Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

Publications des scientifiques de l'IRD

Tournebize R., Manel S., Vigouroux Yves, Munoz F., Kochko de Alexandre, Poncet Valérie. (2017). Two disjunct Pleistocene populations and anisotropic postglacial expansion shaped the current genetic structure of the relict plant Amborella trichopoda. PLOS One, 12 (8), e0183412 [18 p.]. ISSN 1932-6203

Fichier PDF disponible http://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers17-09/010070945.pdf

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1371/journal.pone.0183412

En Libre Accès sur HAL https://hal.umontpellier.fr/hal-01808409

Titre
Two disjunct Pleistocene populations and anisotropic postglacial expansion shaped the current genetic structure of the relict plant Amborella trichopoda
Année de publication2017
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000408010000021
AuteursTournebize R., Manel S., Vigouroux Yves, Munoz F., Kochko de Alexandre, Poncet Valérie.
SourcePLOS One, 2017, 12 (8), p. e0183412 [18 p.]. p. e0183412 [18 p.] ISSN 1932-6203
RésuméPast climate fluctuations shaped the population dynamics of organisms in space and time, and have impacted their present intra-specific genetic structure. Demo-genetic modelling allows inferring the way past demographic and migration dynamics have determined this structure. Amborella trichopoda is an emblematic relict plant endemic to New Caledonia, widely distributed in the understory of non-ultramafic rainforests. We assessed the influence of the last glacial climates on the demographic history and the paleo-distribution of 12 Amborella populations covering the whole current distribution. We performed coalescent genetic modelling of these dynamics, based on both whole-genome resequencing and microsatellite genotyping data. We found that the two main genetic groups of Amborella were shaped by the divergence of two ancestral populations during the last glacial maximum. From 12,800 years BP, the South ancestral population has expanded 6.3-fold while the size of the North population has remained stable. Recent asymmetric gene flow between the groups further contributed to the phylogeographical pattern. Spatially explicit coalescent modelling allowed us to estimate the location of ancestral populations with good accuracy (< 22 km) and provided indications regarding the mid-elevation pathways that facilitated postglacial expansion.
Plan de classementSciences du monde végétal [076] ; Etudes, transformation, conservation du milieu naturel [082] ; Sciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020] ; Sciences du milieu [021] ; Géologie et formations superficielles [064]
Descr. géo.NOUVELLE CALEDONIE
LocalisationFonds IRD [F B010070945]
Identifiant IRDfdi:010070945
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070945

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Nouméa

Papeete

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito