Publications des scientifiques de l'IRD

Barre Philippe, Noirot Michel, Louarn Jacques, Duperray C., Hamon Serge. (1996). Reliable flow cytometric estimation of nuclear DNA content in coffee trees. Cytometry, 24, p. 32-38. ISSN 0196-4763.

Titre du document
Reliable flow cytometric estimation of nuclear DNA content in coffee trees
Année de publication
1996
Type de document
Article
Auteurs
Barre Philippe, Noirot Michel, Louarn Jacques, Duperray C., Hamon Serge
Source
Cytometry, 1996, 24, p. 32-38 ISSN 0196-4763
La cytométrie en flux a permis d'obtenir des mesures précises de la taille des génomes de deux taxons (C. liberica dewevrei et C. pseudozanguebariae). L'iodure de propidium (IP) et le Petunia hybrida ont été utilisés, respectivement, comme fluorochrome et standard interne. La linéarité de la relation entre la quantité d'ADN et le signal fluorescent digitalisé a été vérifiée. Cinq résultats majeurs ressortent : des conditions expérimentales optimales ont été définies pour l'estimation de la position des pics (moyenne et mode), le temps de coloration (au moins deux minutes), le voltage du photomultiplicateur (557 V) et de la concentration en IP (330 microg/ml) ; les effets du voltage et de la concentration en IP ont été paramétrés ; deux biais dus aux variations de voltage et de concentration en IP ont été décelés dans l'estimation de la quantité d'ADN par noyau. Ces biais ont été minimisés ; les tailles de génome de C. liberica dewevrei et de C. pseudozanguebariae ont été estimées avec précision (respectivement 2C = 1,421 plus ou moins 0,005 pg et 2C = 1,129 plus ou moins 0,005 pg) ; des variations entre génotypes ont été mises en évidence dans chaque taxon. (Résumé d'auteur)
Plan de classement
Taxonomie [076BOTA01]
Descripteurs
BOTANIQUE ; GENETIQUE ; GENOTYPE ; NOYAU CELLULAIRE ; ADN ; CYTOGENETIQUE ; ANALYSE STATISTIQUE ; CYTOTAXONOMIE
Localisation
Fonds IRD [F B010006011]
Identifiant IRD
fdi:010006011
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