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Alou M. T., Million M., Traore S. I., Mouelhi D., Khelaifia S., Bachar D., Caputo A., Delerce J., Brah S., Alhousseini D., Sokhna Cheikh, Robert C., Diallo B. A., Diallo A., Parola P., Golden M., Lagier J. C., Raoult D. (2017). Gut bacteria missing in severe acute malnutrition, can we identify potential probiotics by culturomics ?. Frontiers in Microbiology, 8, art. 899 [17 p.]. ISSN 1664-302X

Fichier PDF disponiblehttp://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers17-06/010070082.pdf[ PDF Link ]

Lien direct chez l'éditeur doi:10.3389/fmicb.2017.0089

Titre
Gut bacteria missing in severe acute malnutrition, can we identify potential probiotics by culturomics ?
Année de publication2017
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000402235700002
AuteursAlou M. T., Million M., Traore S. I., Mouelhi D., Khelaifia S., Bachar D., Caputo A., Delerce J., Brah S., Alhousseini D., Sokhna Cheikh, Robert C., Diallo B. A., Diallo A., Parola P., Golden M., Lagier J. C., Raoult D.
SourceFrontiers in Microbiology, 2017, 8, p. art. 899 [17 p.]. p. art. 899 [17 p.] ISSN 1664-302X
RésuméSevere acute malnutrition is the world-leading cause of children under-five's death. Recent metagenomics studies have established a link between gut microbiota and severe acute malnutrition, describing an immaturity with a striking depletion in oxygen sensitive prokaryotes. Amoxicillin and therapeutic diet cure most of the children with severe acute malnutrition but an irreversible disruption of the gut microbiota is suspected in the refractory and most severe cases. In these cases, therapeutic diet may be unable to reverse the microbiota alteration leading to persistent impaired development or death. In addition, as enteric sepsis is a major cause of death in this context, identification of missing gut microbes to be tested as probiotics (live bacteria that confer a benefit to the host) to restore rapidly the healthy gut microbiota and prevent the gut pathogenic invasion is of foremost importance. In this study, stool samples of malnourished patients with kwashiorkor and healthy children were collected from Niger and Senegal and analyzed by culturomics and metagenomics. We found a globally decreased diversity, a decrease in the hitherto unknown diversity (new species isolation), a depletion in oxygen sensitive prokaryotes including Methanobrevibacter smithii and an enrichment in potentially pathogenic Proteobacteria, Fusobacteria and Streptococcus gallolyticus. A complex of 12 species identified only in healthy children using culturomics and metagenomics were identified as probiotics candidates, providing a possible, defined, reproducible, safe, and convenient alternative to fecal transplantation to restore a healthy gut microbiota in malnourished children. Microbiotherapy based on selected strains has the potential to improve the current treatment of severe acute malnutrition and prevent relapse and death by reestablishing a healthy gut microbiota.
Plan de classementNutrition, alimentation [054] ; Biotechnologies [084]
LocalisationFonds IRD [F B010070082]
Identifiant IRDfdi:010070082
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070082

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