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Varshney R. K., Shi Chengcheng, Thudi M., Mariac Cédric, Wallace J., Qi P., Zhang H., Zhao Y. S., Wang X. Y., Rathore A., Srivastava R. K., Chitikineni A., Fan G. Y., Bajaj P., Punnuri S., Gupta S. K., Wang H., Jiang Y., Couderc Marie, Katta Mavsk, Paudel D. R., Mungra K. D., Chen W. B., Harris-Shultz K. R., Garg V., Desai N., Doddamani D., Kane N. A., Conner J. A., Ghatak A., Chaturvedi P., Subramaniam S., Yadav O. P., Berthouly Cécile, Hamidou F., Wang J. P., Liang X. M., Clotault Jeremy, Upadhyaya H. D., Cubry Philippe, Rhoné Bénédicte, Gueye M. C., Sunkar R., Dupuy C., Sparvoli F., Cheng S. F., Mahala R. S., Singh B., Yadav R. S., Lyons E., Datta S. K., Hash C. T., Devos K. M., Buckler E., Bennetzen J. L., Paterson A. H., Ozias-Akins P., Grando S., Wang J., Mohapatra T., Weckwerth W., Reif J. C., Liu X., Vigouroux Yves, Xu X. (2017). Pearl millet genome sequence provides a resource to improve agronomic traits in arid environments. Nature Biotechnology, 35 (10), 969-976 + 7 p.. ISSN 1087-0156

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Lien direct chez l'éditeur doi:10.1038/nbt.3943

Titre
Pearl millet genome sequence provides a resource to improve agronomic traits in arid environments
Année de publication2017
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000412764600021
AuteursVarshney R. K., Shi Chengcheng, Thudi M., Mariac Cédric, Wallace J., Qi P., Zhang H., Zhao Y. S., Wang X. Y., Rathore A., Srivastava R. K., Chitikineni A., Fan G. Y., Bajaj P., Punnuri S., Gupta S. K., Wang H., Jiang Y., Couderc Marie, Katta Mavsk, Paudel D. R., Mungra K. D., Chen W. B., Harris-Shultz K. R., Garg V., Desai N., Doddamani D., Kane N. A., Conner J. A., Ghatak A., Chaturvedi P., Subramaniam S., Yadav O. P., Berthouly Cécile, Hamidou F., Wang J. P., Liang X. M., Clotault Jeremy, Upadhyaya H. D., Cubry Philippe, Rhoné Bénédicte, Gueye M. C., Sunkar R., Dupuy C., Sparvoli F., Cheng S. F., Mahala R. S., Singh B., Yadav R. S., Lyons E., Datta S. K., Hash C. T., Devos K. M., Buckler E., Bennetzen J. L., Paterson A. H., Ozias-Akins P., Grando S., Wang J., Mohapatra T., Weckwerth W., Reif J. C., Liu X., Vigouroux Yves, Xu X.
SourceNature Biotechnology, 2017, 35 (10), p. 969-976 + 7 p.. ISSN 1087-0156
RésuméPearl millet [Cenchrus americanus (L.) Morrone] is a staple food for more than 90 million farmers in arid and semi-arid regions of sub-Saharan Africa, India and South Asia. We report the similar to 1.79 Gb draft whole genome sequence of reference genotype Tift 23D(2)B(1)-P1-P5, which contains an estimated 38,579 genes. We highlight the substantial enrichment for wax biosynthesis genes, which may contribute to heat and drought tolerance in this crop. We resequenced and analyzed 994 pearl millet lines, enabling insights into population structure, genetic diversity and domestication. We use these resequencing data to establish marker trait associations for genomic selection, to define heterotic pools, and to predict hybrid performance. We believe that these resources should empower researchers and breeders to improve this important staple crop.
Plan de classementSciences du monde végétal [076] ; Sciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020]
Descr. géo.AFRIQUE SUBSAHARIENNE ; INDE ; ASIE DU SUD
LocalisationFonds IRD [F B010071241]
Identifiant IRDfdi:010071241
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010071241

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