Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

 

Publications des scientifiques de l'IRD

Nugraha M. F. I., Pouyaud Laurent, Carman O., Kadarusman, Widyastuti U., Avarre Jean-Christophe. (2014). Development of twelve novel polymorphic microsatellite DNA markers for the Boeseman's rainbowfish (Melanotaenia boesemani) and tests for their cross-utility in 21 rainbowfish species from West Papua (Indonesia). European Journal of Wildlife Research, 60 (6), 941-946. ISSN 1612-4642

Accès réservé (Intranet IRD) Demander le PDF

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1007/s10344-014-0868-2

Titre
Development of twelve novel polymorphic microsatellite DNA markers for the Boeseman's rainbowfish (Melanotaenia boesemani) and tests for their cross-utility in 21 rainbowfish species from West Papua (Indonesia)
Année de publication2014
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000344778300012
AuteursNugraha M. F. I., Pouyaud Laurent, Carman O., Kadarusman, Widyastuti U., Avarre Jean-Christophe.
SourceEuropean Journal of Wildlife Research, 2014, 60 (6), p. 941-946. ISSN 1612-4642
RésuméWe developed 12 microsatellite markers for the endangered Boeseman's rainbowfish (Melanotaenia boesemani). Twenty-eight individuals from the type locality at Ayamaru Lake were examined, and all loci were polymorphic with a number of alleles per locus varying from 3 to 18. Average observed and expected heterozygosities were 0.681 and 0.678, respectively. Cross-species amplification was successfully obtained for 21 Melanotaenia species, with a number of alleles per locus ranging between 1 and 20. Average observed and expected heterozygosities varied between 0.105 and 0.708 and 0.118-0.755, respectively. Only 21 inbreeding coefficient (Fis) values presented a significant homozygote excess among the 264 locus-by-locus calculated values. Tests for genotyping errors revealed that four of these 21 significant Fis values could be explained by the presence of null alleles. These new microsatellite markers appear highly reliable for further conservation purposes or population genetic studies of the many rainbowfish endangered species.
Plan de classementLimnologie biologique / Océanographie biologique [034] ; Sciences du monde animal [080]
Descr. géo.PAPOUASIE NOUVELLE GUINEE
LocalisationFonds IRD [F B010062705]
Identifiant IRDfdi:010062705
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010062705

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Cayenne

Nouméa

Papeete

Abidjan

Dakar

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito