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Publications des scientifiques de l'IRD

Nouveautés - Océanographie / Hydrobiologie - Articles

  1. Fricke R., Mahafina J., Behivoke F., Joanalison H., Léopold Marc, Ponton Dominique. Annotated checklist of the fishes of Madagascar, southwestern Indian Ocean, with 158 new records. FishTaxa : Journal of Fish Taxonomy, 2018, 3 (1), p. 1-432. ISSN 2458-942X

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  2. Joanalison H., Mahafina J., Ponton Dominique. Fish post-larvae assemblages at two contrasted coral reef habitats in southwest Madagascar. Regional Studies in Marine Science, 2018, 6, p. 62-74. ISSN 2352-4855

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  3. Rouault M., Illig Serena, Lübbecke J., Imbol Koungue R.A. Origin, development and demise of the 2010–2011 Benguela Nino. In : Shannon L. (ed.), Moloney C. (ed.), Lamont T. (ed.), Makhado A. (ed.), Roy Claude (ed.), Gro Vea Salvanes A. (ed.), Shin Yunne-Jai (ed.). Benguela : opportunity, challenge and change. Journal of Marine Systems, 2018, p. 39-48. ISSN 0924-7963

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  4. Keith P., Dahruddin H., Limmon G., Hubert Nicolas. A new species of Schismatogobius (Teleostei : Gobiidae) from Halmahera (Indonesia). Cybium, 2018, 42 (2), p. 195-200. ISSN 0399-0974

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  5. Darrenougue N., De Deckker P., Eggins S., Fallon S., Payri Claude. A record of mining and industrial activities in New Caledonia based on trace elements in rhodolith-forming coralline red algae. Chemical Geology, 2018, 493, p. 24-36. ISSN 0009-2541

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  6. Ben Abdallah M., Karray F., Kallel N., Armougom Fabrice, Mhiri N., Quéméneur Marianne, Cayol J. L., Erauso G., Sayadi S. Abundance and diversity of prokaryotes in ephemeral hypersaline lake Chott El Jerid using Illumina Miseq sequencing, DGGE and qPCR assays. Extremophiles, 2018, 22 (5), p. 811-823. ISSN 1431-0651

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  7. Quispe-Ccalluari C., Tam J., Demarcq Hervé, Chamorro A., Espinoza-Morriberon D., Romero C., Dominguez N., Ramos J., Oliveros-Ramos R. An index of coastal thermal effects of El Nino Southern Oscillation on the Peruvian Upwelling Ecosystem. International Journal of Climatology, 2018, 38 (7), p. 3191-3201. ISSN 0899-8418

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  8. Favareto L. R., Rudorff N., Kampel M., Frouin R., Rottgers R., Doxaran D., Murakami H., Dupouy Cécile. Bio-optical characterization and ocean colour inversion in the Eastern Lagoon of New Caledonia, South Tropical Pacific. Remote Sensing, 2018, 10 (7), p. art. 1043 [30 p.]. ISSN 2072-4292

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  9. Hette-Tronquart N., Oberdorff Thierry, Tales E., Zahm A., Belliard J. Biological impacts of local vs. regional land use on a small tributary of the Seine River (France) : insights from a food web approach based on stable isotopes. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (24), p. 23583-23594. ISSN 0944-1344

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  10. Taillardat P., Ziegler A. D., Friess D. A., Widory D., Van V. T., David F., Nguyen T. N., Marchand Cyril. Carbon dynamics and inconstant porewater input in a mangrove tidal creek over contrasting seasons and tidal amplitudes. Geochimica et Cosmochimica Acta, 2018, 237, p. 32-48. ISSN 0016-7037

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  11. Yakoubi L., Benmalek Y., Benayad T., Fardeau Marie-Laure. Characterization of cadmium-resistant bacteria isolated from polluted soils in Algeria, and evaluation of cadmium removal, using living free and immobilized cells. Revue d'Ecologie : La Terre et La Vie, 2018, 73 (3), p. 255-268. ISSN 0249-7395

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  12. Cellamare M., Duval C., Drelin Y., Djediat C., Touibi N., Agogue H., Leboulanger Christophe, Ader M., Bernard C. Characterization of phototrophic microorganisms and description of new cyanobacteria isolated from the saline-alkaline crater-lake Dziani Dzaha (Mayotte, Indian Ocean). FEMS Microbiology Ecology, 2018, 94 (8), p. fiy108 [25 p.]. ISSN 0168-6496

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  13. Somot S., Houpert L., Sevault F., Testor P., Bosse A., Taupier-Letage I., Bouin M. N., Waldman R., Cassou C., Sanchez-Gomez E., de Madron X. D., Adloff F., Nabat P., Herrmann Marine. Characterizing, modelling and understanding the climate variability of the deep water formation in the North-Western Mediterranean Sea. Climate Dynamics, 2018, 51 (3), p. 1179-1210. ISSN 0930-7575

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  14. Maire E., Villeger S., Graham N. A. J., Hoey A. S., Cinner J., Ferse S. C. A., Aliaume C., Booth D. J., Feary D. A., Kulbicki Michel, Sandin S. A., Vigliola Laurent, Mouillot D. Community-wide scan identifies fish species associated with coral reef services across the Indo-Pacific. Proceedings of the Royal Society B : Biological Sciences, 2018, 285 (1883), p. art. 20181167 [9 p.]. ISSN 0962-8452

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  15. Obura D. O., Bigot L., Benzoni Francesca. Coral responses to a repeat bleaching event in Mayotte in 2010. PeerJ, 2018, 6, p. e5305 [22 p.]. ISSN 2167-8359

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  16. Sebag David, Garcin Y., Adatte T., Deschamps Pierre, Ménot G., Verrecchia E. P. Correction for the siderite effect on Rock-Eval parameters : application to the sediments of Lake Barombi (southwest Cameroon). Organic Geochemistry, 2018, 123, p. 126-135. ISSN 0146-6380

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  17. Collet A., Durand Jean-Dominique, Desmarais E., Cerqueira F., Cantinelli T., Valade P., Ponton Dominique. DNA barcoding post-larvae can improve the knowledge about fish biodiversity : an example from La Réunion, SW Indian Ocean. Mitochondrial DNA Part A, 2018, 29 (6), p. 905-918. ISSN 2470-1394

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  18. Trott C. B., Subrahmanyam B., Chaigneau Alexis, Delcroix Thierry. Eddy tracking in the Northwestern Indian Ocean during southwest monsoon regimes. Geophysical Research Letters, 2018, 45 (13), p. 6594-6603. ISSN 0094-8276

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  19. Timmermann A., An S. I., Kug J. S., Jin F. F., Cai W. J., Capotondi A., Cobb K., Lengaigne Matthieu, McPhaden M. J., Stuecker M. F., Stein K., Wittenberg A. T., Yun K. S., Bayr T., Chen H. C., Chikamoto Y., Dewitte Boris, Dommenget D., Grothe P., Guilyardi E., Ham Y. G., Hayashi M., Ineson S., Kang D., Kim S., Kim W., Lee J. Y., Li T., Luo J. J., McGregor S., Planton Y., Power S., Rashid H., Ren H. L., Santoso A., Takahashi K., Todd A., Wang G. M., Wang G. J., Xie R. H., Yang W. H., Yeh S. W., Yoon J., Zeller E., Zhang X. B. El Nino-Southern Oscillation complexity. Nature, 2018, 559 (7715), p. 535-545. ISSN 0028-0836

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  20. Biscere T., Ferrier-Pages C., Grover R., Gilbert A., Rottier C., Wright A., Payri Claude, Houlbrèque Fanny. Enhancement of coral calcification via the interplay of nickel and urease. Aquatic Toxicology, 2018, 200, p. 247-256. ISSN 0166-445X

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  21. Candal R., Curutchet G. A., Dominguez-Montero L., Macarie Hervé, Poggi-Varaldo H. M., Sastre-Conde I., Vazquez S. C. Environmental biotechnology and engineering : two convergent areas to provide real solutions for a growing world [Editorial]. In : Candal R. (ed.), CurutchetG.A. (ed.), Domínguez-Montero L. (ed.), Macarie Hervé (ed.), Poggi-Varaldo H.M (ed.), Sastre-Conde I. (ed.), Vázquez S. (ed.) Advances in environmental biotechnology and engineering 2016. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (22), p. 21267-21271. ISSN 0944-1344

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  22. Neo M. L., Wabnitz C. C. C., Braley R. D., Heslinga G. A., Fauvelot Cécile, Van Wynsberge S., Andréfouët Serge, Waters C., Tan A. S. H., Gomez E. D., Costello M. J., Todd P. A. Giant clams (bivalvia : cardiidae : tridacninae) : a comprehensive update of species and their distribution, current threats and conservation status. Oceanography and Marine Biology : an Annual Review, 2017, 55 (No spécial), p. 87-387. ISSN 0078-3218

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  23. Prairie Y. T., Alm J., Beaulieu J., Barros N., Battin T., Cole J., del Giorgio P., DelSontro T., Guérin Frédéric, Harby A., Harrison J., Mercier-Blais S., Serca D., Sobek S., Vachon D. Greenhouse gas emissions from freshwater reservoirs : what does the atmosphere see ?. Ecosystems, 2018, 21 (5), p. 1058-1071. ISSN 1432-9840

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  24. Bettarel Yvan, Combe Marine, Adingra A., Ndiaye A., Bouvier T., Panfili Jacques, Durand Jean-Dominique. Hordes of phages in the gut of the Tilapia Sarotherodon melanotheron. Scientific Reports - Nature, 2018, 8, p. art. 11311 [6 p.]. ISSN 2045-2322

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  25. Gaboriau T., Leprieur F., Mouillot D., Hubert Nicolas. Influence of the geography of speciation on current patterns of coral reef fish biodiversity across the Indo-Pacific. Ecography, 2018, 41 (8), p. 1295-1306. ISSN 0906-7590

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  26. Cretat J., Terray Pascal, Masson S., Sooraj K. P. Intrinsic precursors and timescale of the tropical Indian Ocean Dipole : insights from partially decoupled numerical experiment. Climate Dynamics, 2018, 51 (4), p. 1311-1332. ISSN 0930-7575

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  27. Barhoumi B., Castro-Jimenez J., Guigue C., Goutx M., Sempere R., Derouiche A., Achour A., Touil S., Driss M. R., Tedetti Marc. Levels and risk assessment of hydrocarbons and organochlorines in aerosols from a North African coastal city (Bizerte, Tunisia). Environmental Pollution, 2018, 240, p. 422-431. ISSN 0269-7491

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  28. Dutheil C., Aumont Olivier, Gorgues Thomas, Lorrain Anne, Bonnet Sophie, Rodier Martine, Dupouy Cécile, Shiozaki T., Menkès Christophe. Modelling N-2 fixation related to Trichodesmium sp. : driving processes and impacts on primary production in the tropical Pacific Ocean. Biogeosciences, 2018, 15 (14), p. 4333-4352. ISSN 1726-4170

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  29. Lagabrielle Erwann, Lombard A. T., Harris J. M., Livingstone T. C. Multi-scale multi-level marine spatial planning : a novel methodological approach applied in South Africa. PLoS One, 2018, 13 (7), p. e0192582 [29 p.]. ISSN 1932-6203

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  30. Alves F. D., De Lemos R. D. F., Cardoso I. A., De Araujo Mdlc, Bertrand Arnaud, Souza J. F. New records of deep-sea prawn of the genus Gennadas Spence Bate, 1881 (Crustacea : Decapoda : Benthesicymidae) from Southwestern Atlantic. Zootaxa, 2018, 4450 (3), p. 376-384. ISSN 1175-5326

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  31. Reverdin G., Valdimarsson H., Alory Gaël, Diverrès Denis, Bringas F., Goni G., Heilmann L., Chafik L., Szekely T., Friedman A. R. North Atlantic subpolar gyre along predetermined ship tracks since 1993 : a monthly data set of surface temperature, salinity, and density. Earth System Science Data, 2018, 10 (3), p. 1403-1415. ISSN 1866-3508

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  32. Jaspers C., Huwer B., Antajan E., Hosia A., Hinrichsen H. H., Biastoch A., Angel D., Asmus R., Augustin C., Bagheri S., Beggs S. E., Balsby T. J. S., Boersma M., Bonnet D., Christensen J. T., Daenhardt A., Delpy Floriane, Falkenhaug T., Finenko G., Fleming N. E. C., Fuentes V., Galil B., Gittenberger A., Griffin D. C., Haslob H., Javidpour J., Kamburska L., Kube S., Langenberg V. T., Lehtiniemi M., Lombard F., Malzahn A., Marambio M., Mihneva V., Moller L. F., Niermann U., Okyar M. I., Ozdemir Z. B., Pitois S., Reusch T. B. H., Robbens J., Stefanova K., Thibault D., Veer H. W. D., Vansteenbrugge L., Walraven L., Wozniczka A. Ocean current connectivity propelling the secondary spread of a marine invasive comb jelly across western Eurasia. Global Ecology and Biogeography, 2018, 27 (7), p. 814-827. ISSN 1466-822X

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  33. Bonilla-Castillo C. A., Cordoba E. A., Gomez G., Duponchelle Fabrice. Population dynamics of Prochilodus nigricans (Characiformes : Prochilodontidae) in the Putumayo River. Neotropical Ichthyology, 2018, 16 (2), p. art. 170139 [12 p.]. ISSN 1679-6225

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  34. Langer G., Sadekov A., Nehrke G., Baggini C., Rodolfo-Metalpa Riccardo, Hall-Spencer J. M., Cuoco E., Bijma J., Elderfield H. Relationship between mineralogy and minor element partitioning in limpets from an Ischia CO2 vent site provides new insights into their biomineralization pathway. In : Marchitto T.M. (ed.), de Baar H. (ed.), Erez J. (ed.), Hodell D. (ed.), Mills R. (ed.), Rickaby R. (ed.), Rohling E. (ed.) Chemistry of oceans past and present : a special Issue in tribute to Harry Elderfield. Geochimica et Cosmochimica Acta, 2018, 236 (No spécial), p. 218-229. ISSN 0016-7037

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  35. Maia P. D., Maurice Laurence, Tessier E., Amouroux D., Cossa D., Moreira Turcq Patricia, Etcheber H. Role of the floodplain lakes in the methylmercury distribution and exchanges with the Amazon River, Brazil. Journal of Environmental Sciences, 2018, 68, p. 24-40. ISSN 1001-0742

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  36. Fernandez I., Granadeiro L., Darias Maria Jose, Gavaia P. J., Andree K. B., Gisbert E. Solea senegalensis skeletal ossification and gene expression patterns during metamorphosis : new clues on the onset of skeletal deformities during larval to juvenile transition. Aquaculture, 2018, 496, p. 153-165. ISSN 0044-8486

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  37. Macarie Hervé, Esquivel M., Laguna A., Baron O., El Mamouni R., Guiot S. R., Monroy O. Strategy to identify the causes and to solve a sludge granulation problem in methanogenic reactors : application to a full-scale plant treating cheese wastewater. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (22), p. 21318-21331. ISSN 0944-1344

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  38. Illig Serena, Cadier E., Bachelery M. L., Kersale M. Subseasonal coastal-trapped wave propagations in the Southeastern Pacific and Atlantic Oceans : 1. A New approach to estimate wave amplitude. Journal of Geophysical Research : Oceans, 2018, 123 (6), p. 3915-3941. ISSN 2169-9275

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  39. Illig Serena, Bachelery M. L., Cadier E. Subseasonal coastal-trapped wave propagations in the Southeastern Pacific and Atlantic Oceans : 2. Wave characteristics and connection with the equatorial variability. Journal of Geophysical Research : Oceans, 2018, 123 (6), p. 3942-3961. ISSN 2169-9275

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  40. Aigle A., Bonin P., Fernandez-Nunez N., Loriod B., Guasco S., Bergon A., Armougom Fabrice, Iobbi-Nivol C., Imbert J., Michotey V. The nature of the electron acceptor (MnIV/NO3) triggers the differential expression of genes associated with stress and ammonium limitation responses in Shewanella algae C6G3. FEMS Microbiology Letters, 2018, 365 (13), p. fny068 [9 p.]. ISSN 0378-1097

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  41. Woignier T., Clostre F., Fernandes P., Soler A., Rangon Luc, Sastre-Conde M. I., Jannoyer M. L. The pesticide chlordecone is trapped in the tortuous mesoporosity of allophane clays. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (22), p. 21350-21361. ISSN 0944-1344

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  42. Rabearisoa Njaratiana, Sabarros P. S., Romanov E. V., Lucas V., Bach Pascal. Toothed whale and shark depredation indicators : a case study from the Reunion Island and Seychelles pelagic longline fisheries. PLoS One, 2018, 13 (8), p. e0202037 [26 p.]. ISSN 1932-6203

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  43. Vidal Eric, Thibault M., Bourgeois K. Underpin tourism regulation with data. Nature, 2018, 560 (7717), p. 167-167. ISSN 0028-0836

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  44. Grados C., Chaigneau Alexis, Echevin Vincent, Dominguez N. Upper ocean hydrology of the Northern Humboldt Current System at seasonal, interannual and interdecadal scales. Progress in Oceanography, 2018, 165, p. 123-144. ISSN 0079-6611

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  45. Abadie E., Chiantella C., Crottier A., Rhodes L., Masseret Estelle, Berteaux T., Laabir Mohamed. What are the main environmental factors driving the development of the neurotoxic dinoflagellate Vulcanodinium rugosum in a Mediterranean ecosystem (Ingril lagoon, France) ?. Harmful Algae, 2018, 75, p. 75-86. ISSN 1568-9883

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  46. Muthusankar G., Proisy Christophe, Balasubramanian D., Bautes N., Bhalla R. S., Mathevet R., Ricout A., Babu D. S., Vasudevan S. When socio-economic plans exacerbate vulnerability to physical coastal processes on the South East coast of India. Journal of Coastal Research, 2018, (85), p. 1446-1450. ISSN 0749-0208

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  47. Thiebault A., Dubroca L., Mullers R. H. E., Tremblay Yann, Pistorius P. A. "M2B" package in R : deriving multiple variables from movement data to predict behavioural states with random forests. Methods in Ecology and Evolution, 2018, 9 (6), p. 1548-1555. ISSN 2041-210X

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  48. Lefebvre Jean-Pierre, Mari Xavier, Chu T. V. A laboratory study on the generation of estuarine negatively, neutrally and positively buoyant bio-mediated flocs. Estuarine Coastal and Shelf Science, 2018, 208, p. 180-190. ISSN 0272-7714

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  49. Kantoussan J., Ecoutin Jean-Marc, Laë Raymond, Thiaw O. T., Tito de Morais Luis. A multimetric-index approach using fisheries data to assess fish assemblage structure in relation to salinity gradient in a tropical West African estuary. African Journal of Marine Science, 2018, 40 (2), p. 175-185. ISSN 1814-232X

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073214 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  50. Lins R. C., Martinez Jean-Michel, Marques D. D., Cirilo J. A., Medeiros P. R. P., Fragoso C. R. A multivariate analysis framework to detect key environmental factors affecting spatiotemporal variability of chlorophyll-a in a tropical productive estuarine-lagoon system. Remote Sensing, 2018, 10 (6), p. art. 853 [17 p.]. ISSN 2072-4292

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073604 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF

  51. Andrade M. C., Jégu Michel, Buckup P. A., Netto-Ferreira A. L. A new Myleus species (Characiformes : Serrasalmidae) from the Rio Tapajos basin, Brazil. Journal of Fish Biology, 2018, 92 (6), p. 1902-1914. ISSN 0022-1112

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073146 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  52. Ampou E. E., Ouillon Sylvain, Andréfouët Serge. Challenges in rendering Coral Triangle habitat richness in remotely sensed habitat maps : the case of Bunaken Island (Indonesia). In : Indonesia seas management. Marine Pollution Bulletin, 2018, 131 Part B (No spécial), p. 72-82. ISSN 0025-326X

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073615 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

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