Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

Publications des scientifiques de l'IRD

Guichet E., Serrano L., Laurent Christian, Eymard-Duvernay Sabrina, Kuaban C., Vidal Laurent, Delaporte E., Ngole E. M., Ayouba Ahidjo, Peeters Martine. (2018). Comparison of different nucleic acid preparation methods to improve specific HIV-1 RNA isolation for viral load testing on dried blood spots. Journal of Virological Methods, 251, 75-79. ISSN 0166-0934

Accès réservé (Intranet IRD) Document en accès réservé (Intranet IRD)

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1016/j.jviromet.2017.10.014

Titre
Comparison of different nucleic acid preparation methods to improve specific HIV-1 RNA isolation for viral load testing on dried blood spots
Année de publication2018
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000416617100012
AuteursGuichet E., Serrano L., Laurent Christian, Eymard-Duvernay Sabrina, Kuaban C., Vidal Laurent, Delaporte E., Ngole E. M., Ayouba Ahidjo, Peeters Martine.
SourceJournal of Virological Methods, 2018, 251, p. 75-79. ISSN 0166-0934
RésuméIn resource-limited countries (RLCs), WHO recommends HIV viral load (VL) on dried blood spots (DBS) for antiretroviral therapy (ART) monitoring of patients living in non-urban settings where plasma VL is not available. In order to reduce the impact of proviral DNA interference, leading to false positive results in samples with low plasma VL, we compared three different nucleic acid preparation methods with the NucliSens (Biomerieux) extraction, known for its high recovery of nucleic acids on DBS. Paired plasma-DBS samples (n = 151) with predominantly low plasma VL (<= 10,000 copies/ml; 74%) were used. At the threshold of 1,000 copies/ml on DBS, 51% and 10% were misclassified as false positives or false negatives, respectively with NucliSens, versus 41% and 20% with m2000sp (Abbott), described as more specific for RNA recovery. DNase treatments of nucleic acid extracts and free virus elution (FVE) protocol before nucleic acid extraction, reduced the proportion of false positives to 0% and 19%, but increased the proportion of false negatives to 40% and 73%. More efforts are thus still needed to improve performance of VL assays on DBS to monitor patients on ART in RLCs and allow timely switch to more costly second or third line ART regimes.
Plan de classementEntomologie médicale / Parasitologie / Virologie [052] ; Sciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020]
LocalisationFonds IRD [F B010071409]
Identifiant IRDfdi:010071409
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010071409

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Nouméa

Papeete

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito