Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

Publications des scientifiques de l'IRD

Morillo E., Knudsen S. R., Second Gérard. (2017). Assessment of genetic relationships between cultivated arracacha (Arracacia xanthorrhiza Bancr.) and its wild close relatives in the area of domestication using microsatellite markers. Conservation Genetics, 18 (6), 1267-1275. ISSN 1566-0621

Accès réservé (Intranet IRD) Document en accès réservé (Intranet IRD)

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1007/s10592-017-0978-y

Titre
Assessment of genetic relationships between cultivated arracacha (Arracacia xanthorrhiza Bancr.) and its wild close relatives in the area of domestication using microsatellite markers
Année de publication2017
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000414148900004
AuteursMorillo E., Knudsen S. R., Second Gérard.
SourceConservation Genetics, 2017, 18 (6), p. 1267-1275. ISSN 1566-0621
RésuméArracacha (Arracacia xanthorrhiza Bancr.) is an asexual propagated root crop domesticated in the Andean highlands, which exists naturally with polycarpic and monocarpic forms. Wild A. xanthorrhiza are present in the area of domestication and can occasionally be mistaken in the same field for a crop or a weed. To study genetic relationships between cultivated arracacha and the wild forms, we surveyed the diversity of 178 plant samples at 11 microsatellite (SSR) loci. As expected, wild A. xanthorrhiza forms showed a significantly higher allelic diversity for all the examined SSR markers. The cultivated pool showed an excess of heterozygosity as opposed to a deficit found in the wild compartment. High Fst values and AMOVA analysis suggest that the cultivated variety has genetically differentiated from the wild forms and is more related to the wild polycarpic than to the monocarpic. Both the wild forms were well distinguished from the cultivars. Nevertheless, among a set of F1 experimental hybrids (cultivated x wild polycarpic), some other genotypes were revealed, also being admixed. Our results highlight a large genetic base available in the wild populations of A. xanthorrhiza with potential implications for the utilization and breeding of this promising crop.
Plan de classementSciences du monde végétal [076]
Descr. géo.EQUATEUR, PEROU, ANDES
LocalisationFonds IRD [F B010071331]
Identifiant IRDfdi:010071331
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010071331

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Nouméa

Papeete

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito