Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

 

Publications des scientifiques de l'IRD

Volant A., Bruneel Odile, Desoeuvre A., Hery M., Casiot C., Bru N., Delpoux S., Fahy A., Javerliat F., Bouchez O., Duran R., Bertin P. N., Elbaz-Poulichet F., Lauga B. (2014). Diversity and spatiotemporal dynamics of bacterial communities : physicochemical and other drivers along an acid mine drainage. Fems Microbiology Ecology, 90 (1), 247-263. ISSN 0168-6496

Accès réservé (Intranet IRD) Demander le PDF

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1111/1574-6941.12394

Titre
Diversity and spatiotemporal dynamics of bacterial communities : physicochemical and other drivers along an acid mine drainage
Année de publication2014
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000343809700020
AuteursVolant A., Bruneel Odile, Desoeuvre A., Hery M., Casiot C., Bru N., Delpoux S., Fahy A., Javerliat F., Bouchez O., Duran R., Bertin P. N., Elbaz-Poulichet F., Lauga B.
SourceFems Microbiology Ecology, 2014, 90 (1), p. 247-263. ISSN 0168-6496
RésuméDeciphering the biotic and abiotic factors that control microbial community structure over time and along an environmental gradient is a pivotal question in microbial ecology. Carnoules mine (France), which is characterized by acid waters and very high concentrations of arsenic, iron, and sulfate, provides an excellent opportunity to study these factors along the pollution gradient of Reigous Creek. To this end, biodiversity and spatiotemporal distribution of bacterial communities were characterized using T-RFLP fingerprinting and high-throughput sequencing. Patterns of spatial and temporal variations in bacterial community composition linked to changes in the physicochemical conditions suggested that species-sorting processes were at work in the acid mine drainage. Arsenic, temperature, and sulfate appeared to be the most important factors that drove the composition of bacterial communities along this continuum. Time series investigation along the pollution gradient also highlighted habitat specialization for some major members of the community (Acidithiobacillus and Thiomonas), dispersal for Acidithiobacillus, and evidence of extinction/re-thriving processes for Gallionella. Finally, pyrosequencing revealed a broader phylogenetic range of taxa than previous clone library-based diversity. Overall, our findings suggest that in addition to environmental filtering processes, additional forces (dispersal, birth/death events) could operate in AMD community.
Plan de classementBiotechnologies [084] ; Hydrologie [062] ; Pollution [038] ; Etudes, transformation, conservation du milieu naturel [082]
Descr. géo.FRANCE
LocalisationFonds IRD [F B010062654]
Identifiant IRDfdi:010062654
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010062654

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Cayenne

Nouméa

Papeete

Abidjan

Dakar

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito