Bossis M., Rivoal R. (1996). Protein variability in cereal cyst nematodes from different geographic regions assessed by two-dimensional gel electrophoresis. Fundamental and Applied Nematology, 19 (1), p. 25-34. ISSN 1164-5571.
Titre du document
Protein variability in cereal cyst nematodes from different geographic regions assessed by two-dimensional gel electrophoresis
Année de publication
1996
Type de document
Article
Auteurs
Bossis M., Rivoal R.
Source
Fundamental and Applied Nematology, 1996,
19 (1), p. 25-34 ISSN 1164-5571
La variabilité protéique de douze populations de nématodes à kyste des céréales provenant de sept pays (quatre continents) a été étudiée à partir de trois échantillons par population, chacun constitué de 40 femelles blanches âgées de 50 jours, produites sur le même blé, Triticum aestivum cv. Arminda, en conditions contrôlées. La pathogénie de chaque isolat est précisée par référence à la littérature ou/et à des tests d'hôtes complémentaires. Trois électrophorèses sont réalisées par échantillon protéique avec de légères modifications apportées aux techniques de migration (O'Farrell, 1975) et de coloration (Oakley et al., 1980). 320 polypeptides sont détectés sur l'ensemble des populations. Les profils protéiques sont comparés par analyse d'images informatisée à l'aide d'une station Vax (4000.60), d'un scanner (Eikonix, Kodak) et du logiciel Kepler (L.S.B. Corporation). Différents degrès de sévérité dans l'acceptation de la détection des spots ont été établis selon leur volume et/ou une gamme d'amplitudes. Les indices de similarité (F) et les distances génétiques (D = 1-F) sont calculés à partir des spots homologues. Les dendrogrammes correspondants sont construits selon la méthode UPGMA. Les résultats montrent une grande variabilité protéique entre populations et une séparation nette entre le groupe Heterodera avenae sensu stricto et le groupe Gotland. Dans le groupe H. avenae sensu stricto, les deux populations françaises et un isolat d'Australie du sud sont fortement apparentés. Des protéines spécifiques des deux pathotypes français Ha12 et Ha12/FR2 sont caractérisées. La comparaison des profils protéiques par analyse d'images informatisée est discutée. (Résumé d'auteur)
