@book{fdi:010078353,
  title = {{G}enotipagem por enriquecimento e captura direcionada de genes candidatos em {C}offea canephora},
  author = {{D}e {A}quino, {S}.{O}. and {T}ournebize, {R}. and {M}arraccini, {P}. and {M}ariac, {C}{\'e}dric and {C}ouderc, {M}arie and {B}ethune, {K}evin and {C}ubry, {P}hilippe and {A}ndrade, {A}.{C}. and {D}arracq, {O}. and {L}epelley, {M}. and {C}rouzillat, {D}. and {K}iwuka, {C}. and {A}nten, {N}. and {M}anel, {S}. and {F}ran{\c{c}}ois, {O}. and {V}igouroux, {Y}ves and {K}ochko, {A}lexandre de and {P}oncet, {V}al{\'e}rie},
  editor = {},
  language = {{POR}},
  abstract = {{A} captura direcionada de sequ{\^e}ncias acoplada ao sequenciamento de alto rendimento tornou-se um m{\'e}todo poderoso para o estudo da varia{\c{c}}ão de sequ{\^e}ncias gen{\^o}micas. {U}sando o genoma disponível de {C}. canephora (tamanho estimado  de  710  {M}b/haplóide)  como  refer{\^e}ncia,  projetamos  sondas  para  323  genes  candidatos  selecionados  ({CG}s) visando capturar seus homeólogos em 293 acessos de {C}. canephorada {U}ganda, 12 clones do {B}rasil e um subconjunto de  19  indivíduos  cobrindo  todos  os  grupos  de  diversidade  de {C}.  canephora. {P}ara um  total  de  324  indivíduos  de {C}. canephora,  projetamos, com  sucesso, cerca  de  19.000  sondas  e  identificamos mais  de 16.000  polimorfismos  de nucleotídeo  único  ({SNP}s)  de  qualidade, localizados  dentro  ou  próximo  a  318  genes anotados,  gerando  dados genotípicos para popula{\c{c}}ões que  estão  localizadas  em  regiões que  abrangem diferentes condi{\c{c}}ões  climáticas.  {N}ós investigamos questões como desenho das sondas, cobertura do sequenciamento, efici{\^e}ncia da hibridiza{\c{c}}ão e captura,e estrat{\'e}gias de análise dos dados por bioinformática.},
  keywords = {{OUGANDA} ; {BRESIL}},
  address = {},
  series = {{A}nais do {S}impósio de {P}esquisa dos {C}af{\'e}s do {B}rasil},
  pages = {6  [en ligne]},
  year = {2019},
  ISSN = {1984-9249},
  URL = {https://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010078353},
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