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Elbir H., Robert C., Nguyen T. T., Gimenez G., El Sanousi S. M., Flock J. I., Raoult Didier, Drancourt M. (2013). Staphylococcus aureus subsp. anaerobius strain ST1464 genome sequence. Standards in Genomic Sciences, 9 (1), 1-13. ISSN 1944-3277

Lien direct chez l'éditeur doi:10.4056/sigs.3747423

Titre
Staphylococcus aureus subsp. anaerobius strain ST1464 genome sequence
Année de publication2013
Type de documentArticle référencé dans le Web of Science WOS:000328323400001
AuteursElbir H., Robert C., Nguyen T. T., Gimenez G., El Sanousi S. M., Flock J. I., Raoult Didier, Drancourt M.
SourceStandards in Genomic Sciences, 2013, 9 (1), p. 1-13. ISSN 1944-3277
RésuméStaphylococcus aureus subsp. anaerobius is responsible for Morel's disease in animals and a cause of abscess in humans. It is characterized by a microaerophilic growth, contrary to the other strains of S. aureus. The 2,604,446-bp genome (32.7% GC content) of S. anaerobius ST1464 comprises one chromosome and no plasmids. The chromosome contains 2,660 open reading frames (ORFs), 49 tRNAs and three complete rRNAs, forming one complete operon. The size of ORFs ranges between 100 to 4,600 bp except for two ORFs of 6,417 and 7,173 bp encoding segregation ATPase and non-ribosomal peptide synthase, respectively. The chromosome harbors Staphylococcus phage 2638A genome and incomplete Staphylococcus phage genome PT1028, but no detectable CRISPRS. The antibiotic resistance gene for tetracycline was found although Staphylococcus aureus subsp. anaerobius is susceptible to tetracycline in-vitro. Intact oxygen detoxification genes encode superoxide dismutase and cytochrome quinol oxidase whereas the catalase gene is impaired by a stop codon. Based on the genome, in-silico multilocus sequence typing indicates that S. aureus subsp. anaerobius emerged as a clone separated from all other S. aureus strains, illustrating host-adaptation linked to missing functions. Availability of S. aureus subsp. anaerobius genome could prompt the development of post-genomic tools for its rapid discrimination from S. aureus.
Plan de classementEntomologie médicale / Parasitologie / Virologie [052] ; Biotechnologies [084] ; Sciences fondamentales / Techniques d'analyse et de recherche [020] ; Sciences du monde animal [080]
LocalisationFonds IRD
Identifiant IRDPAR00011281
Lien permanenthttp://www.documentation.ird.fr/hor/PAR00011281

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