Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

Publications des scientifiques de l'IRD

Guerrero J., Andrello M., Burgarella Concetta, Manel S. (2018). Soil environment is a key driver of adaptation in Medicago truncatula : new insights from landscape genomics. New Phytologist, 219 (1), 378-390. ISSN 0028-646X

Accès réservé (Intranet IRD) Document en accès réservé (Intranet IRD)

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1111/nph.15171

Titre
Soil environment is a key driver of adaptation in Medicago truncatula : new insights from landscape genomics
Année de publication2018
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000434153200037
AuteursGuerrero J., Andrello M., Burgarella Concetta, Manel S.
SourceNew Phytologist, 2018, 219 (1), p. 378-390. ISSN 0028-646X
RésuméSpatial differences in environmental selective pressures interact with the genomes of organisms, ultimately leading to local adaptation. Landscape genomics is an emergent research area that uncovers genome-environment associations, thus allowing researchers to identify candidate loci for adaptation to specific environmental variables. In the present study, we used latent factor mixed models (LFMMs) and Moran spectral outlier detection/randomization (MSOD-MSR) to identify candidate loci for adaptation to 10 environmental variables (climatic, soil and atmospheric) among 43515 single nucleotide polymorphisms (SNPs) from 202 accessions of the model legume Medicago truncatula. Soil variables were associated with a large number of candidate loci identified through both LFMMs and MSOD-MSR. Genes tagged by candidate loci associated with drought and salinity are involved in the response to biotic and abiotic stresses, while those tagged by candidates associated with soil nitrogen and atmospheric nitrogen, participate in the legume-rhizobia symbiosis. Candidate SNPs identified through both LFMMs and MSOD-MSR explained up to 56% of variance in flowering traits. Our findings highlight the importance of soil in driving adaptation in the system and elucidate the basis of evolutionary potential of M.truncatula to respond to global climate change and anthropogenic disruption of the nitrogen cycle.
Plan de classementSciences du monde végétal [076] ; Pédologie [068] ; Biotechnologies [084] ; Sciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020]
Descr. géo.ZONE MEDITERRANEENNE
LocalisationFonds IRD [F B010073677]
Identifiant IRDfdi:010073677
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073677

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Nouméa

Papeete

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito