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Publications des scientifiques de l'IRD

Nouveautés - Océanographie / Hydrobiologie - Articles

  1. Berthelot H., Bonnet Sophie, Camps M., Grosso O., Moutin T. Assessment of the dinitrogen released as ammonium and dissolved organic nitrogen by unicellular and filamentous marine diazotrophic cyanobacteria grown in culture. Frontiers in Marine Science, 2015, 2, art. no 80 [14 p.] ISSN 2296-7745

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  2. Cillaurren Espérance, David Gilbert. Quand les représentations s'invitent dans la conservation de la biodiversité, la réserve naturelle marine de La Réunion face à la crise Requin. In : Joseph P. (dir.), Baillard K. (dir.) Biodiversités et gestion des territoires : de la connaissance des territoires à leur gestion maîtrisée au regard des différentes composantes biologiques. VertigO, 2017, 17 (3), art. no 18956 [38 p. en ligne] ISSN 1492-8442

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  3. Evanno L., Lachkar D., Lamali A., Boufridi A., Seon-Meniel B., Tintillier F., Saulnier D., Denis S., Genta-Jouve G., Jullian J. C., Leblanc K., Beniddir M. A., Petek Sylvain, Debitus Cécile, Poupon E. A ring-distortion strategy from marine natural product ilimaquinone leads to quorum sensing modulators. European Journal of Organic Chemistry, 2018, (20-21), p. 2486-2497. ISSN 1434-193X

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  4. Benavides M., Shoemaker K. M., Moisander P. H., Niggemann J., Dittmar T., Duhamel S., Grosso O., Pujo-Pay M., Helias-Nunige S., Fumenia A., Bonnet Sophie. Aphotic N-2 fixation along an oligotrophic to ultraoligotrophic transect in the western tropical South Pacific Ocean. Biogeosciences, 2018, 15 (9), p. 3107-3119. ISSN 1726-4170

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  5. Cotovicz L. C., Knoppers B. A., Brandini N., Poirier D., Santos S. J. C., Abril Gwenaël. Aragonite saturation state in a tropical coastal embayment dominated by phytoplankton blooms (Guanabara Bay - Brazil). Marine Pollution Bulletin, 2018, 129 (2), p. 729-739. ISSN 0025-326X

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  6. Lagarde R., Teichert N., Faivre L., Grondin H., Magalon H., Pirog A., Valade P., Ponton Dominique. Artificial daily fluctuations of river discharge affect the larval drift and survival of a tropical amphidromous goby. Ecology of Freshwater Fish, 2018, 27 (3), p. 646-659. ISSN 0906-6691

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  7. David F., Meziane T., Tran-Thi N. T., Van V. T., Nguyen T. N., Taillardat P., Marchand Cyril. Carbon biogeochemistry and CO2 emissions in a human impacted and mangrove dominated tropical estuary (Can Gio, Vietnam). Biogeochemistry, 2018, 138 (3), p. 261-275. ISSN 0168-2563

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  8. Gam Z. B., Thioye A., Cayol J. L., Joseph Manon, Fauque G., Labat Marc. Characterization of Desulfovibrio salinus sp. nov., a slightly halophilic sulfate-reducing bacterium isolated from a saline lake in Tunisia. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2018, 68 (3), p. 715-720. ISSN 1466-5026

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  9. Cossa D., Fanget A. S., Chiffoleau J. F., Bassetti M. A., Buscail R., Dennielou B., Briggs K., Arnaud M., Guédron Stéphane, Berne S. Chronology and sources of trace elements accumulation in the Rhone pro-delta sediments (Northwestern Mediterranean) during the last 400 years. In : Sempéré R. (ed.), Durrieu de Madron X. (ed.), Guieu C. (ed.), Pairaud I. (ed.) Special issue of MERMEX project : recent advances in the oceanography of the Mediterranean Sea. Progress in Oceanography, 2018, 163 (Special issue), p. 161-171. ISSN 0079-6611

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  10. Evangelista H., Sifeddine Abdelfettah, Correge T., Servain Jacques, Dassie E. P., Logato R., Cordeiro R. C., Shen C. C., Le Cornec Florence, Nogueira J., Segal B., Castagna A., Turcq Bruno. Climatic constraints on growth rate and geochemistry (Sr/Ca and U/Ca) of the coral Siderastrea stellata in the Southwest Equatorial Atlantic (Rocas Atoll, Brazil). Geochemistry Geophysics Geosystems, 2018, 19 (3), p. 772-786. ISSN 1525-2027

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  11. Selala M. S., Thenga H., Jewitt G. P. W., Chaplot Vincent. Comparison of the chemical quality of rainwater harvested from roof and surface run-off systems. Water SA, 2018, 44 (2), p. 223-231. ISSN 0378-4738

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  12. Nguyen T. H., Brochier Timothée, Auger Pierre, Trinh V. D., Brehmere P. Competition or cooperation in transboundary fish stocks management : insight from a dynamical model. Journal of Theoretical Biology, 2018, 447, p. 1-11. ISSN 0022-5193

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  13. Diankha O., Ba A., Brehmer Patrice, Brochier Timothée, Sow B. A., Thiaw M., Gaye A. T., Ngom F., Demarcq Hervé. Contrasted optimal environmental windows for both sardinella species in Senegalese waters. Fisheries Oceanography, 2018, 27 (4), p. 351-365. ISSN 1054-6006

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  14. Pailles C., Sylvestre Florence, Escobar J., Tonetto A., Rustig S., Mazur J. C. Cyclotella petenensis and Cyclotella cassandrae, two new fossil diatoms from Pleistocene sediments of Lake Peten-Itza, Guatemala, Central America. Phytotaxa, 2018, 351 (4), p. 247-263. ISSN 1179-3155

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  15. Moron V., Oueslati B., Pohl B., Janicot Serge. Daily weather types in february-june (1979-2016) and temperature variations in tropical North Africa. Journal of Applied Meteorology and Climatology, 2018, 57 (5), p. 1171-1195. ISSN 1558-8424

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  16. Pendleton L. H., Ahmadia G. N., Browman H. I., Thurstan R. H., Kaplan David, Bartolino V. Debating the effectiveness of marine protected areas : introduction. ICES Journal of Marine Science, 2018, 75 (3), p. 1156-1159. ISSN 1054-3139

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  17. Bodin Nathalie, Chassot Emmanuel, Sardenne Fany, Zudaire I., Grande M., Dhurmeea Z., Murua H., Barde Julien. Ecological data for western Indian Ocean tuna [Data Paper]. Ecology, 2018, 99 (5), p. 1245-1245. ISSN 0012-9658

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  18. Boussarie G., Bakker J., Wangensteen O. S., Mariani S., Bonnin L., Juhel J. B., Kiszka J. J., Kulbicki Michel, Manel S., Robbins W. D., Vigliola Laurent, Mouillot D. Environmental DNA illuminates the dark diversity of sharks. Science Advances, 2018, 4 (5), p. eaap9661 [8 p.]. ISSN 2375-2548

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  19. Masbou J., Sonke J. E., Amouroux D., Guillou G., Becker P. R., Point David. Hg-stable isotope variations in marine top predators of the Western Arctic Ocean. ACS Earth and Space Chemistry, 2018, 2 (5), p. 479-490. ISSN 2472-3452

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  20. Tchamabi C. C., Araujo M., Silva M., Bourlès Bernard, Travassos P. Ichthyoplankton transport around the Brazilian Fernando de Noronha archipelago and Rocas Atoll : are there any connectivity patterns ?. Indian Journal of Geo : Marine Sciences, 2018, 47 (4), p. 812-818. ISSN 0379-5136

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  21. Gerard E., De Goeyse S., Hugoni M., Agogue H., Richard L., Milesi V., Guyot F., Lecourt L., Borensztajn S., Joseph M. B., Leclerc T., Sarazin G., Jezequel D., Leboulanger Christophe, Ader M. Key role of Alphaproteobacteria and Cyanobacteria in the formation of stromatolites of lake Dziani Dzaha (Mayotte, Western Indian Ocean). Frontiers in Microbiology, 2018, 9, p. art. 796 [20 p.]. ISSN 1664-302X

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  22. Richon C., Dutay J. C., Dulac F., Wang R., Balkanski Y., Nabat P., Aumont Olivier, Desboeufs K., Laurent B., Guieu C., Raimbault P., Beuvier J. Modeling the impacts of atmospheric deposition of nitrogen and desert dust-derived phosphorus on nutrients and biological budgets of the Mediterranean Sea. Progress in Oceanography, 2018, 163 (Special issue), p. 21-39. ISSN 0079-6611

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  23. Butler R., Aucan Jerôme. Multisensor, microseismic observations of a hurricane transit near the ALOHA cabled observatory. Journal of Geophysical Research : Solid Earth, 2018, 123 (4), p. 3027-3046. ISSN 2169-9313

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  24. Haenen O., Bigarré L., Ito T., Avarre Jean-Christophe, Vendramin N. Neglected viral diseases in freshwater fish farming. Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 2018, 38 (3), p. 105-115. ISSN 0108-0288

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  25. Schmidt N., Thibault Delphine, Galgani F., Paluselli A., Sempere R. Occurrence of microplastics in surface waters of the Gulf of Lion (NW Mediterranean Sea). In : Sempéré R. (ed.), Durrieu de Madron X. (ed.), Guieu C. (ed.), Pairaud I. (ed.) Special issue of MERMEX project : recent advances in the oceanography of the Mediterranean Sea. Progress in Oceanography, 2018, 163 (SI), p. 214-220. ISSN 0079-6611

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  26. Nguyen H. T. M., Billen G., Garnier J., Le T. P. Q., Pham Q. L., Huon S., Rochelle Newall Emma. Organic carbon transfers in the subtropical Red River system (Viet Nam) : insights on CO2 sources and sinks. Biogeochemistry, 2018, 138 (3), p. 277-295. ISSN 0168-2563

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  27. Diankha O., Ba F., Sarr A., Diaw Diadhiou H., Diop M., Ndiaye S., Brehmer Patrice. Preliminary study of fish assemblage structure of the marine protected area of Cayar in Senegal. Journal of Marine Biology and Oceanography, 2018, 7 (1), 12 p. [en ligne] ISSN 2324-8661

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  28. Doria C. R. C., Duponchelle Fabrice, Lima M. A. L., Garcia A., Carvajal-Vallejos F. M., Mendez C. C., Catarino M. F., Freitas C. E. D., Vega B., Miranda-Chumacero G., Van Damme P. A. Review of fisheries resource use and status in the Madeira River Basin (Brazil, Bolivia, and Peru) before hydroelectric dam completion. Reviews in Fisheries Science and Aquaculture, 2018, 26 (4), p. 494-514. ISSN 2330-8249

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  29. Kantoussan J., Laë Raymond, Tine M. Review of the fisheries indicators for monitoring the impacts of fishing on fish communities. Reviews in Fisheries Science and Aquaculture, 2018, 26 (4), p. 460-478. ISSN 2330-8249

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  30. Zimmermann R. E., Ribolzi Olivier, Pierret Alain, Rattanavong S., Robinson M. T., Newton P. N., Davong V., Auda Y., Zopfi J., Dance D. A. B. Rivers as carriers and potential sentinels for Burkholderia pseudomallei in Laos. Scientific Reports - Nature, 2018, 8, p. art. 8674 [7p.]. ISSN 2045-2322

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  31. Salhi N., Triki H. Z., Molinero J. C., Laabir Mohamed, Sehli E., Bellaaj-Zouari A., Yahia N. D., Yahia O. K. D. Seasonal variability of picophytoplankton under contrasting environments in northern Tunisian coasts, southwestern Mediterranean Sea. Marine Pollution Bulletin, 2018, 129 (2), p. 866-874. ISSN 0025-326X

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  32. Teichert N., Tabouret H., Lagarde R., Grondin H., Ponton Dominique, Pecheyran C., Bareille G. Site fidelity and movements of an amphidromous goby revealed by otolith multi-elemental signatures along a tropical watershed. Ecology of Freshwater Fish, 2018, 27 (3), p. 834-846. ISSN 0906-6691

