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Publications des scientifiques de l'IRD

Nouveautés - Sciences du monde végétal et animal

  1. Yatat Djeumen I.V., Tchuinté Tamen A., Dumont Y., Couteron Pierre. A tribute to the use of minimalistic spatially-implicit models of savanna vegetation dynamics to address broad spatial scales in spite of scarce data. Biomath, 2018, 7 (2), 29 p. [en ligne] ISSN 1314-684X

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  2. Mekki I., Zitouna Chebbi, Jacob Frédéric, Ben Mechlia N., Prevot L., Albergel Jean, Voltz M. Impact of land use on soil water content in a hilly rainfed agrosystem : a case study in the Cap Bon peninsula in Tunisia. Agrofor International Journal, 2018, 3 (1), p. 64-74. ISSN 2490-3434

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  3. Candal R. (ed.), Curutchet G. (ed.), Dominguez-Montero L. (ed.), Macarie Hervé (ed.), Poggi-Varaldo H. (ed.), Sastre-Conde I. (ed.), Vasquez S.C. (ed.) Advances in Environmental biotechnology and engineering 2016 and original papers. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (22), p. 21267-21466. ISEBE : International Symposium of Environmental Biotechnology and Engineering, 5., San Martin (ARG), 2016/07/25-29. ISSN 0944-1344

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  4. Sultan Benjamin, Roudier P., Traoré S. The impacts of climate change on crop yields in West Africa. In : Sultan Benjamin (ed.), Lalou Richard (ed.), Amadou Sanni M. (ed.), Oumarou A. (ed.), Soumaré M.A. (ed.) Rural societies in the face of climatic and environmental changes in West Africa. Marseille : IRD, 2017, p. 199-214. (Synthèses). ISBN 978-2-7099-2424-5


  5. Bassene Hubert, Niang E. A., Fenollar F., Dipankar B., Doucouré Souleymane, Ali E., Michelle C., Raoult D., Sokhna Cheikh, Mediannikov Oleg. 16S metagenomic comparison of Plasmodium falciparum-infected and noninfected Anopheles gambiae and Anopheles funestus microbiota from Senegal. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 2018, 99 (6), p. 1489-1498. ISSN 0002-9637

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  6. da Silva M. S., Gurgel H., Laques Anne-Elisabeth, Silveira B. D., de Siqueira R. V. 30 anos de dinâmica espaçotemporal (1984-2015) da regiao de influencia do Parque Nacional da Chapada dos Veadeiros – Goias = 30 years of space-time dynamics (1984-2015) of the region of influence of Chapada dos Veadeiros National Park - Goias. Confins, 2018, 35, p. art. 14851 [22 p. en ligne]. ISSN 1958-9212

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  7. Ta K. N., Khong N. G., Ha T. L., Nguyen D. T., Mai D. C., Hoang T. G., Phung T. P. N., Bourrie I., Courtois B., Tran T. T. H., Dinh B. Y., La T. N., Do N. V., Lebrun Michel, Gantet Pascal, Jouannic Stefan. A genome-wide association study using a Vietnamese landrace panel of rice (Oryza sativa) reveals new QTLs controlling panicle morphological traits. BMC Plant Biology, 2018, 18, p. art. 282 [15 p.]. ISSN 1471-2229

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  8. Brottier Laurent, Chaintreuil Clémence, Simion P., Scornavacca C., Rivallan R., Mournet P., Moulin Lionel, Lewis G. P., Fardoux Joël, Brown S. C., Gomez-Pacheco M., Bourges M., Hervouet C., Gueye M., Duponnois Robin, Ramanankierana H., Randriambanona H., Vandrot H., Zabaleta M., DasGupta M., D'Hont A., Giraud Eric, Arrighi Jean-François. A phylogenetic framework of the legume genus Aeschynomene for comparative genetic analysis of the Nod-dependent and Nod-independent symbioses. BMC Plant Biology, 2018, 18, p. art. 333 [15 p.]. ISSN 1471-2229

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  9. Fovet O., Ruiz Laurent, Gruau G., Akkal N., Aquilina L., Busnot S., Dupas R., Durand P., Faucheux M., Fauvel Y., Flechard C., Gilliet N., Grimaldi C., Hamon Y., Jaffrezic A., Jeanneau L., Labasque T., Le Henaff G., Merot P., Molenat J., Petitjean P., Pierson-Wickmann A. C., Squividant H., Viaud V., Walter C., Gascuel-Odoux C. AgrHyS : an observatory of response times in agro-hydro systems. Vadose Zone Journal, 2018, 17 (1), p. art. 180066 [16 p.]. ISSN 1539-1663

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  10. Kouam E. B., Avana-Tientcheu M. L., Lekeumo V. D., Akitio H. M., Khasa D. P., Pasquet Rémy. Agro-ecological distribution of the phenotypic diversity of aerial yam (Dioscorea bulbifera L.) in Cameroon using multivariate analysis : prospect for germplasm conservation and improvement. Open Agriculture, 2018, 3 (1), p. 190-206. ISSN 2391-9531

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  11. Venkatesan A., Ngompe G. T., El Hassouni N., Chentli I., Guignon V., Jonquet C., Ruiz M., Larmande Pierre. Agronomic Linked Data (AgroLD) : a knowledge-based system to enable integrative biology in agronomy. PLoS One, 2018, 13 (11), p. e0198270 [17 p.]. ISSN 1932-6203

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  12. Aholoukpe H. N. S., Dubos B., Deleporte P., Flori A., Amadji L. G., Chotte Jean-Luc, Blavet Didier. Allometric equations for estimating oil palm stem biomass in the ecological context of Benin, West Africa. Trees : Structure and Function, 2018, 32 (6), p. 1669-1680. ISSN 0931-1890

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  13. Brugère J. F., Ben Hania W., Arnal M. E., Ribière C., Ballet N., Vandeckerkove P., Ollivier Bernard, O'Toole P. W. Archaea microbial candidates in next-generation probiotics development. Journal of Clinical Gastroenterology, 2018, 52 (Suppl. 1), p. S71-S73. ISSN 0192-0790

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  14. Malele I., Nyingilili H., Lyaruu E., Tauzin M., Ollivier Bernard, Cayol J. L., Fardeau Marie-Laure, Geiger Anne. Bacterial diversity obtained by culturable approaches in the gut of Glossina pallidipes population from a non sleeping sickness focus in Tanzania : preliminary results. BMC Microbiology, 2018, 18 (Suppl. 1), art. 164 [10 p.] ISSN 1471-2180

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  15. Narh Mensah D. L., Duponnois Robin, Bourillon Julie, Gressent F., Prin Y. Biochemical characterization and efficacy of Pleurotus, Lentinus and Ganoderma parent and hybrid mushroom strains as biofertilizers of attapulgite for wheat and tomato growth. Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, 2018, 16, p. 63-72. ISSN 1878-8181

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  16. Niang E. A., Bassene H., Fenollar F., Mediannikov Oleg. Biological control of mosquito-borne diseases : the potential of Wolbachia-based interventions in an IVM framework. Journal of Tropical Medicine, 2018, p. art. 1470459 [16 p.]. ISSN 1687-9686

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  17. Geiger Anne, Malele I., Abd-Alla A. M., Njiokou F. Blood feeding tsetse flies as hosts and vectors of mammals-pre-adapted African Trypanosoma : current and expected research directions. BMC Microbiology, 2018, 18 (Suppl. 1), p. art. 162 [13 p.]. ISSN 1471-2180

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  18. Mougin C., Artige E., Marchand F., Mondy S., Ratie C., Sellier N., Castagnone-Sereno P., D'Acier A. C., Esmenjaud D., Faivre-Primot C., Granjon Laurent, Hamelet V., Lange F., Pages S., Rimet F., Ris N., Salle G. BRC4Env, a network of Biological Resource Centres for research in environmental and agricultural sciences. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (34), p. 33849-33857. ISSN 0944-1344

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  19. Mellor K. C., Meyer A., Elkholly D. A., Fournie G., Long P. T., Inui K., Padungtod P., Gilbert M., Newman S. H., Vergne Timothée, Pfeiffer D. U., Stevens K. B. Comparative epidemiology of highly pathogenic avian influenza virus H5N1 and H5N6 in Vietnamese live bird markets : spatiotemporal patterns of distribution and risk factors. Frontiers in Veterinary Science, 2018, 5, p. 51. ISSN 2297-1769

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  20. Bouam A., Levasseur A., Bonnet Maryline, Borand L., Van Goethem C., Drancourt M., Godreuil S. Complete genome sequence of Mycobacterium sp. Strain 3519A. Microbiology Resource Announcements, 2018, 6 (4), p. e01565-17 [2 p.]. ISSN 2576-098X

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  21. Bouam A., Levasseur A., Bonnet Maryline, Borand L., Van Goethem C., Drancourt M., Godreuil S. Complete genome sequence of Mycobacterium sp. Strain 4858. Microbiology Resource Announcements, 2018, 6 (7), p. e01604-17 [2 p.]. ISSN 2576-098X

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  22. Cordonin C., Toty Céline, Mavingui P., Tortosa P. Complete genome sequences of three Leptospira mayottensis strains from Tenrecs that are endemic in the Malagasy region. Microbiology Resource Announcements, 2018, 7 (15), p. e01188-18 [2 p.]. ISSN 2576-098X

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  23. Esquivel-Muelbert A., Baker T. R., Dexter K. G., Lewis S. L., Brienen R. J. W., Feldpausch T. R., Lloyd J., Monteagudo-Mendoza A., Arroyo L., Alvarez-Davila E., Higuchi N., Marimon B. S., Marimon-Junior B. H., Silveira M., Vilanova E., Gloor E., Malhi Y., Chave J., Barlow J., Bonal D., Davila Cardozo N., Erwin T., Fauset S., Herault B., Laurance S., Poorter L., Qie L., Stahl C., Sullivan M. J. P., ter Steege H., Vos V. A., Zuidema P. A., Almeida E., Almeida de Oliveira E., Andrade A., Vieira S. A., Aragao L., Araujo-Murakami A., Arets E., Aymard C G. A., Baraloto C., Camargo P. B., Barroso J. G., Bongers F., Boot R., Camargo J. L., Castro W., Chama Moscoso V., Comiskey J., Cornejo Valverde F., Lola da Costa A. C., del Aguila Pasquel J., Di Fiore A., Fernanda Duque L., Elias F., Engel J., Flores Llampazo G., Galbraith D., Herrera Fernandez R., Honorio Coronado E., Hubau W., Jimenez-Rojas E., Lima A. J. N., Umetsu R. K., Laurance W., Lopez-Gonzalez G., Lovejoy T., Aurelio Melo Cruz O., Morandi P. S., Neill D., Nunez Vargas P., Pallqui Camacho N. C., Parada Gutierrez A., Pardo G., Peacock J., Pena-Claros M., Penuela-Mora M. C., Petronelli P., Pickavance G. C., Pitman N., Prieto A., Quesada C., Ramirez-Angulo H., Réjou-Méchain Maxime, Restrepo Correa Z., Roopsind A., Rudas A., Salomao R., Silva N., Silva Espejo J., Singh J., Stropp J., Terborgh J., Thomas R., Toledo M., Torres-Lezama A., Valenzuela Gamarra L., van de Meer P. J., van der Heijden G., van der Hout P., Vasquez Martinez R., Vela C., Vieira I. C. G., Phillips O. L. Compositional response of Amazon forests to climate change. Global Change Biology, 2019, 25 (1), p. 39-56. ISSN 1354-1013

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  24. Cabral A. I. R., Saito C., Pereira H., Laques Anne-Elisabeth. Deforestation pattern dynamics in protected areas of the Brazilian Legal Amazon using remote sensing data. Applied Geography, 2018, 100, p. 101-115. ISSN 0143-6228

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  25. Winkel Thierry, Aguirre M. G., Arizio C. M., Aschero C. A., Babot M. D., Benoit L., Burgarella Concetta, Costa-Tartara S., Dubois M. P., Gay L., Hocsman S., Jullien M., Lopez-Campeny S. M. L., Manifesto M. M., Navascues M., Oliszewski N., Pintar E., Zenboudji S., Bertero H. D., Joffre R. Discontinuities in quinoa biodiversity in the dry Andes : an 18-century perspective based on allelic genotyping. PLoS One, 2018, 13 (12), p. e0207519 [13 p.]. ISSN 1932-6203

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  26. Zouch H., Cabrol Léa, Chifflet Sandrine, Tedetti Marc, Karray F., Zaghden H., Sayadi S., Quéméneur Marianne. Effect of acidic industrial effluent release on microbial diversity and trace metal dynamics during resuspension of coastal sediment. Frontiers in Microbiology, 2018, 9, p. art. 3103 [ p.]. ISSN 1664-302X

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  27. Kariithi H. M., Meki I. K., Schneider D. I., De Vooght L., Khamis F. M., Geiger Anne, Demirbas-Uzel G., Vlak J. M., Ince I. A., Kelm S., Njiokou F., Wamwiri F. N., Malele II, Weiss B. L., Abd-Alla A. M. M. Enhancing vector refractoriness to trypanosome infection : achievements, challenges and perspectives. In : Abd-Alla A.M.M (ed.), Tsiamis G. (ed.), Boucias D.G. (ed.) Special issue on enhancing vector refractoriness to trypanosome infection-foreword . BMC Microbiology, 2018, 18 (Suppl. 1), p. art. 179 [13 p.]. ISSN 1471-2180

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  28. Delogu E., Boulet Gilles, Olioso A., Garrigues S., Brut A., Tallec T., Demarty Jérome, Soudani K., Lagouarde J. P. Evaluation of the SPARSE dual-source model for predicting water stress and evapotranspiration from thermal infrared data over multiple crops and climates. Remote Sensing, 2018, 10 (11), p. art. 1806 [20 p.]. ISSN 2072-4292

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  29. Bruy D., Hattermann T., Barrabe L., Mouly A., Barthelemy D., Isnard Sandrine. Evolution of plant architecture, functional diversification and divergent evolution in the genus Atractocarpus (Rubiaceae) for New Caledonia. Frontiers in Plant Science, 2018, 9, p. art. 1775 [17 p.]. ISSN 1664-462X

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  30. Adego A. K., Poulicard Nils, Galzi Agnès, Mukoye B., Fargette Denis, Were H. K., Hébrard Eugénie. Full-length genome sequences of recombinant and nonrecombinant sympatric strains of rice yellow mottle virus from Western Kenya. Microbiology Resource Announcements, 2018, 6 (8), p. e01508-17 [2p.]. ISSN 2576-098X

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  31. Cheik S., Bottinelli Nicolas, Sukumar R., Jouquet Pascal. Fungus-growing termite foraging activity increases water infiltration but only slightly and temporally impacts soil physical properties in southern Indian woodlands. European Journal of Soil Biology, 2018, 89, p. 20-24. ISSN 1164-5563

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  32. Le Quéré C., Andrew R. M., Friedlingstein P., Sitch S., Hauck J., Pongratz J., Pickers P. A., Korsbakken J. I., Peters G. P., Canadell J. G., Arneth A., Arora V. K., Barbero L., Bastos A., Bopp L., Chevallier F., Chini L. P., Ciais P., Doney S. C., Gkritzalis T., Goll D. S., Harris I., Haverd V., Hoffman F. M., Hoppema M., Houghton R. A., Hurtt G., Ilyina T., Jain A. K., Johannessen T., Jones C. D., Kato E., Keeling R. F., Goldewijk K. K., Landschutzer P., Lefèvre Nathalie, Lienert S., Liu Z., Lombardozzi D., Metzl N., Munro D. R., Nabel Jems, Nakaoka S., Neill C., Olsen A., Ono T., Patra P., Peregon A., Peters W., Peylin P., Pfeil B., Pierrot D., Poulter B., Rehder G., Resplandy L., Robertson E., Rocher M., Rodenbeck C., Schuster U., Schwinger J., Seferian R., Skjelvan I., Steinhoff T., Sutton A., Tans P. P., Tian H. Q., Tilbrook B., Tubiello F. N., van der Laan-Luijkx I. T., van der Werf G. R., Viovy N., Walker A. P., Wiltshire A. J., Wright R., Zaehle S., Zheng B. Global carbon budget 2018 [Data Paper]. Earth System Science Data, 2018, 10 (4), p. 2141-2194. ISSN 1866-3508

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  33. Bruelheide H., Dengler J., Purschke O., Lenoir J., Jimenez-Alfaro B., Hennekens S. M., Botta-Dukat Z., Chytry M., Field R., Jansen F., Kattge J., Pillar V. D., Schrodt F., Mahecha M. D., Peet R. K., Sandel B., van Bodegom P., Altman J., Alvarez-Davila E., Khan Masa, Attorre F., Aubin I., Baraloto C., Barroso J. G., Bauters M., Bergmeier E., Biurrun I., Bjorkman A. D., Blonder B., Carni A., Cayuela L., Cerny T., Cornelissen J. H. C., Craven D., Dainese M., Derroire G., De Sanctis M., Diaz S., Dolezal J., Farfan-Rios W., Feldpausch T. R., Fenton N. J., Garnier E., Guerin G. R., Gutierrez A. G., Haider S., Hattab T., Henry G., Herault B., Higuchi P., Holzel N., Homeier J., Jentsch A., Jurgens N., Kacki Z., Karger D. N., Kessler M., Kleyer M., Knollova I., Korolyuk A. Y., Kuhn I., Laughlin D. C., Lens F., Loos J., Louault F., Lyubenova M. I., Malhi Y., Marceno C., Mencuccini M., Muller J. V., Munzinger Jérôme, Myers-Smith I. H., Neill D. A., Niinemets U., Orwin K. H., Ozinga W. A., Penuelas J., Perez-Haase A., Petrik P., Phillips O. L., Partel M., Reich P. B., Romermann C., Rodrigues A. V., Sabatini F. M., Sardans J., Schmidt M., Seidler G., Espejo J. E. S., Silveira M., Smyth A., Sporbert M., Svenning J. C., Tang Z. Y., Thomas R., Tsiripidis I., Vassilev K., Violle C., Virtanen R., Weiher E., Welk E., Wesche K., Winter M., Wirth C., Jandt U. Global trait-environment relationships of plant communities. Nature Ecology and Evolution, 2018, 2 (12), p. 1906-1917. ISSN 2397-334X

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  34. Ribaudo C., Tison-Rosebery J., Buquet D., Jan G., Jamoneau A., Abril Gwenaël, Anschutz P., Bertrin V. Invasive aquatic plants as ecosystem engineers in an oligo-mesotrophic shallow lake. Frontiers in Plant Science, 2018, 9, p. art. 1781 [14 p.]. ISSN 1664-462X

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  35. Tongkaemkaew U., Sukkul J., Sumkhan N., Panklang P., Brauman Alain, Ismail R. Litterfall, litter decomposition, soil macrofauna, and nutrient content in rubber monoculture and rubber-based agroforestry plantations. In : Choenkwan S. (coord.), Fisher M.R. (coord.) Special Section : Agrarian transformation in Thailand : commodities, landscapes, and livelihoods . FS-Forest and Society, 2018, 2 (2), p. 138-149. ISSN 2549-4724

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  36. Zhang J. J., Shang Y. M., Wang E. T., Chen W. F., Lajudie de Philippe, Li B. Y., Guo C., Yang X., Zheng J. Q., Liu C. Z. Mesorhizobium jarvisii sv. astragali as predominant microsymbiont for Astragalus sinicus L. in acidic soils, Xinyang, China. Plant and Soil, 2018, 433 (1-2), p. 201-212. ISSN 0032-079X

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  37. Leauthaud C., Kergoat L., Hiernaux P., Grippa M., Musila W., Duvail Stéphanie, Albergel Jean. Modelling the growth of floodplain grasslands to explore the impact of changing hydrological conditions on vegetation productivity. Ecological Modelling, 2018, 387, p. 220-237. ISSN 0304-3800

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  38. Tallec T., Brut A., Joly L., Dumelie N., Serca D., Mordelet P., Claverie N., Legain D., Barrie J., Decarpenterie T., Cousin J., Zawilski B., Ceschia E., Guérin Frédéric, Le Dantec V. N2O flux measurements over an irrigated maize crop : a comparison of three methods. Agricultural and Forest Meteorology, 2019, 264, p. 56-72. ISSN 0168-1923

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  39. Brousseau Louise, Nidelet S., Streiff R. New WGS data and annotation of the heterosomal vs. autosomal localization of Ostrinia scapulalis (Lepidoptera, Crambidae) nuclear genomic scaffolds. Data in Brief, 2018, 20, p. 644-648. ISSN 2352-3409

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  40. Villabona-Arenas C. J., Ayouba Ahidjo, Esteban Amandine, D'Arc M., Ngole E. M., Peeters Martine. Noninvasive western lowland gorilla's health monitoring : a decade of simian immunodeficiency virus surveillance in southern Cameroon. Ecology and Evolution, 2018, 8 (22), p. 10698-10710. ISSN 2045-7758

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  41. Tlidi M., Clerc M. G., Escaff D., Couteron Pierre, Messaoudi M., Khaffou M., Makhoute A. Observation and modelling of vegetation spirals and arcs in isotropic environmental conditions : dissipative structures in arid landscapes. Philosophical Transactions of the Royal Society A -Mathematical Physical and Engineering Sciences, 2018, 376 (2135), p. art. 20180026 [14 p.]. ISSN 1364-503X

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  42. Gateble G., Barrabe L., McPherson G., Munzinger Jérôme, Snow N., Swenson U. One new endemic plant species on average per month in New Caledonia, including eight more new species from ile Art (Belep Islands), a major micro-hotspot in need of protection. Australian Systematic Botany, 2018, 31 (5-6), p. 448-480. ISSN 1030-1887

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