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Ben Hania W., Joseph Manon, Bunk B., Sproer C., Klenk H. P., Fardeau Marie-Laure, Spring S. (2017). Characterization of the first cultured representative of a Bacteroidetes clade specialized on the scavenging of cyanobacteria. Environmental Microbiology, 19 (3), 1134-1148. ISSN 1462-2912

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Lien direct chez l'éditeur doi:10.1111/1462-2920.13639

Titre
Characterization of the first cultured representative of a Bacteroidetes clade specialized on the scavenging of cyanobacteria
Année de publication2017
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000397525100025
AuteursBen Hania W., Joseph Manon, Bunk B., Sproer C., Klenk H. P., Fardeau Marie-Laure, Spring S.
SourceEnvironmental Microbiology, 2017, 19 (3), p. 1134-1148. ISSN 1462-2912
RésuméThe anaerobic, mesophilic and moderately halophilic strain L21-Spi-D4(T) was recently isolated from the suboxic zone of a hypersaline cyanobacterial mat using protein-rich extracts of Arthrospira (formerly Spirulina) platensis as substrate. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA genes indicated an affiliation of the novel strain with the Bacteroidetes clade MgMjR-022, which is widely distributed and abundant in hypersaline microbial mats and heretofore comprised only sequences of uncultured bacteria. Analyses of the complete genome sequence of strain L21-Spi-D4(T) revealed a possible specialization on the degradation of cyanobacterial biomass. Besides genes for enzymes degrading specific cyanobacterial proteins a conspicuous transport complex for the polypeptide cyanophycin could be identified that is homologous to typical polysaccharide utilization loci of Bacteroidetes. A distinct and reproducible co-occurrence pattern of environmental 16S rRNA gene sequences of the MgMjR-022 clade and cyanobacteria in the suboxic zone of hypersaline mats points to a specific dependence of members of this clade on decaying cyanobacteria. Based on a comparative analysis of phenotypic, genomic and ecological characteristics we propose to establish the novel taxa Salinivirga cyanobacteriivorans gen. nov., sp. nov., represented by the type strain L21-Spi-D4(T), and Salinivirgaceae fam. nov., comprising sequences of the MgMjR-022 clade.
Plan de classementBiotechnologies [084]
LocalisationFonds IRD [F B010069416]
Identifiant IRDfdi:010069416
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010069416

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