Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

IRD

 

Publications des scientifiques de l'IRD

Poncet Valérie, Munoz F., Munzinger Jérôme, Pillon Yohan, Gomez Céline, Couderc Marie, Dubreuil Tranchant Christine, Hamon Serge, Kochko Alexandre de. (2013). Phylogeography and niche modelling of the relict plant Amborella trichopoda (Amborellaceae) reveal multiple Pleistocene refugia in New Caledonia. Molecular Ecology, 22 (24), 6163-6178. ISSN 1365-294X

Accès réservé (Intranet IRD) Demander le PDF

Lien direct chez l'éditeur doi:10.1111/mec.12554

Titre
Phylogeography and niche modelling of the relict plant Amborella trichopoda (Amborellaceae) reveal multiple Pleistocene refugia in New Caledonia
Année de publication2013
Type de documentArticle
AuteursPoncet Valérie, Munoz F., Munzinger Jérôme, Pillon Yohan, Gomez Céline, Couderc Marie, Dubreuil Tranchant Christine, Hamon Serge, Kochko Alexandre de.
SourceMolecular Ecology, 2013, 22 (24), p. 6163-6178. ISSN 1365-294X
RésuméAmborella trichopoda Baill. (Amborellaceae, Amborellales), the sole living member of the sister group to all other extant angiosperms, is endemic to New Caledonia. We addressed the intraspecific phylogeography of Amborella by investigating whether its present population genetic structure could be related to its current and past habitats. We found moderate range-wide genetic diversity based on nuclear microsatellite data and detected four well-differentiated, geographically distinct genetic groups using Bayesian clustering analyses. We modelled the ecological niche of Amborella based on the current climatic and environmental conditions. The predictive ability of the model was very good throughout the Central East mainland zone, but Amborella was predicted in the northern part of the island where this plant has not been reported. Furthermore, no significant barrier was detected based on habitat suitability that could explain the genetic differentiation across the area. Conversely, we found that the main genetic clusters could be related to the distribution of the suitable habitat at the last glacial maximum (LGM, c. 21000years BP), when Amborella experienced a dramatic 96.5% reduction in suitable area. At least two lineages survived in distinct putative refugia located in the Massif des Levres and in the vicinity of Mount Aoupinie. Our findings finally confirmed the importance of LGM rainforest refugia in shaping the current intra- and interspecific diversity in New Caledonian plants and revealed the possibility of an as yet unreported refugium. The combination of niche modelling and population genetics thereby offered novel insight into the biogeographical history of an emblematic taxon.
Plan de classementFloristique / Phytogéographie [076BOTA03]
DescripteursARBUSTE ; FORET ; ESPECE ENDEMIQUE ; VARIABILITE GENETIQUE ; STRUCTURE DE POPULATION ; GENETIQUE DE POPULATION ; HABITAT ; PHYLOGENIE ; DISTRIBUTION SPATIALE ; GENOTYPE ; NICHE ECOLOGIQUE ; MODELE ; PROBABILITE ; FACTEUR CLIMATIQUE ; PLEISTOCENE ; BIOGEOGRAPHIE ; HISTOIRE ; ETUDE COMPARATIVE ; PHYLOGEOGRAPHIE ; DIVERSITE GENETIQUE ; MARQUEUR MOLECULAIRE ; MICROSATELLITE ; ZONE REFUGE
Descr. géo.NOUVELLE CALEDONIE ; ZONE TROPICALE HUMIDE
LocalisationFonds IRD [F B010060228]
Identifiant IRDfdi:010060228
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010060228

Export des données

Disponibilité des documents

Télechargment fichier PDF téléchargeable

Lien sur le Web lien chez l'éditeur

Accès réservé en accès réservé

HAL en libre accès sur HAL


Accès aux documents originaux :

Le FDI est labellisé CollEx

Accès direct

Bureau du chercheur

Site de la documentation

Espace intranet IST (accès réservé)

Suivi des publications IRD (accès réservé)

Mentions légales

Services Horizon

Poser une question

Consulter l'aide en ligne

Déposer une publication (accès réservé)

S'abonner au flux RSS

Voir les tableaux chronologiques et thématiques

Centres de documentation

Bondy

Montpellier (centre IRD)

Montpellier (MSE)

Cayenne

Nouméa

Papeete

Abidjan

Dakar

Niamey

Ouagadougou

Tunis

La Paz

Quito