Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

 

Publications des scientifiques de l'IRD

Ayala Diego, Zhang S., Chateau M., Fouet C., Morlais Isabelle, Costantini Carlo, Hahn M. W., Besansky N. J. (2019). Association mapping desiccation resistance within chromosomal inversions in the African malaria vector Anopheles gambiae. Molecular Ecology, 28 (6), 1333-1342. ISSN 0962-1083

Accès réservé (Intranet IRD) Demander le PDF

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1111/mec.14880

Titre
Association mapping desiccation resistance within chromosomal inversions in the African malaria vector Anopheles gambiae
Année de publication2019
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000465219200010
AuteursAyala Diego, Zhang S., Chateau M., Fouet C., Morlais Isabelle, Costantini Carlo, Hahn M. W., Besansky N. J.
SourceMolecular Ecology, 2019, 28 (6), p. 1333-1342. ISSN 0962-1083
RésuméInversion polymorphisms are responsible for many ecologically important phenotypes and are often found under balancing selection. However, the same features that ensure their large role in local adaptation-especially reduced recombination between alternate arrangements-mean that uncovering the precise loci within inversions that control these phenotypes is unachievable using standard mapping approaches. Here, we take advantage of long-term balancing selection on a pair of inversions in the mosquito Anopheles gambiae to map desiccation tolerance via pool-GWAS. Two polymorphic inversions on chromosome 2 of this species (denoted 2La and 2Rb) are associated with arid and hot conditions in Africa and are maintained in spatially and temporally heterogeneous environments. After measuring thousands of wild-caught individuals for survival under desiccation stress, we used phenotypically extreme individuals homozygous for alternative arrangements at the 2La inversion to construct pools for whole-genome sequencing. Genomewide association mapping using these pools revealed dozens of significant SNPs within both 2La and 2Rb, many of which neighboured genes controlling ion channels or related functions. Our results point to the promise of similar approaches in systems with inversions maintained by balancing selection and provide a list of candidate genes underlying the specific phenotypes controlled by the two inversions studied here.
Plan de classementEntomologie médicale / Parasitologie / Virologie [052] ; Sciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020]
Descr. géo.CAMEROUN
LocalisationFonds IRD [F B010075644]
Identifiant IRDfdi:010075644
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010075644

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Cayenne

Nouméa

Papeete

Abidjan

Dakar

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito