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Sonon P., Sadissou I., Tokplonou L., M'po K. K. G., Glitho S. S. C., Agniwo P., Ibikounle M., Massaro J. D., Massougbodji A., Moreau P., Sabbagh A., Mendes C. T., Moutairou K. A., Castelli E. C., Courtin David, Donadi E. A. (2018). HLA-G, -E and -F regulatory and coding region variability and haplotypes in the Beninese Toffin population sample. Molecular Immunology, 104, 108-127. ISSN 0161-5890

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Lien direct chez l'éditeur doi:10.1016/j.molimm.2018.08.016

Titre
HLA-G, -E and -F regulatory and coding region variability and haplotypes in the Beninese Toffin population sample
Année de publication2018
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000452818000013
AuteursSonon P., Sadissou I., Tokplonou L., M'po K. K. G., Glitho S. S. C., Agniwo P., Ibikounle M., Massaro J. D., Massougbodji A., Moreau P., Sabbagh A., Mendes C. T., Moutairou K. A., Castelli E. C., Courtin David, Donadi E. A.
SourceMolecular Immunology, 2018, 104, p. 108-127. ISSN 0161-5890
RésuméHLA-G/E/F genes exhibit immunomodulatory properties and are expressed in placenta. Little attention has been devoted to the study of these genes in sub-Saharan African populations, which are yet the most diverse. To fill this gap, we evaluated the complete gene variability, approximately 5.1 kb for HLA-G (n = 149), 7.7 kb for HLAE (n = 150) and 6.2 kb for HLA-P (n = 152) in the remote Beninese Toffin population, using massive parallel sequencing. Overall, 96, 37 and 68 variable sites were detected along the entire HLA-G,-E and-F, respectively, arranged into region-specific haplotypes; i.e., promoter haplotypes (16, 19, and 15 respectively), coding haplotypes (19, 15, and 29 respectively), 3' untranslated region (3'UTR) haplotypes (12, 7 and 2, respectively) and extended haplotypes (33, 31 and 32 respectively). All promoter/coding/3'UTR haplotypes followed the patterns already described in worldwide populations. HLA-E was the most conserved, exhibiting mainly two full-length encoded-molecules (E*01:01 and E*01:03), followed by HLA-F, three full-length proteins (F*01:01, F*01:02 and F*01:03) and HLA-G, four proteins: three full-length (G*01:01, G*01:03 and G*01:04) and one truncated (G*01:05N). Although HLA-G/E/F alleles in the Toffin population were the most frequently observed worldwide, the frequencies of the coding haplotypes were closely similar to those described for other African populations (Guinea-Conakry and Burkina-Faso), when compared to non-African ones (Brazilian), indicating that variable sites along these genes were present in Africa before human dispersion.
Plan de classementSanté : généralités [050] ; Sciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020]
Descr. géo.BENIN
LocalisationFonds IRD [F B010074796]
Identifiant IRDfdi:010074796
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010074796

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