien V. M., Huong D. T., Hoa T. M., Lien V. N., Luan V., Lewycka S. O., Choisy Marc, Bryant J. E., Nadjm B., Van Doorn H. R., Richards A. L., Van Kinh N. (2019). Clinical manifestations and molecular diagnosis of scrub typhus and murine typhus Vietnam, 2015-2017. Emerging Infectious Diseases, 25 (4), p. 633-641. ISSN 1080-6040.
    Identifiant IRD :  fdi:010075483

  6. Carrique-Mas J., Van N. T. B., Cuong N. V., Truong B. D., Kiet B. T., Thanh P. T. H., Lon N. N., Giao V. T. Q., Hien V. B., Padungtod P., Choisy Marc, Setyawan E., Rushton J., Thwaites G. (2019). Mortality, disease and associated antimicrobial use in commercial small-scale chicken flocks in the Mekong Delta of Vietnam. Preventive Veterinary Medicine, 165, p. 15-22. ISSN 0167-5877.
    Identifiant IRD :  fdi:010075519

2018

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Lai S. J., Johansson M. A., Yin W. W., Wardrop N. A., van Panhuis W. G., Wesolowski A., Kraemer M. U. G., Bogoch II, Kain D., Findlater A., Choisy Marc, Huang Z. J., Mu D., Li Y., He Y. N., Chen Q. L., Yang J., Khan K., Tatem A. J., Yu H. J. (2018). Seasonal and interannual risks of dengue introduction from South-East Asia into China, 2005-2015. PLoS Neglected Tropical Diseases, 12 (11), p. e0006743 [16 p.]. ISSN 1935-2735.
    Identifiant IRD :  fdi:010074762

  2. Abbate J.L., Ezenwa V.O., Guégan Jean-François, Choisy Marc, Nacher M., Roche Benjamin. (2018). Disentangling complex parasite interactions : protection against cerebral malaria by one helminth species is jeopardized by co-infection with another. Plos Neglected Tropical Diseases, 12 (5), e0006483. ISSN 1935-2735.
    Identifiant IRD :  fdi:010072630

  3. Nhan Thi Ho, Thompson C., Le Nguyen Thanh Nhan, Hoang Minh Tu Van, Nguyen Thanh Dung, Phuc Iran My, Vo Minh Quang, Ngo Ngoc Quang Minh, Iran Anh Tuan, Nguyen Thanh Hung, Ha Manh Tuan, Nguyen Van Vinh Chau, Wolbers M., Thwaites G.E., Choisy Marc, Baker S. (2018). Retrospective analysis assessing the spatial and temporal distribution of paediatric acute respiratory tract infections in Ho Chi Minh City, Vietnam. BMJ Open, 8 (1), art. no e016349 [9 p.]. ISSN 2044-6055.
    Identifiant IRD :  fdi:010072631

  4. Lefèvre Thierry, Ohm J., Dabire K. R., Cohuet Anna, Choisy Marc, Thomas M. B., Cator L. (2018). Transmission traits of malaria parasites within the mosquito : genetic variation, phenotypic plasticity, and consequences for control. Evolutionary Applications, 11 (4), p. 456-469. ISSN 1752-4571.
    Identifiant IRD :  fdi:010072709

2017

Articles


  1. Choisy Marc, Keomalaphet S., Xaydalasouk K., Quet F., Latthaphasavang V., Buisson Y. (2017). Prevalence of Hepatitis B virus infection among pregnant women attending antenatal clinics in Vientiane, Laos, 2008-2014. Hepatitis Research and Treatment, vol. 2017, art. no 1284273 [5 p. en ligne]. ISSN 2090-1364.
    Identifiant IRD :  fdi:010072632

  2. Pham Quang Thai, Horby P., Tran Dhu Duong, Vu Dinh Thiem, Nguyen Thu Yen, Nguyen Tran Hien, Weiss D.J., Boni M.F., Choisy Marc. (2017). Absolute humidity drives the epidemiology of influenza-like illness in Vietnam. ASM Science Journal, (1 no spécial ICT-Bio), p. 87-89. ISSN 1823-6782.
    Identifiant IRD :  fdi:010072963

  3. Drogoul Alexis, Choisy Marc, Gaudou B., Marilleau Nicolas, Philippon Damien. (2017). Large-scale epidemiological modelling : exploring the impact of the ASEAN economic corridors policy on the dengue fever epidemic. ASM Science Journal, (1 no spécial ICT-Bio), p. 69-71. ISSN 1823-6782.
    Identifiant IRD :  fdi:010072964

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Delabouglise A., Choisy Marc, Phan T. D., Antoine-Moussiaux N., Peyre M., Vu T. D., Pfeiffer D. U., Fournie G. (2017). Economic factors influencing zoonotic disease dynamics : demand for poultry meat and seasonal transmission of avian influenza in Vietnam. Scientific Reports - Nature, 7, p. art. 5905 [14 p.]. ISSN 2045-2322.
    Identifiant IRD :  fdi:010071074

Colloques, congrès, séminaires


  1. Pham Nguyen Hoang, Zucker Jean-Daniel, Choisy Marc, Ho Tuong Vinh. (2017). Causality analysis between climatic factors and dengue fever using the Granger causality. New York : IEEE, 6 p. IEEE RIVF Conference on Computing and Communication Technologies, 12., Hanoï (VTN), 2016/11/07-09.
    Identifiant IRD :  fdi:010070416

Directions d'ouvrages ou de revues


  1. Blanc S. (dir.), Boëtsch G. (dir.), Hossaert-McKey M. (dir.), Renaud F. (dir.), Thiébault S. (préf.), Paupy Christophe (collab.), Simard Frédéric (collab.), Banuls Anne-Laure (collab.), Becquart Pierre (collab.), Chandre Fabrice (collab.), Choisy Marc (collab.), Fargette Denis (collab.), Hébrard Eugénie (collab.), Liégeois Florian (collab.), Poulicard Nils (collab.), Roche Benjamin (collab.), et al. (2017). Ecologie de la santé : pour une nouvelle lecture de nos maux. Paris ; Paris : Le Cherche Midi ; CNRS, 191 p. ISBN 978-2-7491-5425-1.
    Identifiant IRD :  fdi:010071853

2016

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Boithias Laurie, Choisy Marc, Souliyaseng N., Jourdren M., Quet F., Buisson Y., Thammahacksa Chanthamousone, Silvera Norbert, Latsachack Keooudone, Sengtaheuanghoung O., Pierret Alain, Rochelle Newall Emma, Becerra S., Ribolzi Olivier. (2016). Hydrological regime and water shortage as drivers of the seasonal incidence of diarrheal diseases in a tropical montane environment. Plos Neglected Tropical Diseases, 10 (12), p. e0005195 [27 p.]. ISSN 1935-2735.
    Identifiant IRD :  fdi:010068908

  2. Duong Mai Thuy, Peacock T.P., Vu Thi Ngoc Bich, Fabrizio T., Dang Nguyen Hoang, Nguyen Dang Tho, Nguyen Thi Diep, Minh Nguyen, Le Nguyen Minh Hoa, Hau Thi Thu Trang, Choisy Marc, Inui K., Newman S., Nguyen vu Trung, van Doorn R., Thanh Long To, Iqbal M., Bryant J.E. (2016). Prevalence and diversity of H9N2 avian influenza in chickens of Northern Vietnam, 2014. Infection Genetics and Evolution, 44, p. 530-540. ISSN 1567-1348.
    Identifiant IRD :  fdi:010068169

  3. Van Anh Thi Nguyen, Banuls Anne-Laure, Thanh Hoa Thi Tran, Kim Lien Thi Pham, Thai Son Nguyen, Hung Van Nguyen, Ngoc Lan Thi Nguyen, Nam Lien Thi Nguyen, Duc Anh Dang, Marks G. B., Choisy Marc. (2016). Mycobacterium tuberculosis lineages and anti-tuberculosis drug resistance in reference hospitals across Viet Nam. BMC Microbiology, 16, p. art. 167 [9 p.]. ISSN 1471-2180.
    Identifiant IRD :  fdi:010067715

  4. Peyre M., Choisy Marc, Sobhy H., Kilany W. H., Gély M., Tripodi A., Dauphin G., Saad M., Roger F., Lubroth J., Jobre Y. (2016). Added value of avian influenza (H5) day-old chick vaccination for disease control in Egypt. Avian Diseases, 60 (1), p. 245-252. ISSN 0005-2086.
    Identifiant IRD :  fdi:010067596

  5. Chazel M., Marchandin H., Keck N., Terru D., Carriere C., Ponsoda M., Jacomo V., Panteix G., Bouzinbi N., Banuls Anne-Laure, Choisy Marc, Solassol J., Aubry A., Godreuil S. (2016). Evaluation of the SLOMYCO Sensititre (R) panel for testing the antimicrobial susceptibility of Mycobacterium marinum isolates. Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials, 15, p. art. 30 [7p.]. ISSN 1476-0711.
    Identifiant IRD :  fdi:010066831

2015

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Althaus C. L., Choisy Marc, Alizon S., C. S. F. Group. (2015). Number of sex acts matters for heterosexual transmission and control of Chlamydia trachomatis. Sexually Transmitted Infections, 91 (Suppl. 2), p. A145-A145. ISSN 1368-4973.
    Identifiant IRD :  fdi:010074441

  2. Thai P. Q., Choisy Marc, Duong T. N., Thiem V. D., Yen N. T., Hien N. T., Weiss D. J., Boni M. F., Horby P. (2015). Seasonality of absolute humidity explains seasonality of influenza-like illness in Vietnam. Epidemics, 13, p. 65-73. ISSN 1755-4365.
    Identifiant IRD :  fdi:010065526

  3. Trang N. V., Choisy Marc, Nakagomi T., Chinh N. T. M., Doan Y. H., Yamashiro T., Bryant J. E., Nakagomi O., Anh D. D. (2015). Determination of cut-off cycle threshold values in routine RT-PCR assays to assist differential diagnosis of norovirus in children hospitalized for acute gastroenteritis. Epidemiology and Infection, 143 (15), p. 3292-3299. ISSN 0950-2688.
    Identifiant IRD :  fdi:010065392

  4. Hoa L. N. M., Bryant J. E., Choisy Marc, Nguyet L. A., Bao N. T., Trang N. H., Chuc N. T. K., Toan T. K., Saito T., Takemae N., Horby P., Wertheim H., Fox A. (2015). Population susceptibility to a variant swine-origin influenza virus A(H3N2) in Vietnam, 2011-2012. Epidemiology and Infection, 143 (14), p. 2959-2964. ISSN 0950-2688.
    Identifiant IRD :  fdi:010065387

  5. Viet T. L., Choisy Marc, Bryant J. E., Trong D. V., Quang T. P., Horby P., Tran H. N., Kieu H. T. T., Vu T. N., Van K. N., Quynh M. L., Wertheim H. F. L. (2015). A dengue outbreak on a floating village at Cat Ba Island in Vietnam. Bmc Public Health, 15, p. art. 940 [8 p.]. ISSN 1471-2458.
    Identifiant IRD :  fdi:010065297

  6. Van Panhuis W.G., Choisy Marc, Xiong X., Chok N.S., Akarasewi P., Iamsirithaworn S., Lam S.K., Chong C.K., Lam F.C., Phommasak B., Vongphrachanh P., Bouaphanh K., Rekol H., Nguyen Tran Hien, Pham Quang Thai, Tran Nhu Duong, Chuang J.H., Liu Y.L., Ng L.C., Shi Y., Tayag E.A., Roque Jr V.G., Lee Suy L.L., Jarman R.G., Gibbons R.V., Velasco J.M.S., Yoon I.K., Burke D.S., Cummings D.A.T. (2015). Region-wide synchrony and traveling waves of dengue across eight countries in Southeast Asia [plus Supporting information]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America - PNAS, 112 (42), p. 13069-13074 [+ supporting information : 12 p.]. ISSN 1091-6490.
    Identifiant IRD :  fdi:010065784

