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Bouderbala I., El Saadi N., Bah A., Auger Pierre. (2018). A 3D individual-based model to study effects of chemotaxis, competition and diffusion on the motile-phytoplankton aggregation. Acta Biotheoretica, 66 (4), 257-278. ISSN 0001-5342

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Lien direct chez l'éditeur doi:10.1007/s10441-018-9318-y

Titre
A 3D individual-based model to study effects of chemotaxis, competition and diffusion on the motile-phytoplankton aggregation
Année de publication2018
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000449962200002
AuteursBouderbala I., El Saadi N., Bah A., Auger Pierre.
SourceActa Biotheoretica, 2018, 66 (4), p. 257-278. ISSN 0001-5342
RésuméIn this paper, we develop a 3D-individual-based model (IBM) to understand effect of various small-scale mechanisms in phytoplankton cells, on the cellular aggregation process. These mechanisms are: spatial interactions between cells due to their chemosensory abilities (chemotaxis), a molecular diffusion and a demographical process. The latter is considered as a branching process with a density-dependent death rate to take into account the local competition on resources. We implement the IBM and simulate various scenarios under real parameter values for phytoplankton cells. To quantify the effects of the different processes quoted above on the spatial and temporal distribution of phytoplankton, we used two spatial statistics: the Clark-Evans index and the group belonging percentage. Our simulation study highlights the role of the branching process with a weak-to-medium competition in reinforcing the aggregating structure that forms from attraction mechanisms (under suitable conditions for diffusion and attraction forces), and shows by contrast that aggregations cannot form when competition is high.
Plan de classementSciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020] ; Ecologie, systèmes aquatiques [036]
LocalisationFonds IRD [F B010074400]
Identifiant IRDfdi:010074400
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010074400

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