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Alou M. T., Rathored J., Michelle C., Dubourg G., Andrieu C., Armstrong N., Sokhna Cheikh, Diallo A., Raoult D., Fournier P. E. (2017). Inediibacterium massiliense gen. nov., sp. nov., a new bacterial species isolated from the gut microbiota of a severely malnourished infant. Antonie Van Leeuwenhoek International = Journal of General and Molecular Microbiology, 110 (6), 737-750. ISSN 0003-6072

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Lien direct chez l'éditeur doi:10.1007/s10482-017-0843-5

Titre
Inediibacterium massiliense gen. nov., sp. nov., a new bacterial species isolated from the gut microbiota of a severely malnourished infant
Année de publication2017
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000401464000002
AuteursAlou M. T., Rathored J., Michelle C., Dubourg G., Andrieu C., Armstrong N., Sokhna Cheikh, Diallo A., Raoult D., Fournier P. E.
SourceAntonie Van Leeuwenhoek International = Journal of General and Molecular Microbiology, 2017, 110 (6), p. 737-750. ISSN 0003-6072
RésuméA novel strain, Mt12(T) (=CSUR P1907 = DSM 100590), was isolated from the fecal sample of a 7-month-old girl from Senegal afflicted with severe acute malnutrition. This bacterium is a strictly anaerobic, spore-forming Gram-stain positive bacillus. The major cellular fatty acid was identified as tetradecanoic acid. Its 16S rRNA gene sequence exhibited 94.9% similarity with that of Crassaminicella profunda strain Ra1766H(T), currently the closest species with a validly published name. The draft genome of strain Mt12(T) is 3,497,275-bp long with a 30.45% of G+C content. 3397 genes were predicted, including 3268 protein-coding genes and 129 RNAs, including eight 16S rRNAs. Genomic comparison with closely related species with an available genome showed a lower quantitative genomic content. The phylogenetic analysis alongside the dDDH values under 30% and phenotypic characteristics suggest that strain Mt12(T) represents a new genus within the family Clostridiaceae, for which the name Inediibacterium massiliense gen. nov., sp. nov. is proposed.
Plan de classementNutrition, alimentation [054] ; Biotechnologies [084]
Descr. géo.SENEGAL
LocalisationFonds IRD [F B010070048]
Identifiant IRDfdi:010070048
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070048

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