  7. Choisy Marc. (2015). Le VIH, un génie viral de l'évolution. In : Vittecoq M. (ed.), Prugnolle F. (ed.), Roche Benjamin (ed.), Renaud F. (ed.), Thomas F. (ed.). Adaptations des pathogènes, mutations, multirésistances... Quand l'évolution défie la santé : dossier. Biofutur, (361), p. 30-32. ISSN 0294-3506.
    Identifiant IRD :  fdi:010064242

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. Choisy Marc. (2015). Origine et évolution du VIH. In : Vittecoq M. (ed.), Roche Benjamin (ed.), Prugnolle Franck (ed.), Thomas F. (ed.). Les maladies infectieuses. Paris : De Boeck - Solal, p. 35-46. (Santé, Médecine et Sciences de l'Evolution). ISBN 978-2-353-27297-6.
    Identifiant IRD :  fdi:010067802

  2. Choisy Marc, Sitboulang P., Vongpanhya M., Saiyavong C., Khamphaphongphanh B., Phommasack B., Quet F., Buisson Y., Zucker Jean-Daniel, Pahuis W. van. (2015). Rescuing public health data. In : Morand S. (ed.), Dujardin Jean-Pierre (ed.), Lefait-Robin R. (ed.), Apiwathnasorn C. (ed.). Socio-ecological dimensions of infectious diseases in Southeast Asia. Singapour : Springer, p. 171-190. ISBN 978-981-287-526-6.
    Identifiant IRD :  fdi:010065588

2014

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Choisy Marc, de Roode J. C. (2014). The ecology and evolution of animal medication : genetically fixed response versus phenotypic plasticity. American Naturalist, 184 (Suppl. 1), p. S31-S46. ISSN 0003-0147.
    Identifiant IRD :  fdi:010063612

  2. Roche Benjamin, Broutin H., Choisy Marc, Godreuil S., Constantin de Magny Guillaume, Chevaleyre Y., Zucker Jean-Daniel, Breban R., Cazelle B., Simard Frédéric. (2014). The niche reduction approach : an opportunity for optimal control of infectious diseases in low-income countries ?. BMC Public Health, 14, art. 753 [9 p. en ligne]. ISSN 1471-2458.
    Identifiant IRD :  fdi:010062816

2013

Articles


  1. Kouokam Etienne, Zucker Jean-Daniel, Fondjo F., Choisy Marc. (2013). Disease control in age structure population. ISRN Epidemiology, 2013 (ID 703230), p. 1-8. ISSN 2090-942X.
    Identifiant IRD :  fdi:010059055

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Gascuel Fanny, Choisy Marc, Duplantier Jean-Marc, Débarre F., Brouat Carine. (2013). Host resistance, population structure and the long-term persistence of bubonic plague : contributons of modelling approach in the malagasy focus. Plos Computational Biology, 9 (5), p. e1003039. ISSN 1553-7358.
    Identifiant IRD :  fdi:010059052

  2. Berngruber T.W., Froissart R., Choisy Marc, Gandon S. (2013). Evolution of virulence in emerging epidemics. Plos Pathogens, 9 (3), p. e1003209. ISSN 1553-7374.
    Identifiant IRD :  fdi:010059053

  3. Vale P.F., Choisy Marc, Little T.J. (2013). Host nutrition alters the variance in parasite transmission potential. Biology Letters, 9 (1), p. 1-4. ISSN 1744-957X.
    Identifiant IRD :  fdi:010059054

2012

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Choisy Marc, Rohani P. (2012). Changing spatial epidemiology of pertussis in continental USA. Proceedings of the Royal Society B. Biological Sciences, 279 (1747), p. 4574-4581. ISSN 0962-8452.
    Identifiant IRD :  PAR00009534

  2. Vale P. F., Choisy Marc, Froissart R., Sanjuan R., Gandon S. (2012). The distribution of mutational fitness effects of phage phi x174 on different hosts. Evolution, 66 (11), p. 3495-3507. ISSN 0014-3820.
    Identifiant IRD :  fdi:010057327

  3. Broutin V., Banuls Anne-Laure, Aubry A., Keck N., Choisy Marc, Bernardet J. F., Michel C., Raymond J. C., Libert C., Barnaud A., Stragier P., Portaels F., Terru D., Belon C., Dereure O., Gutierrez C., Boschiroli M. L., Van De Perre P., Cambau E., Godreuil S. (2012). Genetic diversity and population structure of Mycobacterium marinum : new insights into host and environmental specificities. Journal of Clinical Microbiology, 50 (11), p. 3627-3634. ISSN 0095-1137.
    Identifiant IRD :  fdi:010069611

  4. Van A. T. N., Choisy Marc, Nguyen D. H., Thanh H. T. T., Kim L. T. P., Phuong T. T. D., Philippe J., Nguyen T. S., Ho M. L., Tran S. V., Banuls Anne-Laure, Dang D. A. (2012). High prevalence of Beijing and EAI4-VNM genotypes among M. tuberculosis isolates in Northern Vietnam : sampling effect, rural and urban disparities. Plos One, 7 (9), p. e45553. ISSN 1932-6203.
    Identifiant IRD :  fdi:010057255

  5. Gimonneau G., Pombi M., Choisy Marc, Morand S., Dabire R.K., Simard Frédéric. (2012). Larval habitat segregation between the molecular forms of the mosquito Anopheles gambiae in a rice field area of Burkina Faso, West Africa. Medical and Veterinary Entomology, 26 (1), p. 9-17. ISSN 0269-283X.
    Identifiant IRD :  fdi:010054332

2010

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Gimonneau G., Pombi M., Choisy Marc, Morand S., Dabire R., Costantini Carlo, Simard Frédéric. (2010). Larval habitat segregation between the molecular forms of the African malaria mosquito, Anopheles gambiae in a rice field area of Burkina Faso, West Africa. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 83 (5), p. 1000. ISSN 0002-9637.
    Identifiant IRD :  fdi:010054128

  2. Faye B., Banuls Anne-Laure, Bucheton Bruno, Dione M. M., Bassanganam O., Hide Mallorie, Dereure J., Choisy Marc, Ndiaye J. L., Konate O., Claire M., Senghor M. W., Faye M. N., Sy I., Niang A. A., Molez Jean-François, Victoir K., Marty P., Delaunay P., Knecht R., Mellul S., Diedhiou S., Gaye O. (2010). Canine visceral leishmaniasis caused by Leishmania infantum in Senegal : risk of emergence in humans ?. Microbes and Infection, 12 (14-15), p. 1219-1225. ISSN 1286-4579.
    Identifiant IRD :  fdi:010053357

  3. Choisy Marc, de Roode J. C. (2010). Mixed Infections and the evolution of virulence : effects of resource competition, parasite plasticity, and impaired host immunity. American Naturalist, 175 (5), p. E105-E118. ISSN 0003-0147.
    Identifiant IRD :  fdi:010049398

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. Choisy Marc. (2010). 1. Changements environnementaux et santé : 3. Modélisation mathématique en épidémiologie. In : Gauthier-Clerc M. (dir.), Thomas F. (dir.), Guégan Jean-François (préf.). Ecologie de la santé et biodiversité. Bruxelles : De Boeck, p. 159-182. (Licence Master Doctorat : Biologie). ISBN 978-2-8041-3508-9.
    Identifiant IRD :  fdi:010052525

2009

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Godreuil S., Renaud François, Choisy Marc, Depina J.J., Garnotel E., Morillon M., Van de Perre P., Banuls Anne-Laure. (2009). Highly structured genetic diversity of the Mycobacterium tuberculosis population in Djibouti. Clinical Microbiology and Infection, 16 (7), p. 1023-1026. ISSN 1469-0691.
    Identifiant IRD :  fdi:010050079

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. Guégan Jean François, Choisy Marc. (2009). Introduction. In : Guégan Jean-François (ed.), Choisy Marc (ed.). Introduction à l'épidémiologie intégrative des maladies infectieuses et parasitaires. Bruxelles : De Boeck, p. XXII-XXVII. (LMD.Licence Maîtrise Doctorat.Cours Biologie). ISBN 978-2-8041-5948-1.
    Identifiant IRD :  fdi:010046859

  2. Choisy Marc, Cazelles B. (2009). Conséquences des dynamiques épidémiques en santé publique : rôle des modèles mathématiques. In : Guégan Jean François (ed.), Choisy Marc (ed.). Introduction à l'épidémiologie intégrative des maladies infectieuses et parasitaires. Bruxelles : De Boeck, p. 3-39. (LMD.Licence Maîtrise Doctorat.Cours Biologie). ISBN 978-2-8041-5948-1.
    Identifiant IRD :  fdi:010046860

  3. Guégan Jean-François, Choisy Marc. (2009). Annexe 23 : dynamique des systèmes, changements environnementaux et maladies infectieuses. In : Guégan Jean-François (ed.), Choisy Marc (ed.). Introduction à l'épidémiologie intégrative des maladies infectieuses et parasitaires. Bruxelles : De Boeck, p. 500. (LMD.Licence Maîtrise Doctorat.Cours Biologie). ISBN 978-2-8041-5948-1.
    Identifiant IRD :  fdi:010046877

Ouvrages


  1. Guégan Jean François, Choisy Marc. (2009). Introduction à l'épidémiologie intégrative des maladies infectieuses et parasitaires. Bruxelles : De Boeck, 522 p. (LMD.Licence Maîtrise Doctorat.Cours Biologie). ISBN 978-2-8041-5948-1.
    Identifiant IRD :  fdi:010046858

2008

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Prugnolle Franck, Choisy Marc, De Meeûs Thierry. (2008). CLONALITY V.0.4 : a randomization-based program to test for heterozygosity-genet size relationships in clonal organisms. Molecular Ecology Resources, 8 (5), p. 954-956. ISSN 1755-098X.
    Identifiant IRD :  fdi:010042776

2007

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Nettle D., Grace J.B., Choisy Marc, Cornell H.V., Guégan Jean-François, Hochberg M.E. (2007). Cultural diversity, economic development and societal instability. Plos One, 2 (9), e929 [5 p.].
    Identifiant IRD :  fdi:010048059

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. Choisy Marc, Guégan Jean-François, Rohani P. (2007). Mathematical modeling of infectious diseases dynamics. In : Tibayrenc Michel (ed.). Encyclopedia of infectious diseases : modern methodologies. Hoboken : J. Wiley, p. 379-404. ISBN 978-0-471-65732-3.
    Identifiant IRD :  fdi:010041103

2006

Articles


  1. Choisy Marc, Rohani P. (2006). Harvesting can increase severity of wildlife disease epidemics. Proceedings of the Royal Society.B, 273 (1597), p. 2025-2034. ISSN 0962-8436.
    Identifiant IRD :  fdi:010050125

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Choisy Marc, Guégan Jean-François, Rohani P. (2006). Dynamics of infectious diseases and pulse vaccination : teasing apart the embedded resonance effects. Physica D Nonlinear Phenomena, 223 (1), p. 26-35. ISSN 0167-2789.
    Identifiant IRD :  fdi:010037703

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. De Meeûs Thierry (coord.), Théron A. (coord.), Prugnolle Franck, Durand Patrick, Caillaud D., Choisy Marc, Roze D., Jarne P., Jabbour-Zahad R., Alonso S., Pointier J.P., Boissier J. (2006). Les co-structures génétiques d'un parasite (Schistosoma mansoni) et de ses hôtes (mammifères et mollusques) dans la mangrove dulçaquicole de Guadeloupe : échelles spatiale, fonctionnelle et coévolutive. In : Bonhême I. (ed.), Appora V. (ed.), Atramentowicz M. (ed.), Gillon Yves (ed.). Ecosystèmes tropicaux : actes du 2ème colloque de restitution du programme de recherche. Paris ; Paris : MEDD ; ECOFOR, p. 61-68. Colloque de Restitution du Programme de Recherche Ecosystèmes Tropicaux, 2., Paris (FRA), 2006/11/07-08. ISBN 2-914770-12-X.
    Identifiant IRD :  fdi:010051743

2005

Chapitres ou parties d'ouvrages


  1. Constantin de Magny Guillaume, Choisy Marc. (2005). Outils mathématiques, outils technologiques : lorsque le choléra rencontre le satellite. In : Barbault R. (ed.), Chevassus-au-Louis B. (ed.), Teyssèdre A. (coord.). Biodiversité et changements globaux : enjeux de société et défis pour la recherche. Paris : ADPF, p. 126-128. Biodiversité Sciences et Gouvernance : Conférence Mondiale, Paris (FRA), 2005/01/24. ISBN 2-914935-27-7.
    Identifiant IRD :  fdi:010039353

2004

Articles


  1. Choisy Marc, Hide M., Banuls Anne-Laure, Guégan Jean-François. (2004). Rocking the curve. Trends in Microbiology, 12 (12), p. 534-536. ISSN 0966-842X.
    Identifiant IRD :  fdi:010050080

  2. Choisy Marc, Woelk C.H., Guégan Jean-François, Robertson D.L. (2004). Comparative study of adaptative molecular evolution in different human immunodeficiency virus groups and subtypes. Journal of Virology, 78 (4), p. 1962-1970. ISSN 0022-538X.
    Identifiant IRD :  fdi:010034466

  3. Prugnolle Franck, Choisy Marc, Théron A., Durand Patrick, De Meeûs Thierry. (2004). Sex-specific correlation between heterozygosity and clone size in the tremadode Schistosoma mansoni. Molecular Ecology, 13 (9), p. 2859-2864. ISSN 0962-1083.
    Identifiant IRD :  fdi:010034550

  4. Choisy Marc, Woelk C.H., Guégan Jean-François, Robertson D.L. (2004). Comparative study of adaptive molecular evolution in different human immunodeficiency virus groups and subtypes. Journal of Virology, 78 (4), p. 1962-1970. ISSN 0022-538X.
    Identifiant IRD :  fdi:010033002

  5. Choisy Marc, Franck P., Cornuet J.M. (2004). Estimating admixture proportions with microsatellites : comparison of methods based on simulated data. Molecular Ecology, 13 (4), p. 955-968. ISSN 0962-1083.
    Identifiant IRD :  fdi:010033169

Articles référencés dans le Web of Science


  1. Fargette Denis, Pinel Agnès, Abubakar Z., Traoré O., Brugidou Christophe, Fatogoma S., Hébrard Eugénie, Choisy Marc, Séré Y., Fauquet Claude, Konaté G. (2004). Inferring the evolutionary history of Rice yellow mottle virus from genomic, phylogenetic, and phylogeographic studies. Journal of Virology, 78 (7), p. 3252-3261. ISSN 0022-538X.
    Identifiant IRD :  fdi:010033272

Thèses, mémoires, diplômes


  1. Choisy Marc. (2004). Approches écologique et évolutive de la vaccination. Montpellier ; Montpellier : ENSAM ; IRD, 277 p. multigr. Th. : Biol. des Organismes et des Populations, ENSAM : Montpellier. 2004/12/01.
    Identifiant IRD :  fdi:010035102

2003

Articles


  1. Choisy Marc, Brown S.P., Lafferty K.D., Thomas F. (2003). Evolution of trophic transmission in parasites : why add intermediate hosts ?. The American Naturalist, 162 (2), p. 172-181. ISSN 0003-0147.
    Identifiant IRD :  fdi:010050081
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