Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

 

Publications des scientifiques de l'IRD

Andrianasolo D. N., Davis A. P., Razafinarivo N. J., Hamon Serge, Rakotomalala J. J., Sabatier S. A., Hamon Perla. (2013). High genetic diversity of in situ and ex situ populations of Madagascan coffee species : further implications for the management of coffee genetic resources. Tree Genetics and Genomes, 9 (5), 1295-1312. ISSN 1614-2942

Accès réservé (Intranet IRD) Demander le PDF

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1007/s11295-013-0638-4

Titre
High genetic diversity of in situ and ex situ populations of Madagascan coffee species : further implications for the management of coffee genetic resources
Année de publication2013
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000324514800014
AuteursAndrianasolo D. N., Davis A. P., Razafinarivo N. J., Hamon Serge, Rakotomalala J. J., Sabatier S. A., Hamon Perla.
SourceTree Genetics and Genomes, 2013, 9 (5), p. 1295-1312. ISSN 1614-2942
RésuméThe genetic diversity of endemic Madagascan Coffea species has not received any considerable attention, despite the high extinction threat facing most of the species on the island. In order to address this shortfall, we assessed and compared the genetic diversity and allelic richness of ex situ and in situ populations for four selected species, and 18 ex situ populations maintained at the Kianjavato Coffee Research Station. We also investigated the possibility of in situ and ex situ hybridization events for Madagascan coffee, both within and between species. For these purposes, we used 18 nuclear microsatellite markers, on a total of 37 Coffea populations (4 in situ and 33 ex situ) representing a total of 398 genotypes (96 in situ and 302 ex situ) for 23 species. Our study showed (1) strong differentiation between Madagascan Coffea species; (2) good differentiation between all the populations studied, including those from the same locality (even when the area of the locality was restricted); (3) good evidence for both in situ and ex situ hybridization, although in situ hybridization appeared to be limited; (4) much higher genetic diversity within in situ collections compared to ex situ collections; and (5) that, despite limitations, the Kianjavato Coffee Research Station collection is an extremely valuable resource of Madagascan coffee germplasm. Recommendations for in situ and ex situ germplasm conservation are discussed.
Plan de classementSciences du monde végétal [076]
Descr. géo.MADAGASCAR
LocalisationFonds IRD [F B010061145]
Identifiant IRDfdi:010061145
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010061145

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Cayenne

Nouméa

Papeete

Abidjan

Dakar

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito