Heintz W., Barde Julien, Blondel E. (2018). Un workflow R pour une gestion simple et durable des données de la recherche. Le Cahier des Techniques de l'INRA, 2, en ligne [9 p.]. ISSN 2823-3980.
Titre du document
Un workflow R pour une gestion simple et durable des données de la recherche
Année de publication
2018
Type de document
Article
Auteurs
Heintz W., Barde Julien, Blondel E.
Source
Le Cahier des Techniques de l'INRA, 2018,
2, en ligne [9 p.] ISSN 2823-3980
A l'heure de l'Open Science, même si de nombreuses initiatives locales, institutionnelles et nationales prouvent que le partage des données scientifiques est désormais une nécessité, force est de constater que nous
nous heurtons toujours aux mêmes difficultés de mise en oeuvre. En effet, un des fondements de la science ouverte et du principe de données FAIR4 (Faciles à trouver, accessibles, interopérables et réutilisables) est la fourniture
de métadonnées : ce sont des informations contextuelles permettant de découvrir un jeu de données et de le comprendre pour le réutiliser. Or il existe toujours des freins à la création de ces métadonnées, principalement
techniques, faute d'outils simples et faciles à prendre en main par des non spécialistes, et ce, malgré les considérables évolutions des logiciels les plus connus, tels que Geonetwork. Un workflow a été implémenté en langage R -
largement utilisé par la communauté scientifique -, permettant à partir d'un tableur partagé, éditable dans un environnement collaboratif, de générer des métadonnées conforme à la norme ISO/OGC 19115 (également d'autres standards comme l'EML),
de les publier dans un catalogue de métadonnées et/ou dans un ou plusieurs entrepôts de données mais également de créer un flux de données. Nous nous proposons de détailler les mécanismes et les fonctionnalités de ce workflow