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  33. Cossa D., de Madron X. D., Schafer J., Guédron Stéphane, Marusczak N., Castelle S., Naudin J. J. Sources and exchanges of mercury in the waters of the Northwestern Mediterranean margin. In : Sempéré R. (ed.), Durrieu de Madron X. (ed.), Guieu C. (ed.), Pairaud I. (ed.) Special issue of MERMEX project : recent advances in the oceanography of the Mediterranean Sea. Progress in Oceanography, 2018, 163 (Special issue), p. 172-183. ISSN 0079-6611

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  34. Fourati R., Tedetti Marc, Guigue C., Goutx M., Garcia N., Zaghden H., Sayadi S., Elleuch B. Sources and spatial distribution of dissolved aliphatic and polycyclic aromatic hydrocarbons in surface coastal waters of the Gulf of Gabes (Tunisia, Southern Mediterranean Sea). In : Sempéré R. (ed.), Durrieu de Madron X. (ed.), Guieu C. (ed.), Pairaud I. (ed.) Special issue of MERMEX project : recent advances in the oceanography of the Mediterranean Sea. Progress in Oceanography, 2018, 163 (SI), p. 232-247. ISSN 0079-6611

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  35. Gatti C. M. I., Lonati D., Darius H. T., Zancan A., Roué Mélanie, Schicchi A., Locatelli C. A., Chinain M. Tectus niloticus (Tegulidae, Gastropod) as a novel vector of ciguatera poisoning : clinical characterization and follow-up of a mass poisoning event in Nuku Hiva Island (French Polynesia). Toxins, 2018, 10 (3), p. art. 102 [16 p.]. ISSN 2072-6651

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  36. Jacotot A., Marchand Cyril, Allenbach M. Tidal variability of CO2 and CH4 emissions from the water column within a Rhizophora mangrove forest (New Caledonia). Science of the Total Environment, 2018, 631-632, p. 334-340. ISSN 0048-9697

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  37. Tenorio M. M. B., Dupouy Cécile, Rodier Martine, Neveux J. Trichodesmium and other planktonic cyanobacteria in New Caledonian waters (SW tropical Pacific) during an El Nino episode. Aquatic Microbial Ecology, 2018, 81 (3), p. 219-241. ISSN 0948-3055

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  38. El-Demerdash A., Moriou C., Martin M. T., Petek Sylvain, Debitus Cécile, Al-Mourabit A. Unguiculins A-C : cytotoxic bis-guanidine alkaloids from the French Polynesian sponge, Monanchora n. sp.. Natural Product Research, 2018, 32 (13), p. 1512-1517. ISSN 1478-6419

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  39. Aime Joanne, Alenbach M., Bourgeois C., Leopold A., Jacotot A., Vinh T. V., Nho N. T., Della Patrona L., Marchand Cyril. Variability of CO2 emissions during the rearing cycle of a semi-intensive shrimp farm in a mangrove coastal zone (New Caledonia). Marine Pollution Bulletin, 2018, 129 (1), p. 194-206. ISSN 0025-326X

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  40. Cormier Salem Marie-Christine, Mbaye A. Les "terroirs" maritimes revisités : fin ou renouveau dans le contexte de la globalisation des mers et des littoraux ouest-africains ?. In : Artaud H. (dir.), Chlous F. (dir.), Garineaud C. (dir.), Reyes N. (dir.) Dossier "Anthropologie maritime". Revue d'Ethnoécologie, 2018, (13), art. no 3433 [24 p. en ligne] ISSN 2267-2419

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  41. Brient L., Ben Gamra N., Periot M., Roumagnac M., Zeller P., Bormans M., Méjaen A., Ploux O., Biegala Isabelle. Rapid characterization of microcystin-producing cyanobacteria in freshwaterlakes by TSA-FISH (Tyramid Signal Amplification-Fluorescent in Situ Hybridization). Frontiers in Environmental Science, 2017, 5, art. no 43 [7 p. ] ISSN 2296-665X

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  42. Mietton M., Gunnell Y., Nicoud G., Ferry Luc, Razafimahefa R., Grandjean P. 'Lake' Alaotra, Madagascar : a late Quaternary wetland regulated by the tectonic regime. Catena, 2018, 165, p. 22-41. ISSN 0341-8162

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  43. Mullon Christian, Mullon C. A constraint-based framework to study competition and cooperation in fishing. Fisheries Research, 2018, 203 (SI), p. 74-83. ISSN 0165-7836

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  44. Pianezze J., Barthe C., Bielli S., Tulet P., Jullien S., Cambon Gildas, Bousquet O., Claeys M., Cordier E. A new coupled ocean-waves-atmosphere model designed for tropical storm studies : example of tropical cyclone Bejisa (2013-2014) in the South-West Indian Ocean. Journal of Advances in Modeling Earth Systems, 2018, 10 (3), p. 801-825. ISSN 1942-2466

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  45. Ekins M., Debitus Cécile, Erpenbeck D., Hooper J. N. A. A new species of the sponge Raspailia (Raspaxilla) (Porifera : Demospongiae : Axinellida : Raspailiidae) from deep seamounts of the Western Pacific. Zootaxa, 2018, 4410 (2), p. 379-386. ISSN 1175-5326

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  46. Tittensor D. P., Eddy T. D., Lotze H. K., Galbraith E. D., Cheung W., Barange M., Blanchard J. L., Bopp L., Bryndum-Buchholz A., Buchner M., Bulman C., Carozza D. A., Christensen V., Coll Marta, Dunne J. P., Fernandes J. A., Fulton E. A., Hobday A. J., Huber V., Jennings S., Jones M., Lehodey P., Link J. S., Mackinson S., Maury Olivier, Niiranen S., Oliveros-Ramos R., Roy T., Schewe J., Shin Yunne-Jai, Silva T., Stock C. A., Steenbeek J., Underwood P. J., Volkholz J., Watson J. R., Walker N. D. A protocol for the intercomparison of marine fishery and ecosystem models : Fish-MIP v1.0. Geoscientific Model Development, 2018, 11 (4), p. 1421-1442. ISSN 1991-959X

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  47. Riekkola L., Zerbini A. N., Andrews O., Andrews-Goff V., Baker C. S., Chandler D., Childerhouse S., Clapham P., Dodemont R., Donnelly D., Friedlaender A., Gallego R., Garrigue Claire, Ivashchenko Y., Jarman S., Lindsay R., Pallin L., Robbins J., Steel D., Tremlett J., Vindenes S., Constantine R. Application of a multi-disciplinary approach to reveal population structure and Southern Ocean feeding grounds of humpback whales. Ecological Indicators, 2018, 89, p. 455-465. ISSN 1470-160X

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  48. Cornuault M., Tachikawa K., Vidal L., Guihou A., Siani G., Deschamps Pierre, Bassinot F., Revel M. Circulation changes in the Eastern Mediterranean sea over the past 23,000 years inferred from authigenic Nd isotopic ratios. Paleoceanography and Paleoclimatology, 2018, 33 (3), p. 264-280. ISSN 2572-4525

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  49. Goetze J. S., Claudet J., Januchowski-Hartley Fraser, Langlois T. J., Wilson S. K., White C., Weeks R., Jupiter S. D. Demonstrating multiple benefits from periodically harvested fisheries closures. Journal of Applied Ecology, 2018, 55 (3), p. 1102-1113. ISSN 0021-8901

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  50. Knapp A. N., McCabe K. M., Grosso O., Leblond N., Moutin T., Bonnet Sophie. Distribution and rates of nitrogen fixation in the western tropical South Pacific Ocean constrained by nitrogen isotope budgets. Biogeosciences, 2018, 15 (9), p. 2619-2628. ISSN 1726-4170

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  51. Van Wambeke F., Gimenez A., Duhamel S., Dupouy Cécile, Lefevre D., Pujo-Pay M., Moutin T. Dynamics and controls of heterotrophic prokaryotic production in the western tropical South Pacific Ocean : links with diazotrophic and photosynthetic activity. Biogeosciences, 2018, 15 (9), p. 2669-2689. ISSN 1726-4170

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  52. Yeh S. W., Cai W. J., Min S. K., McPhaden M. J., Dommenget D., Dewitte Boris, Collins M., Ashok K., An S. I., Yim B. Y., Kug J. S. ENSO atmospheric teleconnections and their response to greenhouse gas forcing. Reviews of Geophysics, 2018, 56 (1), p. 185-206. ISSN 8755-1209

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