Kouassi Koffi Nazaire. (1993). Etude du génome des densovirus de lépidoptères ravageurs de cultures : Casphalia extranea en Côte d'Ivoire et Diatraea saccharalis au Brésil, application au diagnostic par sonde nucléique.
Montpellier : Université de Montpellier 2, 165 p. Th. Biochim., Biol. Cellulaire et Moléculaire,
Titre du document
Etude du génome des densovirus de lépidoptères ravageurs de cultures : Casphalia extranea en Côte d'Ivoire et Diatraea saccharalis au Brésil, application au diagnostic par sonde nucléique
Année de publication
1993
Type de document
Diplôme
Auteurs
Kouassi Koffi Nazaire
Source
Montpellier : Université de Montpellier 2, 1993,
165 p.
Diplôme
Th. Biochim., Biol. Cellulaire et Moléculaire,
Nous avons analysé le génome des densovirus de C. extranea (CeDNV) et de D. saccharalis (DsDNV). Les tailles de ces génomes ont été estimées à 4,9 kb pour le Ce DNV et à 5,95 kb pour celui du DsDNV. Vingt sites de restriction ont été cartographiés sur le génome du CeDNV et 41 sites sur celui du DsDNV. La séquence du génome du CeDNV correspondant aux fragments HindIII A et D (approx. 50 % du génome) a été clonée dans le plasmide pEMBL 19+. Le plasmide correspondant, pCeHindIIIA+D, nous a servi à la mise au point d'une sonde nucléique. La séquence quasi-complète du génome du Ds DNV a été clonée dans le même vecteur générant le plasmide pDst50. Ce plasmide transfecté dans la lignée cellulaire Px de Plutella xylostella a conduit à une infection typique avec production de virions. Du fait d'analogies entre les cartes de restriction des génomes du DsDNV et du JcDNV, des génomes chimères ont été construits par substitution réciproque des séquences internes codantes de l'ADN du JcDNV cloné (pBRJH) et celles du pDst50. L'analyse des virions chimères montre que les répétitions terminales inversées du DsDNV peuvent servir d'origine de réplication pour les séquences codantes du JcDNV. Cet échange de séquence ne modifie pas la spécificité d'hôte. Une méthode de diagnostic de la virose de C. extranea par sonde nucléique froide a été mise au point et appliquée à l'analyse de l'état sanitaire des populations larvaires récoltées au cours de deux prélèvements à deux semaines d'intervalle (Septembre-Octobre 1991) dans les plantations de palmiers à huile d'Eloka (Côte d'Ivoire). La présence du virus a été détectée après dépôt de broyat larvaire sur membrane puis hybridation avec la sonde ADN viral cloné (pCeHindIIIA+D). L'analyse statistique des résultats effectuée par la méthode des variables régionalisées a montré que la distribution des larves et la dissémination de la virose dans la plantation se faisaient au hasard avec une évolution spatio-temporelle relativement rapide de la virose dans la parcelle choisie. (Résumé d'auteur)
