Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

 

Publications des scientifiques de l'IRD

Amrani A., Bergon A., Holota H., Tamburini C., Garel M., Ollivier Bernard, Imbert J., Dolla A., Pradel Nathalie. (2014). Transcriptomics reveal several gene expression patterns in the piezophile Desulfovibrio hydrothermalis in response to hydrostatic pressure. Plos One, 9 (9), e106831. ISSN 1932-6203

Fichier PDF disponiblehttp://horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers17-08/010062567.pdf[ PDF Link ]

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1371/journal.pone.0106831

En Libre Accès sur HAL https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01628348

Titre
Transcriptomics reveal several gene expression patterns in the piezophile Desulfovibrio hydrothermalis in response to hydrostatic pressure
Année de publication2014
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000341774300025
AuteursAmrani A., Bergon A., Holota H., Tamburini C., Garel M., Ollivier Bernard, Imbert J., Dolla A., Pradel Nathalie.
SourcePlos One, 2014, 9 (9), p. e106831. p. e106831 ISSN 1932-6203
RésuméRNA-seq was used to study the response of Desulfovibrio hydrothermalis, isolated from a deep-sea hydrothermal chimney on the East-Pacific Rise at a depth of 2,600 m, to various hydrostatic pressure growth conditions. The transcriptomic datasets obtained after growth at 26, 10 and 0.1 MPa identified only 65 differentially expressed genes that were distributed among four main categories: aromatic amino acid and glutamate metabolisms, energy metabolism, signal transduction, and unknown function. The gene expression patterns suggest that D. hydrothermalis uses at least three different adaptation mechanisms, according to a hydrostatic pressure threshold (HPt) that was estimated to be above 10 MPa. Both glutamate and energy metabolism were found to play crucial roles in these mechanisms. Quantitation of the glutamate levels in cells revealed its accumulation at high hydrostatic pressure, suggesting its role as a piezolyte. ATP measurements showed that the energy metabolism of this bacterium is optimized for deep-sea life conditions. This study provides new insights into the molecular mechanisms linked to hydrostatic pressure adaptation in sulfate-reducing bacteria.
Plan de classementLimnologie biologique / Océanographie biologique [034] ; Biotechnologies [084] ; Sciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020]
Descr. géo.PACIFIQUE
LocalisationFonds IRD [F B010062567]
Identifiant IRDfdi:010062567
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010062567

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


* PDF Link :

    à télécharger pour citer/partager ce document sur les réseaux sociaux académiques


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Cayenne

Nouméa

Papeete

Abidjan

Dakar

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito